Table 1 Primer Sequences Used in this Study
Forward | Reverse | PCR product | Annealing | Cycle No.a | |
|---|---|---|---|---|---|
Murine | |||||
TLR2 | 5′-TGGAGACGCCAGCTCTGGCTCA-3′ | 5′-CAGCTTAAAGGGCGGGTCAGAG-3′ | 380 bp | 60°C | 22 |
TLR3 | 5′-GGTGGTCCCGTTAATTTCCT-3′ | 5′-CAGGAGCATACTGGTGCTGA-3′ | 489 bp | 60°C | 22 |
TLR4 | 5′-AGTGGGTCAAGGAACAGAAGCA-3′ | 5′-CTTTACCAGCTCATTTCTCACC-3′ | 311 bp | 60°C | 23 |
TLR5 | 5′-TCTCTTGGAACTTCGGCTGT-3′ | 5′-AGAAGATAAAGCCGTGCGAA-3′ | 545 bp | 60°C | 27 |
TLR9 | 5′-GCAAGCTCAACCTGTCCTTC-3′ | 5′-CAGGCTAAGACACTGGAGGC-3′ | 503 bp | 57°C | 28 |
MyD88 | 5′-CACTCGCAGTTTGTTGGATG-3′ | 5′-CGCAGGATACTGGGAAAGTC-3′ | 597 bp | 60°C | 27 |
RP105 | 5′-GTCCCAGCAGAGGACCATTA-3′ | 5′-AGCCCAGCCCTAGGAACTAA-3′ | 399 bp | 57°C | 38 |
MD-1 | 5′-CAGTGTTCCAAGCAGATCCA-3′ | 5′-GCAGGCAAGGAGTAGCTTTG-3′ | 605 bp | 57°C | 38 |
MD-2 | 5′-GAAGCAACAGTGGTTCTGCAA-3′ | 5′-GCGGTGAATGATGGTGAAAT-3′ | 412 bp | 60°C | 22 |
CD14 | 5′-CTGATCTCAGCCCTCTGTCC-3′ | 5′-GCAAAGCCAGAGTTCCTGAC-3′ | 454 bp | 60°C | 22 |
TNF-alpha | 5′-GGCAGGTCTACTTTGGAGTCATTGC-3′ | 5′-ACATTCGAGGCTCCAGTGAATTCGG-3′ | 307 bp | 60°C | 22 |
beta-actin | 5′-GCTATGCTCTCCCTCACGCCAT-3′ | 5′-ACGCAGCTCAGTAACAGTCCGC-3′ | 648 bp | 60°C | 15 |
Human | |||||
TLR2 | 5′-GCCAAAGTCTTGATTGATTGG-3′ | 5′-TTGAAGTTCTCCAGCTCCTG-3′ | 347 bp | 55°C | 23 |
TLR3 | 5′-CCATTCCAGCCTCTTCGTAA-3′ | 5′-GGATGTTGGTATGGGTCTCG-3′ | 505 bp | 55°C | 23 |
TLR4 | 5′-TGGATACGTTTCCTTATAAG-3′ | 5′-GAAATGGAGGCACCCCTTC-3′ | 507 bp | 55°C | 28 |
TLR5 | 5′-GGAACCAGCTCCTAGCTCCT-3′ | 5′-GATGGCATCCTGGATATTGG-3′ | 575 bp | 55°C | 23 |
TLR9 | 5′-CGTGACAATTACCTGGCCTT-3′ | 5′-GTCCTGTGCAAAGATGCTGA-3′ | 435 bp | 55°C | 34 |
MyD88 | 5′-CCAACCTTCAGCAGTGACAA-3′ | 5′-GTGTGTATGCTGGTGCCTGT-3′ | 398 bp | 55°C | 23 |
RP105 | 5′-CCATGCTCAAGGGACTCTGT-3′ | 5′-GTTTGCAAGTGGGACAGGTT-3′ | 403 bp | 55°C | 34 |
MD-1 | 5′-GGGCCTGTCAATAATCCTGA-3′ | 5′-GGAGGCGACCAATTAGAGAA-3′ | 399 bp | 55°C | 34 |
MD-2 | 5′-TCCACCCTGTTTTCTTCCAT-3′ | 5′-GGGCTCCCAGAAATAGCTTC-3′ | 404 bp | 55°C | 24 |
CD14 | 5′-GGTTCCTGCTCAGCTACTGG-3′ | 5′-CTTGGCTGGCAGTCCTTTAG-3′ | 594 bp | 55°C | 27 |
TNF-alpha | 5′-GCTGTACCTCATCTACTCCCA-3′ | 5′-GCAATTTCTAGGTGAGGTCTTC-3′ | 660 bp | 55°C | 21 |
beta-actin | 5′-CAAGAGATGGCCACGGCTGCT-3′ | 5′-TCCTTCTGCATCCTGTCGGCA-3′ | 275 bp | 60°C | 18 |
