Table 2 Primer sequences and primer conditions
mRNA species (amplicon size) | Gene-specific primers (sense/antisense) (primer conc./annealing temperature) | External calibrator |
---|---|---|
HER3 365 bp | 5′-GGT GCT GGG CTT GCT TTT-3′ 5′-CGT GGC TGG AGT TGG TGT TA-3′ (5 pmol/65°C) | HEC |
HER4 265 bp | 5′-TGT GAG AAG ATG GAA GAT GGC-3′ 5′-GTT GTG GTA AAG TGG AAT GGC-3′ (5 pmol/65°C) | KLE |
HRG1α 179 bp | 5′-ATC CAC CAC TGG GAC A-3′ 5′-TTT GGA TCA TGG GCA-3′ (5 pmol/60°C) | KLE |
HRG1β 321 bp | 5′-TAG GAA ATG ACA GTG CCT C-3′ 5′-CGT AGT TTT GGC AGC GA-3′ (5 pmol/65°C) | KLE |
HRG2α 308 bp | 5′-AAA TAT GGC AAC GGC AG-3′ 5′-CGC AAA GGC AGT TTC T-3′ (5 pmol/60°C) | KLE |
HRG2β 236 bp | 5′-GCT TTA CGT CAA CAG CG-3′ 5′-CCG GTG TAT CCC ACA G-3′ (5 pmol/63°C) | HCV |
HRG3 256 bp | 5′-ACA GTG CAA GCG AAA AC-3′ 5′-CAC TAT GAT ATG AGG GCG-3′ (5 pmol/61°C) | KLE |
HRG4 107 bp | 5′-CTGTTGTCTGCGGTATTC-3′ 5′-TCATTCTTGGTCAAGAGAGT-3′ (5 pmol/61°C) | RT4 |
Beta-actin 313 | 5′-GGCGGCACCACCATGTACCCT-3′ 5′-AGGGGCCGGACTCGTCATACT-3′ (15 pmol/68°C) | KLE |