Table 2 Pairwise sequence divergence (adjusted for missing data, calculated as p-distance=number of substitutions/total number of nucleotides examined and expressed as percentage) between Austropotamobius haplotypes of the mtDNA 16S rRNA
Haplotype | A. italicus | A. pallipes | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
A1 | A2 | A3 | A4 | A6 | A7 | A8 | A9 | A10 | SW1 | SW2 | A13 | A14 | A28 | A15 | A16 | A17 | A18 | V1 | V2 | A19 | A20 | A11 | A12 | A5 | A21 | A22 | A23 | A24 | A26 | A25 | A27 | N2 | N3 | T | |
A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
A2 | 0.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
A3 | 0.2 | 0.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
A4 | 2.6 | 3.0 | 2.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
A6 | 1.9 | 1.4 | 1.6 | 4.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||
A7 | 1.6 | 1.2 | 1.4 | 3.7 | 0.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
A8 | 1.2 | 1.2 | 0.9 | 3.2 | 0.7 | 0.5 | |||||||||||||||||||||||||||||
A9 | 2.3 | 2.3 | 2.1 | 2.1 | 3.7 | 3.5 | 3.0 | ||||||||||||||||||||||||||||
A10 | 0.5 | 0.5 | 0.2 | 3.0 | 1.9 | 1.6 | 1.1 | 2.3 | |||||||||||||||||||||||||||
SW1 | 0.5 | 0.9 | 0.7 | 3.0 | 2.3 | 2.1 | 1.6 | 2.8 | 0.9 | ||||||||||||||||||||||||||
SW2 | 0.7 | 1.2 | 0.9 | 3.3 | 2.6 | 2.3 | 1.9 | 3.0 | 1.2 | 0.2 | |||||||||||||||||||||||||
A13 | 1.9 | 2.3 | 2.1 | 1.6 | 3.7 | 3.5 | 3.0 | 0.5 | 2.3 | 2.3 | 2.6 | ||||||||||||||||||||||||
A14 | 2.1 | 2.1 | 1.9 | 1.9 | 3.5 | 3.3 | 2.9 | 0.2 | 2.1 | 2.6 | 2.8 | 0.2 | |||||||||||||||||||||||
A28 | 3.0 | 3.0 | 2.8 | 2.8 | 4.4 | 4.2 | 3.7 | 1.6 | 3.0 | 3.5 | 3.7 | 1.6 | 1.4 | ||||||||||||||||||||||
A15 | 2.6 | 3.0 | 2.8 | 0.5 | 4.0 | 3.7 | 3.3 | 2.1 | 3.0 | 3.0 | 3.3 | 1.6 | 1.9 | 2.4 | |||||||||||||||||||||
A16 | 2.8 | 2.8 | 2.6 | 0.7 | 3.7 | 3.5 | 3.0 | 1.9 | 2.8 | 3.3 | 3.5 | 1.9 | 1.6 | 2.1 | 0.2 | ||||||||||||||||||||
A17 | 3.0 | 2.6 | 2.8 | 0.9 | 3.5 | 3.3 | 3.3 | 2.1 | 3.0 | 3.5 | 3.7 | 2.1 | 0.9 | 2.3 | 0.4 | 0.2 | |||||||||||||||||||
A18 | 3.3 | 3.3 | 3.0 | 0.7 | 3.7 | 3.5 | 3.0 | 2.3 | 3.3 | 3.7 | 4.0 | 2.3 | 2.1 | 2.6 | 0.7 | 0.5 | 0.7 | ||||||||||||||||||
V1 | 3.0 | 3.0 | 2.8 | 0.5 | 4.0 | 3.7 | 3.3 | 2.1 | 3.0 | 3.5 | 3.7 | 2.1 | 1.9 | 2.3 | 0.5 | 0.2 | 0.5 | 0.2 | |||||||||||||||||
V2 | 2.8 | 3.3 | 3.0 | 0.2 | 4.2 | 4.0 | 3.5 | 2.3 | 3.3 | 3.3 | 3.5 | 1.9 | 2.1 | 2.6 | 0.2 | 0.5 | 0.7 | 0.5 | 0.2 | ||||||||||||||||
A19 | 1.2 | 1.6 | 1.4 | 3.3 | 1.6 | 1.4 | 0.9 | 3.5 | 1.6 | 1.6 | 1.9 | 3.0 | 3.3 | 4.2 | 3.3 | 3.5 | 3.7 | 3.5 | 3.7 | 3.5 | |||||||||||||||
A20 | 0.9 | 0.9 | 0.7 | 3.0 | 0.9 | 0.7 | 0.2 | 2.8 | 0.9 | 1.4 | 1.6 | 2.8 | 2.6 | 3.5 | 3.0 | 2.8 | 3.0 | 2.8 | 3.0 | 3.3 | 0.7 | ||||||||||||||
A11 | 4.4 | 4.0 | 4.2 | 4.2 | 4.9 | 4.7 | 4.7 | 4.2 | 4.4 | 4.9 | 5.1 | 4.2 | 4.0 | 4.4 | 3.7 | 3.5 | 3.3 | 4.0 | 3.7 | 4.0 | 5.1 | 4.4 | |||||||||||||
A12 | 4.7 | 4.2 | 4.4 | 4.4 | 5.1 | 4.9 | 4.9 | 4.4 | 4.7 | 5.1 | 5.4 | 4.4 | 4.2 | 4.7 | 4.0 | 3.7 | 3.5 | 4.2 | 4.0 | 4.2 | 5.4 | 4.7 | 0.2 | ||||||||||||
A5 | 3.7 | 4.2 | 4.0 | 3.5 | 5.1 | 4.9 | 4.4 | 4.0 | 4.2 | 4.2 | 4.4 | 3.5 | 3.7 | 4.2 | 3.0 | 3.3 | 3.5 | 3.7 | 3.5 | 3.3 | 4.4 | 4.2 | 0.7 | 0.9 | |||||||||||
A21 | 4.4 | 4.9 | 4.7 | 4.2 | 5.8 | 5.6 | 5.1 | 4.7 | 4.9 | 4.9 | 5.1 | 4.2 | 4.4 | 4.9 | 3.7 | 4.0 | 4.2 | 4.4 | 4.2 | 4.0 | 5.1 | 4.9 | 1.4 | 1.2 | 0.7 | ||||||||||
A22 | 4.4 | 4.0 | 4.2 | 4.2 | 4.9 | 4.7 | 4.7 | 4.2 | 4.4 | 4.9 | 5.1 | 4.2 | 4.0 | 4.4 | 3.7 | 3.5 | 3.3 | 4.0 | 3.7 | 4.0 | 5.1 | 4.4 | 0.5 | 0.7 | 0.7 | 1.4 | |||||||||
A23 | 4.0 | 4.4 | 4.2 | 3.7 | 5.4 | 5.1 | 4.7 | 4.2 | 4.4 | 4.4 | 4.7 | 3.7 | 4.0 | 4.4 | 3.3 | 3.5 | 3.7 | 4.0 | 3.7 | 3.5 | 4.7 | 4.4 | 0.9 | 1.2 | 0.2 | 0.9 | 0.4 | ||||||||
A24 | 4.4 | 4.4 | 4.2 | 4.2 | 4.9 | 4.7 | 4.2 | 4.2 | 4.4 | 4.9 | 5.1 | 4.2 | 4.0 | 4.4 | 3.7 | 3.5 | 3.7 | 4.0 | 3.7 | 4.0 | 4.7 | 4.0 | 0.9 | 1.2 | 0.7 | 1.4 | 0.4 | 0.4 | |||||||
A26 | 4.0 | 4.0 | 3.7 | 3.7 | 4.9 | 4.7 | 4.2 | 3.3 | 4.0 | 4.4 | 4.7 | 3.3 | 3.0 | 4.0 | 3.3 | 3.0 | 3.3 | 3.5 | 3.5 | 3.3 | 3.5 | 4.7 | 4.0 | 0.9 | 1.2 | 0.7 | 0.9 | 0.9 | 0.9 | ||||||
A25 | 4.2 | 4.7 | 4.4 | 4.0 | 5.4 | 5.1 | 4.7 | 4.0 | 4.7 | 4.7 | 4.9 | 3.5 | 3.7 | 4.7 | 3.5 | 3.7 | 4.0 | 4.2 | 4.0 | 3.7 | 4.9 | 4.6 | 1.6 | 1.9 | 0.9 | 1.6 | 1.6 | 1.2 | 1.6 | 0.7 | |||||
A27 | 4.0 | 3.5 | 3.7 | 3.7 | 4.4 | 4.2 | 4.2 | 3.3 | 4.0 | 4.4 | 4.7 | 3.3 | 3.0 | 4.0 | 3.3 | 3.0 | 2.8 | 3.5 | 3.3 | 3.5 | 4.7 | 3.9 | 0.9 | 1.2 | 1.2 | 1.9 | 0.9 | 1.4 | 1.4 | 0.4 | 1.2 | ||||
N2 | 4.0 | 4.4 | 4.2 | 3.7 | 5.4 | 5.1 | 4.7 | 3.7 | 4.4 | 4.4 | 4.7 | 3.2 | 3.5 | 4.4 | 3.3 | 3.5 | 3.7 | 4.0 | 3.7 | 3.5 | 4.7 | 4.4 | 1.4 | 1.2 | 0.7 | 0.9 | 1.4 | 0.9 | 1.4 | 0.5 | 0.7 | 0.9 | |||
N3 | 4.2 | 4.2 | 4.0 | 4.0 | 5.1 | 4.9 | 4.4 | 3.5 | 4.2 | 4.7 | 4.9 | 3.5 | 3.3 | 4.2 | 3.5 | 3.3 | 3.5 | 3.7 | 3.5 | 3.7 | 4.9 | 4.2 | 1.2 | 0.9 | 0.9 | 1.2 | 1.2 | 1.2 | 1.2 | 0.2 | 0.9 | 0.7 | 0.2 | ||
T | 9.7 | 8.9 | 9.1 | 9.4 | 9.8 | 9.6 | 9.6 | 8.7 | 9.4 | 9.8 | 10.1 | 9.1 | 8.9 | 9.8 | 9.4 | 9.1 | 8.9 | 9.6 | 9.4 | 9.6 | 10.5 | 9.8 | 8.4 | 8.7 | 8.7 | 9.4 | 8.4 | 8.9 | 8.9 | 8.9 | 9.4 | 8.9 | 9.4 | 9.1 | |
