Table 2 Primer sequences used in the study
From: DGCR6 at the proximal part of the DiGeorge critical region is involved in conotruncal heart defects
Region a | Gene | Name | Sequence |
|---|---|---|---|
|  | PGK2 | PGK2–392f | 5′-CTGTTGCTGTTGAGCTCAAATCC-3′ |
|  |  | PGK2–445r | 5′-CCACTTCTGCGCCTACACAGTC-3′ |
|  | B2M | b2MG-142f | 5′-CAGGTTTACTCACGTCATCCAG-3′ |
|  |  | b2MG-194r | 5′-GGATGAAACCCAGACACATAGC-3′ |
|  | HPRT1 | HPRT1–305f | 5′-TGAACGTCTTGCTCGAGATGTG-3′ |
|  |  | HPRT1–344r | 5′-ACAGAGGGCTACAATGTGATGG-3′ |
1 | TUBA8 | TUBA8-g39100f | 5′-GAACATGTGCCCTGTGAAGTGC-3′ |
|  |  | TUBA8-g39145r | 5′-AAATGAGGCAGTCGGTGACCAC-3′ |
2 |  | USP18g-11849f | 5′-AGATGGTCCATCACTTACCGTG-3′ |
|  |  | USP18g-11898r | 5′-GTCAAGTCCCAGTGAACCCATC-3′ |
3 | USP18 | USP18g-26519f | 5′-ACTCGGAGCACCTGTTGACCC-3′ |
|  |  | USP18g-26569r | 5′-TAATCTCCTGAGGGCCGCTAAC-3′ |
4 |  | USP18g-41603f(m) | 5′-GAATGCGTGGGCTTTATGTGAAGA-3′ |
|  |  | USP18g-41733r(m) | 5′-GTGGGAACTCTGGAAGTCCTTC-3′ |
5 |  | TMEM191B-5up 1F(m) | 5′-CACCAAGGAACCTACTTCAAGGA-3′ |
|  |  | TMEM191B-5up 1R(m) | 5′-CACCACCTAGGCTGGCCTGT-3′ |
6 |  | DGCR6g-10000f | 5′-CTGGGTGCAGCCTGATGTTCTG-3′ |
|  |  | DGCR6g-10094r | 5′-AGAGAAACAGCTCTGCCGTGAGA-3′ |
7 |  | DGCR6g-12568f | 5′-GCCAGGTGTACAGGATGACTAGG-3′ |
|  |  | DGCR6g-12621r | 5′-TCCCTGTGATGCTGTGCTTCAG-3′ |
8 | DGCR6 (intron 3) | DGCR6g-18001f | 5′-GTGCTCCCCTGGAGTCCATTAG-3′ |
|  |  | DGCR6g-18077r | 5′-GCCCCATCACCCCACCATTGC-3′ |
9 | PRODH (exon 15) | PRODH-1837f | 5′-GTGTACAAGTACGTGCCCTATGG-3′ |
|  |  | PRODH-1900r | 5′-TCATGAGGCTGCTGTTCTCCAG-3′ |
10 | PRODH (exon 1) | PRODH-90f | 5′-TCCCCACCATGCAGCTGAAGTG-3′ |
|  |  | PRODH-136r | 5′-TTCCTGACAAATGCCAGACAAGG-3′ |
11 | DGCR9 | DGCR9–29f | 5′-CTCAAAGAGCCAAAGTCATCCTC-3′ |
|  |  | DGCR9–120r | 5′-CCATGCTGTTTTGGTTACCATGC-3′ |
12 | DGCR2 (exon 10) | DGCR2–1645f | 5′-ACGATGATGCTTTTGAGCCTGTG-3′ |
|  |  | DGCR2–1700r | 5′-CCGGAGTAATGCACCTTCACTC-3′ |