Table 1 Tetrapeptide substrates for PDF activity assays
From: Structure and function of a cyanophage-encoded peptide deformylase
Protein | Tetrapeptide | Source | Number of occurrences |
---|---|---|---|
D1 | |||
Genbank: | |||
GI:310003945 | fMLIS | Cyanophage S-SSM7 | |
GI:56686061 | fMTSI | Synechococcus elongatus PCC 6301 | |
GI:56685134, GI:56685615 | fMTTA | S. elongatus PCC 6301 | |
Ribosomal proteins | |||
GI:56750900 | fMAKK | S. elongatus PCC 6301 | 6 |
GI:56751081 | S. elongatus PCC 6301 | ||
GI:78213979 | S. sp. CC9605 | ||
GI:78212121 | S. sp. CC9605 | ||
GI:78185723 | S. sp. CC9902 | ||
GI:78185359 | S. sp. CC9902 | ||
GI:56751466 | fMSRV | S. elongatus PCC 6301 | 4 |
GI:113953218 | S. sp. CC9311 | ||
GI:78212935 | S. sp. CC9605 | ||
GI:78184654 | S. sp. CC9902 | ||
GI:56751895 | fMARI | S. elongatus PCC 6301 | 4 |
GI:113953764 | S. sp. CC9311 | ||
GI:78211907 | S. sp. CC9605 | ||
GI:78185543 | S. sp. CC9902 |