Table 2 Overview about the MLL recombinome 2017
# | Cytogenetic abnormality | Breakpoint | TPG | References | Leukemia type |
---|---|---|---|---|---|
A. MLL fusion in-frame | |||||
1 | t(1;11)(p32;q23) | 1p32 | EPS15/AF1P | Bernard et al. (1994) | ALL, BAL, AML, CML |
2 | t(1;11)(q21;q23) | 1q21 | MLLT11/AF1Q | Tse et al. (1995) | AML, t-AML, ALL, t-ALL, BAL |
3 | t(2;11)(p23.3;q23) | 2q23.3 | ASXL2 | Haferlach et al. (2016) | t-AML |
4 | ins(2;11)(q11.2;q23) | 2q11.2 | AFF3/LAF4 | von Bergh et al. (2003) | ALL |
5 | t(2;11)(q33;q23) | 2q33 | ABI2 | Coenen et al. (2012) | AML |
6 | t(2;11)(q37;q23) | 2q37 | SEPT2 | Cerveira et al. (2006) | t-AML, AML, t-MDS |
7 | t(2;11)(q37.1;q23) | 2q37.1 | GIGYF2 | Not published yet | ALL |
8 | t(3;11)(p21;q23) | 3p21 | NCKIPSD/AF3P21 | Sano et al. (2000) | t-AML |
9 | t(3;11)(p21.1;q23) | 3p21.1 | DCP1A | Meyer et al. (2008) | ALL, AML |
10 | t(3;11)(q13.13;q23) | 3q13.13 | KIAS1524 | Coenen et al. (2011) | AML |
11 | t(3;11)(q24;q23) | 3q24 | GMPS | Pegram et al. (2000) | t-AML, t-MDS |
12 | t(3;11)(q28;q23) | 3q28 | LPP | Daheron et al. (2001) | t-AML |
13 | t(4;11)(p14;q23) | 4p14 | PDS5A | Meyer et al. (2011) | t-AML, AML |
14 | t(4;11)(p11;q23) | 4p11 | FRYL | Hayette et al. (2006) | t-ALL, t-AML, t-MDS |
15 | t(4;11)(q21.1;q23) | 4q21.1 | SEPT11/FLJ10849 | Kojima et al. (2004) | T-ALL, CML, t-ALL, t-AML |
16 | t(4;11)(q21;q23) | 4q21 | AF4/AFF1 | Gu et al. (1992) | ALL, t-ALL, BAL, AML |
17 | t(4;11)(q35.1;q23) | 4q35.1 | SORBS2/ARGBP2 | Pession et al. (2006) | AML |
18 | t(5;11)(q12.1;q23) | 5q12.1 | KIF2A | Not published yet | ALL |
19 | complex abnormalities | 5q12.3 | CENPK/FKSG14 | Taki et al. (1996) | AML |
20 | t(5;11)(q23.2;q23) | 5q23.2 | PRRC1 | Douet-Guilbert et al. (2014) | t-ALL |
21 | ins(5;11)(q31;q13q23) | 5q31 | AFF4/AF5Q31 | Taki et al. (1999) | ALL |
22 | t(5;11)(q31;q23) | 5q31 | ARHGAP26/GRAF | Borkhardt et al. (2000) | JMML |
23 | t(6;11)(q13;q23) | 6q13 | SMAP1 | AML | |
24 | t(6;11)(q15;q23) | 6q15 | CASP8AP2 | Park et al. (2009) | AML |
25 | t(6;11)(q21;q23) | 6q21 | FOXO3/AF6Q21 | Hillion et al. (1997) | t-AML, t-ALL |
26 | t(6;11)(q27;q23) | 6q27 | MLLT4/AF6 | Prasad et al. (1993) | T-ALL, AML, t-AML, ALL |
27 | t(7;11)(p22.1;q23) | 7p22.1 | TNRC18/KIAS1856 | Meyer et al. (2008) | T-ALL, ALL |
28 | t(7;11)(q11.23;q23) | 7q11.23 | CLIP2 | Not published yet | B-ALL |
29 | t(7;11)(q21.12;q23) | 7q21.12 | RUNDC3B | T-ALL | |
30 | t(7;11)(q32.1;q23) | 7q32.1 | FLNC | Haferlach et al. (2016) | t-AML |
31 | t(9;11)(p13;q23) | 9p13 | CLTA | Not published yet | ALL |
32 | t(9;11)(p22;q23) | 9p22 | MLLT3/AF9 | Nakamura et al. (1993) | AML, t-AML, ALL, T-ALL, BAL |
33 | t(9;11)(q33.2;q23) | 9q33.2 | DAB2IP/AF9Q34 | von Bergh et al. (2004) | AML |
34 | t(9;11)(q34.11;q23) | 9q34.11 | RABGAP1 | Not published yet | ALL |
35 | ins(11;9)(q23;q34)inv(11)(q13)(q23) | 9q34 | FNBP1/FBP17 | Fuchs et al. (2001) | AML |
36 | t(9;11)(q34.12;q23) | 9q34.12 | LAMC3 | t-AML | |
37 | ins(10;11)(p12;q23) | 10p12 | NEBL | Cóser et al. (2010) | AML |
38 | ins(10;11)(p12;q23q13) | 10p12 | MLLT10/AF10 | Chaplin et al. (1995) | AML, t-AML, ALL, T-ALL, BAL |
39 | t(10;11)(p11.2;q23) | 10p11.2 | ABI1 | Taki et al. (1998) | AML |
40 | t(10;11)(q21;q23) | 10q21 | TET1/LCX | Ono et al. (2002) | AML, ALL |
41 | inv(11)(p15.3q23) | 11p15.3 | NRIP3 | AML | |
42 | inv(11)(q12.1q23) | 11q12.1 | BTBD18 | Alonso et al. (2012) | ALL |
43 | inv(11)(q12.2q23) | 11q12.2 | PRPF19 | ALL | |
44 | t(11;11)(q13.4;q23) | 11q13.4 | ARHGEF17 | Teuffel et al. (2005) | AML |
45 | inv(11)(q13.4q23) | 11q13.4 | C2CD3 | AML | |
46 | inv(11)(q14q23) | 11q14 | PICALM/CALM | Wechsler et al. (2003) | AML, ALL |
47 | inv(11)(q21q23) | 11q21 | MAML2 | T-ALL,t-T-ALL, t-AML, t-MDS | |
48 | del(11)(q23q23.3) | 11q23.3 | CBL | Fu et al. (2003) | AML, t-AML, ALL |
49 | del(11)(q23q23.3) | 11q23.3 | ARHGEF12/LARG | Kourlas et al. (2000) | AML, t-AML |
50 | del(11))(q23q24.2) | 11q24.2 | DCPS | AML | |
51 | t(11;12)(q23;p11.23) | 12p11.23 | ITPR2 | Haferlach et al. (2016) | t-MDS |
52 | t(11;12)(q23;q13.2) | 12q13.2 | SARNP/CIP29 | Hashii et al. (2004) | AML |
53 | t(11;14)(q23;q23.3) | 14q23.3 | GPHN | Kuwada et al. (2001) | AML, t-AML |
54 | t(11;14)(q23;q32.33) | 14q32.33 | CEP170B/KIAA0284 | Burmeister et al. (2008) | t-AML |
55 | t(11;15)(q23;q14) | 15q14 | KNL1/CASC5 | Hayette et al. (2000) | AML, t-MDS, ALL, |
56 | t(11;15)(q23;q15.1) | 15q15.1 | ZFYVE19/MPFYVE | Chinwalla et al. (2003) | AML |
57 | t(11;15)(q23;q21) | 15q21 | TCF12 | Not published yet | t-AML |
58 | t(11;15)(q23;q25.3) | 15q25.3 | AKAP13 | t-AML | |
59 | t(11;16)(q23;p13.3) | 16p13.3 | CREBBP/CBP | Taki et al. (1997) | t-MDS, t-AML, AML, t-ALL, t-CML |
60 | t(11;16)(q23;p13.11) | 16p13.11 | MYH11 | AML | |
61 | t(11;17)(q23;p13.1) | 17p13.1 | GAS7 | Megonigal et al. (2000) | t-AML |
62 | t(11;17)(q23;p11.2) | 17p11.2 | TOP3A | Herbaux et al. (2012) | AML |
63 | t(11;17)(q23;q12) | 17q12 | LASP1 | Strehl et al. (2003) | AML |
64 | ins(11;17)(q23;q21) | 17q21 | ACACA | AML | |
65 | t(11;17)(q23;q21) | 17q21 | MLLT6/AF17 | Prasad et al. (1994) | AML, ALL |
66 | t(11;17)(q23;q23.1) | 17q23.1 | CLTC | Not published yet | AML |
67 | t(11;17)(q23;q25) | 17q25 | SEPT9/AF17Q25 | Osaka et al. (1999) | t-AML, AML, MDS, ALL |
68 | t(11;18)(q23;q21) | 18q21 | ME2 | Szotkowski et al. (2015) | t-AML |
69 | t(11;19)(q23;p13.3) | 19p13.3 | MLLT1/ENL | Tkachuk et al. (1992) | ALL, T-ALL, AML, BAL, t-AL |
70 | t(11;19)(q23;p13.3) | 19p13.3 | ACER1/ASAH3 | Lo Nigro et al. (2002) | ALL |
71 | t(11;19)(q23;p13.3) | 19p13.3 | SH3GL1/EEN | So et al. (1997) | AML |
72 | ins(11;19)(q23;p13.3) | 19p13.3 | VAV1 | AML | |
73 | t(11;19)(q23;p13.2) | 19p13.2 | MYO1F | Lo Nigro et al. (2002) | AML |
74 | t(11;19)(q23;p13.1) | 19p13.1 | ELL | Thirman et al. (1994) | ALL, BAL, AML, t-AML |
75 | t(11;19)(q23;q13) | 19q13 | ACTN4 | Burmeister et al. (2009) | t-ALL, t-AML |
76 | t(11;20)(q23;q11.21) | 20q11.21 | MAPRE1 | Fu et al. (2005) | ALL |
77 | t(11;20)(q23;q13.2) | 20q13.2 | PFDN4 | Not published yet | T-ALL |
78 | t(11;22)(q23;q11.21) | 22q11.21 | SEPT5/CDCREL | Megonigal et al. (1998) | AML, T-ALL |
79 | t(11;22)(q23;q13) | 22q13 | MKL1 | Not published yet | ALL |
80 | t(11;22)(q23;q13.2) | 22q13.2 | EP300/P300 | Ida et al. (1997) | t-AML |
81 | t(X;11)(q13.1;q23) | Xq13.1 | FOXO4/AFX | Parry et al. (1994) | T-ALL, ALL, t-ALL,CLL, AML |
82 | ins(X;11)(q24;q23) | Xq24 | SEPT6 | Borkhardt et al. (2001) | AML |
83 | ins(X;11)(q26.3;q23) | Xq26.3 | CT45S2 | Cerveira et al. (2010) | BAL |
84 | ins(11;X)(q23q28q13.1) | Xq28 | FLNA | De Braekeleer et al. (2009) | AML |
B. MLL fusion not in-frame | |||||
1 | t(3;11)(p21.3;q23) | 3p21.3 | SACM1L | N/A | |
2 | t(3;11)(q21.3;q23) | 3q21.3 | EEFSEC/SELB | ALL | |
3 | t(6;11)(p22.3;q23) | 6p22.3 | NUP153 | Not published yet | ALL |
4 | inv(11)(p15.5q23) | 11p15.5 | AP2S2 | AML | |
5 | complex | 11q14 | NOX4 | Not published yet | ALL |
6 | t(11;15)(q23.3;q21) | 11q23.3 | LOC100131626 | MDS | |
7 | inv(11)(q23.3q23) | 11q23.3 | BUD13 | AML | |
8 | del(11)(q23q23.3) | 11q23.3 | CEP164 | t-ALL | |
9 | del(11)(q23q23.3) | 11q23.3 | BCL9L | ALL | |
10 | t(2;11;19)(p23.3;q23;p13.3) | 19p13.3 | LOC100128568 | AML | |
C. No partner gene fused to 5′-MLL gene | |||||
1 | t(1;11)(p13.1;q23) | 1p13.1 | PMF | ||
2 | t(6;11)(q27;q23) | 6q27 | Not published yet | AML | |
3 | t(9;11)(p13.3;q23) | 9p13.3 | t-ALL | ||
4 | t(11;11)(q23;q23.3) | 11q23.3 | ALL, AML | ||
5 | t(11;11)(q23;q24.3) | 11q24.3 | AML | ||
6 | t(11;21)(q23;q22) | 21q22 | t-ALL | ||
D. Not characterized at the molecular level (published by others) | |||||
1 | t(1;11)(p36;q23) | ||||
2 | t(1;11)(q31;q23) | ||||
3 | t(1;11)(q32;q23) | ||||
4 | t(2;11)(p21;q23) | ||||
5 | t(2;11)(q37;q23) | ||||
6 | t(3;11)(p13;q23) | ||||
7 | t(4;11)(p11;q23) | ||||
8 | t(6;11)(q13;q23) | ||||
9 | t(7;11)(p15;q23) | ||||
10 | t(7;11)(q22;q23) | ||||
11 | t(7;11)(q32;q23) | ||||
12 | t(8;11)(q11;q23) | ||||
13 | t(8;11)(q21;q23) | ||||
14 | t(8;11)(q24;q23) | ||||
15 | t(9;11)(p11;q23) | ||||
16 | t(9;11)(q33;q23) | ||||
17 | t(10;11)(q25;q23) | ||||
18 | t(11;11)(q11;q23) | ||||
19 | t(11;11)(q13;q23) | ||||
20 | t(11;11)(q21;q23) | ||||
21 | t(11;12)(q23;p13) | ||||
22 | t(11;12)(q23;q13) | ||||
23 | t(11;12)(q23;q24) | ||||
24 | t(4;13;11)(q21;q34;q23) | ||||
25 | t(11;14)(q23;q11) | ||||
26 | t(11;14)(q23;q32) | ||||
27 | t(11;15)q23;q15) | ||||
28 | t(11;17)(q23;q11) | ||||
29 | t(11;17)(q23;q23) | ||||
30 | t(11;18)(q23;q12) | ||||
31 | t(11;18)(q23;q23) | ||||
32 | t(11;20)(q23;q13) | ||||
33 | t(11;21)(q23;q11) | ||||
34 | t(Y;11)(p11;q23) | ||||
35 | t(X;11)(q22;q23) |