Table 2 Overview about the MLL recombinome 2017

From: The MLL recombinome of acute leukemias in 2017

#

Cytogenetic abnormality

Breakpoint

TPG

References

Leukemia type

A. MLL fusion in-frame

1

t(1;11)(p32;q23)

1p32

EPS15/AF1P

Bernard et al. (1994)

ALL, BAL, AML, CML

2

t(1;11)(q21;q23)

1q21

MLLT11/AF1Q

Tse et al. (1995)

AML, t-AML, ALL, t-ALL, BAL

3

t(2;11)(p23.3;q23)

2q23.3

ASXL2

Haferlach et al. (2016)

t-AML

4

ins(2;11)(q11.2;q23)

2q11.2

AFF3/LAF4

von Bergh et al. (2003)

ALL

5

t(2;11)(q33;q23)

2q33

ABI2

Coenen et al. (2012)

AML

6

t(2;11)(q37;q23)

2q37

SEPT2

Cerveira et al. (2006)

t-AML, AML, t-MDS

7

t(2;11)(q37.1;q23)

2q37.1

GIGYF2

Not published yet

ALL

8

t(3;11)(p21;q23)

3p21

NCKIPSD/AF3P21

Sano et al. (2000)

t-AML

9

t(3;11)(p21.1;q23)

3p21.1

DCP1A

Meyer et al. (2008)

ALL, AML

10

t(3;11)(q13.13;q23)

3q13.13

KIAS1524

Coenen et al. (2011)

AML

11

t(3;11)(q24;q23)

3q24

GMPS

Pegram et al. (2000)

t-AML, t-MDS

12

t(3;11)(q28;q23)

3q28

LPP

Daheron et al. (2001)

t-AML

13

t(4;11)(p14;q23)

4p14

PDS5A

Meyer et al. (2011)

t-AML, AML

14

t(4;11)(p11;q23)

4p11

FRYL

Hayette et al. (2006)

t-ALL, t-AML, t-MDS

15

t(4;11)(q21.1;q23)

4q21.1

SEPT11/FLJ10849

Kojima et al. (2004)

T-ALL, CML, t-ALL, t-AML

16

t(4;11)(q21;q23)

4q21

AF4/AFF1

Gu et al. (1992)

ALL, t-ALL, BAL, AML

17

t(4;11)(q35.1;q23)

4q35.1

SORBS2/ARGBP2

Pession et al. (2006)

AML

18

t(5;11)(q12.1;q23)

5q12.1

KIF2A

Not published yet

ALL

19

complex abnormalities

5q12.3

CENPK/FKSG14

Taki et al. (1996)

AML

20

t(5;11)(q23.2;q23)

5q23.2

PRRC1

Douet-Guilbert et al. (2014)

t-ALL

21

ins(5;11)(q31;q13q23)

5q31

AFF4/AF5Q31

Taki et al. (1999)

ALL

22

t(5;11)(q31;q23)

5q31

ARHGAP26/GRAF

Borkhardt et al. (2000)

JMML

23

t(6;11)(q13;q23)

6q13

SMAP1

13

AML

24

t(6;11)(q15;q23)

6q15

CASP8AP2

Park et al. (2009)

AML

25

t(6;11)(q21;q23)

6q21

FOXO3/AF6Q21

Hillion et al. (1997)

t-AML, t-ALL

26

t(6;11)(q27;q23)

6q27

MLLT4/AF6

Prasad et al. (1993)

T-ALL, AML, t-AML, ALL

27

t(7;11)(p22.1;q23)

7p22.1

TNRC18/KIAS1856

Meyer et al. (2008)

T-ALL, ALL

28

t(7;11)(q11.23;q23)

7q11.23

CLIP2

Not published yet

B-ALL

29

t(7;11)(q21.12;q23)

7q21.12

RUNDC3B

16

T-ALL

30

t(7;11)(q32.1;q23)

7q32.1

FLNC

Haferlach et al. (2016)

t-AML

31

t(9;11)(p13;q23)

9p13

CLTA

Not published yet

ALL

32

t(9;11)(p22;q23)

9p22

MLLT3/AF9

Nakamura et al. (1993)

AML, t-AML, ALL, T-ALL, BAL

33

t(9;11)(q33.2;q23)

9q33.2

DAB2IP/AF9Q34

von Bergh et al. (2004)

AML

34

t(9;11)(q34.11;q23)

9q34.11

RABGAP1

Not published yet

ALL

35

ins(11;9)(q23;q34)inv(11)(q13)(q23)

9q34

FNBP1/FBP17

Fuchs et al. (2001)

AML

36

t(9;11)(q34.12;q23)

9q34.12

LAMC3

15

t-AML

37

ins(10;11)(p12;q23)

10p12

NEBL

Cóser et al. (2010)

AML

38

ins(10;11)(p12;q23q13)

10p12

MLLT10/AF10

Chaplin et al. (1995)

AML, t-AML, ALL, T-ALL, BAL

39

t(10;11)(p11.2;q23)

10p11.2

ABI1

Taki et al. (1998)

AML

40

t(10;11)(q21;q23)

10q21

TET1/LCX

Ono et al. (2002)

AML, ALL

41

inv(11)(p15.3q23)

11p15.3

NRIP3

3

AML

42

inv(11)(q12.1q23)

11q12.1

BTBD18

Alonso et al. (2012)

ALL

43

inv(11)(q12.2q23)

11q12.2

PRPF19

16

ALL

44

t(11;11)(q13.4;q23)

11q13.4

ARHGEF17

Teuffel et al. (2005)

AML

45

inv(11)(q13.4q23)

11q13.4

C2CD3

15

AML

46

inv(11)(q14q23)

11q14

PICALM/CALM

Wechsler et al. (2003)

AML, ALL

47

inv(11)(q21q23)

11q21

MAML2

14

T-ALL,t-T-ALL, t-AML, t-MDS

48

del(11)(q23q23.3)

11q23.3

CBL

Fu et al. (2003)

AML, t-AML, ALL

49

del(11)(q23q23.3)

11q23.3

ARHGEF12/LARG

Kourlas et al. (2000)

AML, t-AML

50

del(11))(q23q24.2)

11q24.2

DCPS

13

AML

51

t(11;12)(q23;p11.23)

12p11.23

ITPR2

Haferlach et al. (2016)

t-MDS

52

t(11;12)(q23;q13.2)

12q13.2

SARNP/CIP29

Hashii et al. (2004)

AML

53

t(11;14)(q23;q23.3)

14q23.3

GPHN

Kuwada et al. (2001)

AML, t-AML

54

t(11;14)(q23;q32.33)

14q32.33

CEP170B/KIAA0284

Burmeister et al. (2008)

t-AML

55

t(11;15)(q23;q14)

15q14

KNL1/CASC5

Hayette et al. (2000)

AML, t-MDS, ALL,

56

t(11;15)(q23;q15.1)

15q15.1

ZFYVE19/MPFYVE

Chinwalla et al. (2003)

AML

57

t(11;15)(q23;q21)

15q21

TCF12

Not published yet

t-AML

58

t(11;15)(q23;q25.3)

15q25.3

AKAP13

16

t-AML

59

t(11;16)(q23;p13.3)

16p13.3

CREBBP/CBP

Taki et al. (1997)

t-MDS, t-AML, AML, t-ALL, t-CML

60

t(11;16)(q23;p13.11)

16p13.11

MYH11

16

AML

61

t(11;17)(q23;p13.1)

17p13.1

GAS7

Megonigal et al. (2000)

t-AML

62

t(11;17)(q23;p11.2)

17p11.2

TOP3A

Herbaux et al. (2012)

AML

63

t(11;17)(q23;q12)

17q12

LASP1

Strehl et al. (2003)

AML

64

ins(11;17)(q23;q21)

17q21

ACACA

13

AML

65

t(11;17)(q23;q21)

17q21

MLLT6/AF17

Prasad et al. (1994)

AML, ALL

66

t(11;17)(q23;q23.1)

17q23.1

CLTC

Not published yet

AML

67

t(11;17)(q23;q25)

17q25

SEPT9/AF17Q25

Osaka et al. (1999)

t-AML, AML, MDS, ALL

68

t(11;18)(q23;q21)

18q21

ME2

Szotkowski et al. (2015)

t-AML

69

t(11;19)(q23;p13.3)

19p13.3

MLLT1/ENL

Tkachuk et al. (1992)

ALL, T-ALL, AML, BAL, t-AL

70

t(11;19)(q23;p13.3)

19p13.3

ACER1/ASAH3

Lo Nigro et al. (2002)

ALL

71

t(11;19)(q23;p13.3)

19p13.3

SH3GL1/EEN

So et al. (1997)

AML

72

ins(11;19)(q23;p13.3)

19p13.3

VAV1

15

AML

73

t(11;19)(q23;p13.2)

19p13.2

MYO1F

Lo Nigro et al. (2002)

AML

74

t(11;19)(q23;p13.1)

19p13.1

ELL

Thirman et al. (1994)

ALL, BAL, AML, t-AML

75

t(11;19)(q23;q13)

19q13

ACTN4

Burmeister et al. (2009)

t-ALL, t-AML

76

t(11;20)(q23;q11.21)

20q11.21

MAPRE1

Fu et al. (2005)

ALL

77

t(11;20)(q23;q13.2)

20q13.2

PFDN4

Not published yet

T-ALL

78

t(11;22)(q23;q11.21)

22q11.21

SEPT5/CDCREL

Megonigal et al. (1998)

AML, T-ALL

79

t(11;22)(q23;q13)

22q13

MKL1

Not published yet

ALL

80

t(11;22)(q23;q13.2)

22q13.2

EP300/P300

Ida et al. (1997)

t-AML

81

t(X;11)(q13.1;q23)

Xq13.1

FOXO4/AFX

Parry et al. (1994)

T-ALL, ALL, t-ALL,CLL, AML

82

ins(X;11)(q24;q23)

Xq24

SEPT6

Borkhardt et al. (2001)

AML

83

ins(X;11)(q26.3;q23)

Xq26.3

CT45S2

Cerveira et al. (2010)

BAL

84

ins(11;X)(q23q28q13.1)

Xq28

FLNA

De Braekeleer et al. (2009)

AML

B. MLL fusion not in-frame

1

t(3;11)(p21.3;q23)

3p21.3

SACM1L

34

N/A

2

t(3;11)(q21.3;q23)

3q21.3

EEFSEC/SELB

13

ALL

3

t(6;11)(p22.3;q23)

6p22.3

NUP153

Not published yet

ALL

4

inv(11)(p15.5q23)

11p15.5

AP2S2

16

AML

5

complex

11q14

NOX4

Not published yet

ALL

6

t(11;15)(q23.3;q21)

11q23.3

LOC100131626

33

MDS

7

inv(11)(q23.3q23)

11q23.3

BUD13

16

AML

8

del(11)(q23q23.3)

11q23.3

CEP164

16

t-ALL

9

del(11)(q23q23.3)

11q23.3

BCL9L

14

ALL

10

t(2;11;19)(p23.3;q23;p13.3)

19p13.3

LOC100128568

15

AML

C. No partner gene fused to 5′-MLL gene

1

t(1;11)(p13.1;q23)

1p13.1

 

16

PMF

2

t(6;11)(q27;q23)

6q27

 

Not published yet

AML

3

t(9;11)(p13.3;q23)

9p13.3

 

16

t-ALL

4

t(11;11)(q23;q23.3)

11q23.3

 

16

ALL, AML

5

t(11;11)(q23;q24.3)

11q24.3

 

16

AML

6

t(11;21)(q23;q22)

21q22

 

16

t-ALL

D. Not characterized at the molecular level (published by others)

1

t(1;11)(p36;q23)

    

2

t(1;11)(q31;q23)

    

3

t(1;11)(q32;q23)

    

4

t(2;11)(p21;q23)

    

5

t(2;11)(q37;q23)

    

6

t(3;11)(p13;q23)

    

7

t(4;11)(p11;q23)

    

8

t(6;11)(q13;q23)

    

9

t(7;11)(p15;q23)

    

10

t(7;11)(q22;q23)

    

11

t(7;11)(q32;q23)

    

12

t(8;11)(q11;q23)

    

13

t(8;11)(q21;q23)

    

14

t(8;11)(q24;q23)

    

15

t(9;11)(p11;q23)

    

16

t(9;11)(q33;q23)

    

17

t(10;11)(q25;q23)

    

18

t(11;11)(q11;q23)

    

19

t(11;11)(q13;q23)

    

20

t(11;11)(q21;q23)

    

21

t(11;12)(q23;p13)

    

22

t(11;12)(q23;q13)

    

23

t(11;12)(q23;q24)

    

24

t(4;13;11)(q21;q34;q23)

    

25

t(11;14)(q23;q11)

    

26

t(11;14)(q23;q32)

    

27

t(11;15)q23;q15)

    

28

t(11;17)(q23;q11)

    

29

t(11;17)(q23;q23)

    

30

t(11;18)(q23;q12)

    

31

t(11;18)(q23;q23)

    

32

t(11;20)(q23;q13)

    

33

t(11;21)(q23;q11)

    

34

t(Y;11)(p11;q23)

    

35

t(X;11)(q22;q23)

    
  1. Abbreviations: AML, acute lymphoblastic leukemia; AML, acute myeloid leukemia; BAL, bilineal acute leukemia; CML, chronic myelogenous leukemia; DCAL, Diagnostic Center of Acute Leukemia; JMML, juvenile myelomonocytic leukemia; MLL, mixed lineage leukemia; t-ALL, therapy-related ALL; t-AML, therapy-related AML; t-MDS, therapy-related MDS; TPG, translocation partner gene.
  2. List of the cytogenetic localization of all yet-characterized direct TPGs (n=94), the gene name, the appropriate reference and observed disease type. Genes marked as ‘not published yet’ are completely new. All references in italics have been identified at the DCAL during the last decade. In addition, 6 cloned gene loci and 35 cytogenetic chromosome loci have been identified.