Table 1 Pairwise distances between full-length AviRTE consensus sequences.

AviRTE consensus from host	apaVit	araMac	bucRhi	calAnn	gymRuf	loaLoa	manVit	melUnd	mesUni	oreMel
Apaloderma vittatum
Aca macao	0.087
Buceros rhinoceros	0.078	0.055
Calypte anna	0.080	0.099	0.089
Gymnopithys rufigula	0.090	0.112	0.105	0.107
Loa loa	0.109	0.135	0.131	0.134	0.146
Manacus vitellinus	0.116	0.139	0.131	0.138	0.133	0.169
Melopsittacus undulatus	0.101	0.065	0.074	0.116	0.132	0.152	0.151
Mesitornis unicolor	0.035	0.091	0.084	0.084	0.090	0.114	0.118	0.108
Oreotrochilus melanogaster	0.076	0.094	0.086	0.009	0.104	0.129	0.135	0.114	0.081
Tinamus guttatus	0.047	0.086	0.077	0.081	0.088	0.103	0.117	0.102	0.051	0.078

Note that only full-length consensus sequences without 'N' residues were included in this analysis.

Quick links

Search