Table 2 List of the significantly mutated genes in DGC

From: Identification of genomic aberrations associated with lymph node metastasis in diffuse-type gastric cancer

Gene

CytoBand

Chr

Position

Ref

Alt

AA change

SIFT_score*

P-value**

CDH1

16q22.1

16

68846057

T

A

L343Q

0.02 (D)

3.30 × 10−6

  

16

68842401

A

T

R154S

0 (D)

 
  

16

68842731

G

C

E223Q

0.005 (D)

 
  

16

68844180

T

A

N256K

0.001 (D)

 
  

16

68847277

A

T

D400V

0 (D)

 
  

16

68844179

A

G

N256S

0.002 (D)

 

RHOA

3p21.31

3

49412922

T

A

Y34F

0 (D)

4.34 × 10−3

  

3

49412946

C

T

S26N

0.001 (D)

 

TP53

17p13.1

17

7578406

C

T

R175H

0 (D)

5.43 × 10−3

  

17

7578479

G

A

P151S

0.005 (D)

 
  

17

7577114

C

T

C275Y

0 (D)

 

CMTM2

16q21

16

66613601

G

A

G31S

0.783 (T)

6.05 × 10−3

  

16

66613531

G

T

K7N

0 (D)

 
  1. *D Deleterious (score ≤0.05), T tolerated (score >0.05)
  2. **P-value indicates statistical significance for significantly mutated genes identified by MutSigCV