Table 4 Distribution of well-known lactate-synthesis gene and two other functional genes in human gut microbiota

From: Discovery of potential genes contributing to the biosynthesis of short-chain fatty acids and lactate in gut microbiota from systematic investigation in E. coli

 

ldhA

mgsA

lldD

Acinetobacter radioresistens

Y

N

Y

Bacteroides caccae

Y

Y

Y

Bacteroides fragilis

Y

Y

Y

Bifidobacterium breve

N

N

Y

Bifidobacterium pseudocatenulatum

N

N

Y

Clostridium bolteae

N

Y

Y

Coprococcus catus

N

Y

Y

Desulfovibrio piger

N

N

Y

Enterobacter cancerogenus

Y

Y

Y

Enterococcus faecalis

N

Y

Y

Eubacterium hallii

N

Y

Y

Faecalibacterium prausnitzii

N

Y

Y

Fusobacterium ulcerans

Y

Y

Y

Helicobacter pylori

Y

N

Y

Lactobacillus acidophilus

Y

N

Y

Lactobacillus brevis

Y

N

Y

Lactobacillus rhamnosus

Y

N

Y

Megamonas hypermegale

N

Y

Y

Methanobrevibacter smithii

N

N

Y

Oxalobacter formigenes

N

N

N

Parvimonas micra

N

N

N

Providencia alcalifaciens

Y

Y

N

Ruminococcus sp.

Y

Y

Y

Ruminococcus torques

N

Y

Y

Weissella paramesenteroides

Y

N

Y

  1. Y: Existing annotated gene of the same name (gene name or enzyme name)
  2. N: Gene does not exist or the corresponding protein identity is below 10%