Table 2 Identification of cardiac-specific microRNAs in the sheep heart.
From: Identification of novel microRNAs in the sheep heart and their regulation in heart failure
miRNA_ID | Chr_ID | Strand | Start | End | Sequence | Counts* 100% | Counts* 70โ99% | Array | Cq |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
hsa-/mmu-miR-1a-3p, rno-miR-1b | NC_019480.2 | + | 34708115 | 34708136 | TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT | 1525891 | 566849 | 14.7 | 21.8 |
| ย | NC_019470.2 | โ | 53971898 | 53971919 | ย | ย | ย | ย | ย |
mmu-miR-1a-2-5p | NC_019480.2 | + | 34708076 | 34708098 | ACATACTTCTTTATGTACCCATA | 1 | 4472 | 9.9 | ย |
mmu-miR-1b-5p | NC_019470.2 | + | 53971899 | 53971919 | TACATACTTCTTTACATTCCA | 54503 | 557416 | 6.1 | ย |
| ย | NC_019480.2 | โ | 34708115 | 34708135 | ย | ย | ย | ย | ย |
oar-miR-133 (-3p) | NC_019470.2 | โ | 53961766 | 53961787 | TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT | 54412 | 145615 | ย | ย |
hsa-/mmu-/rno-miR-133a-3p | NC_019480.2 | + | 34711428 | 34711449 | TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTG | ย | 312 | 14.7 | 17.2 |
| ย | NC_019470.2 | โ | 53961767 | 53961788 | ย | ย | ย | ย | ย |
hsa-/rno-miR-133a-5p | NC_019480.2 | + | 34711391 | 34711412 | AGCTGGTAAAATGGAACCAAAT | 1893 | 1258 | 11.1 | ย |
| ย | NC_019470.2 | โ | 53961804 | 53961825 | ย | ย | ย | ย | ย |
mmu-miR-133a-5p | NC_019480.2 | + | 34711392 | 34711412 | GCTGGTAAAATGGAACCAAAT | 25 | 1241 | ย | 17.5 |
| ย | NC_019470.2 | โ | 53961804 | 53961824 | ย | ย | ย | ย | ย |
hsa-/mmu-/rno-miR-133b | NC_019477.2 | + | 24293671 | 24293692 | TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTA | ย | 315 | 15.1 | ย |
mmu-miR-133b-5p | NC_019477.2 | + | 24293634 | 24293655 | GCTGGTCAAACGGAACCAAGTC | ย | 11 | ย | ย |
hsa-/mmu-miR-208a-3p | NC_019464.2 | + | 21140684 | 21140705 | ATAAGACGAGCAAAAAGCTTGT | 41 | 122 | 6.7 | ย |
rno-miR-208a-3p | NC_019464.2 | + | 21140684 | 21140701 | ATAAGACGAGCAAAAAGC | 16 | 108 | 6.7 | ย |
hsa-/mmu-/rno-miR-208a-5p | NC_019464.2 | + | 21140649 | 21140670 | GAGCTTTTGGCCCGGGTTATAC | 1 | ย | 7.3 | ย |
hsa-/mmu-miR-208b-3p | NC_019464.2 | + | 21111702 | 21111723 | ATAAGACGAACAAAAGGTTTGT | 6099 | 7710 | 12.8 | 26.2 |
| ย | NW_014640758.1 | โ | 2651 | 2672 | ย | ย | ย | ย | ย |
mmu-miR-208b-5p | NC_019464.2 | + | 21111667 | 21111688 | AAGCTTTTTGCTCGCGTTATGT | 17 | 39 | 7.3 | ย |
| ย | NW_014640758.1 | โ | 2686 | 2707 | ย | ย | ย | ย | ย |
hsa-/rno-miR-499a-3p | NC_019470.2 | + | 63735196 | 63735217 | AACATCACAGCAAGTCTGTGCT | 375 | 1178 | 11.8 | 29.5 |
mmu-miR-499-3p | NC_019470.2 | + | 63735195 | 63735217 | GAACATCACAGCAAGTCTGTGCT | 11 | 1180 | ย | ย |
hsa-/mmu-/rno-miR-499a-5p | NC_019470.2 | + | 63735159 | 63735179 | TTAAGACTTGCAGTGATGTTT | 269451 | 160221 | 14.3 | 20.2 |
hsa-miR-499b-3p | NC_019470.2 | โ | 63735157 | 63735178 | AACATCACTGCAAGTCTTAACA | 259451 | 159579 | ย | ย |
hsa-miR-499b-5p | NC_019470.2 | โ | 63735194 | 63735214 | ACAGACTTGCTGTGATGTTCA | 13 | 1171 | 9.1 | ย |
