Table 2 Hydrogen bonds in the various structures (Å).
From: QM/MM study of the reaction mechanism of sulfite oxidase
Acc | Donor | MPD | MPH | MPO | |||||||||||
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R | TS1 | IM | TS2 | P | R | TS1 | IM | TS2 | P | R | TS1 | IM | P | ||
O1 | HH22 Arg190 | 1.59 | 1.76 | 1.75 | 1.78 | 1.78 | 1.63 | 1.77 | 1.81 | 1.85 | 1.81 | 1.63 | 1.77 | 1.81 | 1.81 |
HH22 Arg450 | 1.98 | 1.81 | 1.78 | 1.81 | 1.81 | ||||||||||
O2 | HH12 Arg190 | 1.57 | 1.83 | 1.81 | 1.74 | 1.76 | 1.62 | 1.78 | 1.94 | 1.77 | 1.77 | 1.62 | 1.78 | 1.93 | 1.77 |
HE1 Trp204 | 2.12 | 1.98 | 1.95 | 1.94 | 1.98 | 2.02 | 1.93 | 1.97 | 1.91 | 1.92 | 2.01 | 1.93 | 1.97 | 1.92 | |
O3 | HH21 Arg138 | 1.89 | 2.10 | 1.82 | 2.20 | 1.91 | 2.02 | 2.07 | 1.92 | 2.05 | 2.11 | ||||
HH Tyr322 | 1.66 | 2.50 | 1.68 | 2.46 | 2.45 | 1.68 | 2.47 | 2.45 | |||||||
HH12 Arg450 | 2.33 | 1.89 | 1.97 | 2.01 | 2.00 | ||||||||||
HH22 Arg450 | 1.87 | 1.86 | 1.95 | 1.92 | 1.88 | 1.91 | 1.93 | 1.91 | 1.87 | ||||||
H1 Wat | 1.80 | 1.90 | 1.83 | 1.69 | 1.68 | 1.84 | 1.92 | 1.92 | 1.68 | 1.68 | 1.85 | 1.93 | 1.91 | 1.69 | |
Oeq | HE Arg138 | 2.47 | 2.17 | 2.31 | 1.97 | 2.04 | 2.38 | 2.17 | 2.16 | 1.89 | 1.95 | 2.41 | 2.18 | 2.19 | 1.98 |
HH21 Arg138 | 2.45 | 1.91 | 2.18 | 2.05 | 2.04 | ||||||||||
HH Tyr322 | 2.40 | 1.59 | 1.69 | 1.63 | 1.65 | 2.39 | 1.63 | 1.71 | 1.63 | 1.64 | 2.38 | 1.62 | 1.71 | 1.64 |