Table 2 The median ratio between all groups (Torpor versus Normothermia, Arousal versus Normothermia and Arousal versus Torpor) was calculated for each genes and organs (N = Normothermia, T = Torpor, A = Arousal).

From: Gene expression profiling during hibernation in the European hamster

  

Per1

Bmal1

Rev-Erbα

Clock

Per2

MT1

MT2

GPR50

QR2

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Cerebral cortex

T vs N

1,54

0,81

0,81

0,75

1,24

1,23

0,83

2,09

1,04

A vs N

2,22

0,78

0,91

0,94

2,88

1,16

1,56

3,04

0,80

A vs T

1,44

0,96

1,11

1,25

2,31

0,95

1,87

1,45

0,76

Hypothalamus

T vs N

1,52

0,45

0,44

0,40

0,72

0,65

0,79

0,62

0,58

A vs N

2,54

0,51

0,48

0,63

1,94

0,72

1,60

0,89

0,42

A vs T

1,67

1,12

1,10

1,55

2,69

1,11

2,03

1,43

0,72

Pituitary gland

T vs N

3,48

1,22

1,38

0,86

2,42

0,68

0,91

0,61

0,86

A vs N

2,80

3,16

0,83

0,98

3,16

0,74

1,42

1,09

0,76

A vs T

0,80

2,59

0,60

1,14

1,31

1,08

1,56

1,79

0,88

Retina

T vs N

1,49

0,93

0,87

0,79

1,14

0,84

0,96

1,30

0,92

A vs N

1,87

1,49

0,96

1,01

2,69

0,80

2,30

1,74

0,61

A vs T

1,25

1,60

1,11

1,28

2,36

0,95

2,39

1,34

0,66

Liver

T vs N

2,74

1,51

1,02

0,92

3,13

0,50

0,28

0,46

1,04

A vs N

2,25

1,14

0,58

1,01

3,81

0,55

0,37

0,53

0,71

A vs T

0,82

0,75

0,57

1,10

1,22

1,10

1,31

1,13

0,68

BAT

T vs N

3,11

1,28

1,49

0,76

1,27

0,57

0,43

0,49

1,12

A vs N

2,67

1,06

1,12

1,07

3,23

0,39

0,37

0,68

0,83

A vs T

0,86

0,83

0,75

1,41

2,55

0,69

0,86

1,39

0,74

Heart

T vs N

3,72

1,08

1,08

0,88

2,04

1,25

0,63

1,05

1,19

A vs N

3,69

1,14

0,59

1,13

7,59

1,00

0,67

0,95

1,07

A vs T

0,99

1,06

0,54

1,29

3,72

0,79

1,06

0,90

0,90

Adrenal glands

T vs N

2,77

2,10

1,01

0,82

1,80

0,43

0,74

0,76

1,14

A vs N

3,16

2,02

1,03

1,18

3,97

0,56

0,83

1,08

0,99

A vs T

1,14

0,96

1,03

1,44

2,20

1,31

1,11

1,41

0,87

  

SIRT1

TXNIP

PPARα

PGC1α

FGF21

ObR

Dio2

Dio3

UCP1

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Median ratio

Cerebral cortex

T vs N

0,83

1,21

0,61

0,50

0,95

1,11

0,67

0,96

 

A vs N

1,09

0,79

1,09

0,77

1,33

1,11

0,55

0,87

 

A vs T

1,30

0,65

1,79

1,55

1,40

1,00

0,82

0,90

 

Hypothalamus

T vs N

0,49

0,68

0,27

0,29

0,64

1,04

0,50

0,89

 

A vs N

0,63

0,52

0,72

0,56

1,19

0,63

0,61

1,00

 

A vs T

1,30

0,76

2,73

1,91

1,84

0,61

1,23

1,13

 

Pituitary gland

T vs N

1,05

1,46

0,93

1,02

2,18

0,70

0,40

0,70

 

A vs N

1,14

0,81

1,22

1,04

3,02

0,71

0,55

1,03

 

A vs T

1,09

0,56

1,32

1,02

1,39

1,01

1,39

1,47

 

Retina

T vs N

0,84

1,42

0,37

0,62

2,18

0,73

0,53

0,67

 

A vs N

1,24

1,11

0,60

0,91

3,95

0,72

0,64

0,86

 

A vs T

1,47

0,78

1,62

1,46

1,81

0,99

1,21

1,29

 

Liver

T vs N

1,51

1,68

0,88

1,77

0,19

2,71

0,37

0,90

 

A vs N

1,31

1,44

0,67

2,41

2,16

2,21

0,54

1,00

 

A vs T

0,87

0,86

0,76

1,36

11,35

0,82

1,47

1,11

 

BAT

T vs N

0,87

0,93

0,71

0,81

0,60

0,93

0,30

0,82

1,10

A vs N

1,46

0,87

0,48

1,50

0,78

0,60

0,23

2,34

0,80

A vs T

1,69

0,93

0,68

1,85

1,29

0,65

0,76

2,84

0,72

Heart

T vs N

1,04

0,77

0,72

0,81

1,12

0,98

0,79

1,87

 

A vs N

1,17

0,40

0,80

0,73

0,90

0,69

0,37

2,11

 

A vs T

1,12

0,53

1,12

0,91

0,80

0,70

0,47

1,13

 

Adrenal glands

T vs N

0,94

0,71

0,80

0,58

0,46

0,63

0,16

0,99

 

A vs N

1,33

0,98

1,22

1,08

2,21

0,51

0,16

1,98

 

A vs T

1,41

1,38

1,52

1,84

4,75

0,81

1,00

2,00

 
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