Table 1 Primer sequences and the labeled fluorophores.
Primer name | Sequences | Fluorophores | Excitation Wavelength | Emission Wavelength |
|---|---|---|---|---|
Bt176-F | 5′-AAGCACGGTCAACTTCCGTAC-3′ | 5′ FAM | 470 nm | 522 nm |
Bt176-R | 5′-TCGACTTTATAGGAAGGGAGAGG-3′ |  |  |  |
GA21-F | 5′-CTTATCGTTATGCTATTTGCAACTTTAGA-3′ | 5′HEX | 505 nm | 556 nm |
GA21-R | 5′-TGGCTCGCGATCCTCCT-3′ |  |  |  |
NK603-F | 5′-CGGTACCAAGCTTTTATAATAGTAG-3′ | 5′ ROX | 550 nm | 602 nm |
NK603-R | 5′-CTAGTCTGTTATGGTTCGAG-3′ |  |  |  |
TC1507-F | 5′-GCCAGTTAGGCCAGTTACCCA-3′ | 5′ NED | 530 nm | 575 nm |
TC1507-R | 5′-CAAGATCAAGCGGAGTGAGG-3′ |  |  |  |
IVR-F | 5′-GTATCACAAGGGCTGGTACC-3′ | 5′ CY5 | 630 nm | 665 nm |
IVR-R | 5′-CCGTGTAGAGCATGACGATC-3′ |  |  |  |
Salmonella-F | 5′-TTGTGCCGAAGAGCCGGCGT-3′ | 5′ FAM | 470 nm | 522 nm |
Salmonella-R | 5′-TTGCGAATAACATCCTCAAC-3′ |  |  |  |
L. monocytogenes-F | 5′-GGTTTAGCTTGGGAATGGTG-3′ | 5′HEX | 505 nm | 556 nm |
L. monocytogenes-R | 5′-GATAAAGCGTAGTGCCCCAG-3′ |  |  |  |
E. coli-F | 5′-CGTCGTGTCTGCTAAAAC-3′ | 5′ ROX | 550 nm | 602 nm |
E. coli-R | 5′-GGTTGCTTGCGTTTGAGAC-3′ |  |  |  |
S. aureus-F | 5′-AAATCCAGCACAACAGGAAACGACACA-3′ | 5′ NED | 530 nm | 575 nm |
S. aureus-R | 5′-ATCTCCGGCCATAATTGGTGGCACT-3′ |  |  |  |
