Table 2 Classification and putative functions of R2R3-MYB transcription factors.

From: Mining MYB transcription factors from the genomes of orchids (Phalaenopsis and Dendrobium) and characterization of an orchid R2R3-MYB gene involved in water-soluble polysaccharide biosynthesis

Clade

D. officinale

P. equestris

A. thaliana

Functions in A. thaliana

References

C1 (AtMYB5)

DoMYB01

PeMYB42

AtMYB5

Testa mucilage synthesis

25

 

DoMYB06

PeMYB91

   
 

DoMYB42

PeMYB93

   
  

PeMYB95

   
 

DoMYB117

PeMYB104

AtMYB113

Anthocyanin biosynthesis

73

C2 (S6)

DoMYB74

PeMYB30

AtMYB114

Anthocyanin biosynthesis

73

 

DoMYB75

PeMYB37

AtMYB75

Cell wall thickening, testa, anthocyanin biosynthesis

70,71,– 72

 

DoMYB86

PeMYB54

AtMYB90

  
   

AtMYB0

  

C3 (S15)

  

AtMYB23

Trichome morphogenesis

75

   

AtMYB66

  

C4 (S5)

  

AtMYB123

  
 

DoMYB22

PeMYB40

AtMYB108

Stamen maturation

76

 

DoMYB96

PeMYB75

AtMYB112

Flavonoid biosynthesis

77

C5 (S20)

 

PeMYB86

AtMYB116

  
  

PeMYB87

AtMYB2

Phosphate-starvation responses

78

   

AtMYB62

Phosphate-starvation responses

79

   

AtMYB78

  

C6 (S19)

DoMYB44

PeMYB18

AtMYB21

  
 

DoMYB62

PeMYB70

AtMYB24

Stamen maturation

76

 

DoMYB108

PeMYB02

AtMYB121

  
 

DoMYB34

PeMYB27

AtMYB27

  
 

DoMYB53

PeMYB34

AtMYB48

  

C7 (S17)

DoMYB66

PeMYB41

AtMYB59

Root growth; cell cycle progression

80

 

DoMYB77

PeMYB44

AtMYB71

  
 

DoMYB91

PeMYB49

   
  

PeMYB94

   
 

DoMYB02

PeMYB01

AtMYB105

  
 

DoMYB111

PeMYB04

AtMYB110

  
 

DoMYB16

PeMYB26

AtMYB117

  
 

DoMYB26

PeMYB32

AtMYB52

Secondary cell wall biosynthesis

81

 

DoMYB27

PeMYB36

AtMYB54

Secondary cell wall biosynthesis

81

C8 (S21)

DoMYB31

PeMYB45

AtMYB56

  
 

DoMYB36

PeMYB48

AtMYB69

  
 

DoMYB45

PeMYB64

   
 

DoMYB52

PeMYB65

   
 

DoMYB64

PeMYB67

   
 

DoMYB88

PeMYB80

   
 

DoMYB97

PeMYB82

   
 

DoMYB98

PeMYB84

   

C9 (AtMYB124/AtMYB88)

DoMYB106

PeMYB29

AtMYB124

  
   

AtMYB88

  

C10 (AtMYB91)

DoMYB18

PeMYB57

AtMYB91

  
  

PeMYB105

   
  

PeMYB106

   

C11

 

PeMYB112

   
  

PeMYB115

   
  

PeMYB89

   
 

DoMYB03

PeMYB31

AtMYB44

Root development

82

 

DoMYB24

PeMYB38

AtMYB77

  

C12 (S22)

DoMYB30

PeMYB73

AtMYB70

  
 

DoMYB84

 

AtMYB73

  
 

DoMYB94

    
   

AtMYB1

Salt stress response

83

C13 (S23)

  

AtMYB109

  
   

AtMYB35

  

C14 (AtMYB125)

DoMYB114

PeMYB09

AtMYB125

  
 

DoMYB70

PeMYB88

AtMYB36

Root development

84

 

DoMYB109

PeMYB110

AtMYB100

  
 

DoMYB13

PeMYB28

AtMYB115

Benzoyloxy glucosinolate pathway

85

C15 (S25)

DoMYB15

PeMYB90

AtMYB118

Benzoyloxy glucosinolate pathway

86

 

DoMYB83

 

AtMYB119

Gametogenesis

86

 

DoMYB87

 

AtMYB22

  
   

AtMYB64

Gametogenesis

86

 

DoMYB107

PeMYB107

AtMYB101

Fertilization

87

 

DoMYB12

PeMYB114

AtMYB104

  
 

DoMYB25

PeMYB23

AtMYB120

Fertilization

87

C16 (S18)

DoMYB50

PeMYB59

AtMYB33

  
 

DoMYB55

 

AtMYB65

  
 

DoMYB72

 

AtMYB81

  
   

AtMYB97

Fertilization

87

C17

DoMYB73

PeMYB50

   
  

PeMYB83

   
 

DoMYB04

PeMYB05

AtMYB36

  
 

DoMYB11

PeMYB08

AtMYB37

  
 

DoMYB35

PeMYB102

AtMYB38

  
 

DoMYB38

PeMYB103

AtMYB68

  
 

DoMYB49

PeMYB12

AtMYB84

  

C18 (S14)

DoMYB56

PeMYB13

AtMYB87

Cell wall organization

88

 

DoMYB68

PeMYB46

   
 

DoMYB79

PeMYB51

   
 

DoMYB89

PeMYB53

   
 

DoMYB95

PeMYB66

   
  

PeMYB74

   
  

PeMYB76

   

C19 (AtMYB80/AtMYB35)

DoMYB102

PeMYB24

AtMYB80

  
 

DoMYB113

PeMYB69

AtMYB35

  
 

DoMYB19

    
 

DoMYB05

PeMYB33

AtMYB30

  
 

DoMYB37

PeMYB78

AtMYB31

  

C20 (S1)

DoMYB57

PeMYB97

AtMYB60

  
  

PeMYB98

AtMYB94

Cuticular wax biosynthesis

89

   

AtMYB96

Cuticular wax biosynthesis

89

 

DoMYB23

PeMYB15

AtMYB107

Suberin deposition

90

C21 (S10)

DoMYB47

PeMYB22

AtMYB39

  
 

DoMYB82

 

AtMYB9

Suberin deposition

90

 

DoMYB104

PeMYB79

AtMYB53

  

C22 (S24)

DoMYB61

 

AtMYB92

  
 

DoMYB76

 

AtMYB93

Root development

91

 

DoMYB39

PeMYB21

AtMYB102

  
 

DoMYB40

PeMYB99

AtMYB41

Osmotic stress responses

92

C23 (S11)

DoMYB41

 

AtMYB74

Salt stress responses

93

 

DoMYB51

    
 

DoMYB58

    
 

DoMYB32

PeMYB25

AtMYB106

  

C24 (S9)

DoMYB60

PeMYB52

AtMYB16

Cuticle formation

94

 

DoMYB69

PeMYB56

AtMYB17

  
 

DoMYB100

PeMYB06

AtMYB122

  

C25 (S12)

DoMYB43

 

AtMYB51

  
   

AtMYB34

  
   

AtMYB29

  
   

AtMYB76

  
 

DoMYB10

PeMYB03

AtMYB13

  
 

DoMYB28

PeMYB109

AtMYB14

Testa polymer biosynthesis

25

C26 (S2)

DoMYB54

PeMYB47

AtMYB15

  
 

DoMYB71

    
 

DoMYB78

    
 

DoMYB99

    
 

DoMYB46

PeMYB14

AtMYB58

Secondary cell wall biosynthesis

95

C27 (S3)

DoMYB92

PeMYB19

AtMYB63

Secondary cell wall biosynthesis

95

  

PeMYB85

   
 

DoMYB116

PeMYB113

AtMYB11

Flavonoid biosynthesis

96

G28 (S7)

DoMYB59

PeMYB43

AtMYB111

Flavonoid biosynthesis

96

  

PeMYB68

AtMYB12

Flavonoid biosynthesis

96

C29 (AtMYB47/AtMYB95)

DoMYB20

PeMYB63

AtMYB47

  
   

AtMYB95

  
 

DoMYB07

PeMYB17

AtMYB20

  
 

DoMYB103

PeMYB20

AtMYB40

Secondary cell wall biosynthesis

81

C30 (S8)

DoMYB67

PeMYB62

AtMYB42

Secondary cell wall biosynthesis

81

  

PeMYB96

AtMYB43

Secondary cell wall biosynthesis

81

   

AtMYB85

Secondary cell wall biosynthesis

81

   

AtMYB99

  
 

DoMYB21

PeMYB07

AtMYB3

Phenylpropanoid biosynthesis

97

 

DoMYB33

PeMYB35

AtMYB32

  

C31 (S4)

DoMYB48

PeMYB39

AtMYB4

  
 

DoMYB80

PeMYB58

AtMYB7

  
 

DoMYB85

PeMYB60

   
 

DoMYB93

    
 

DoMYB08

 

AtMYB18

  

C32 (S16)

  

AtMYB19

  
   

AtMYB45

  
 

DoMYB09

PeMYB100

AtMYB50

  
 

DoMYB110

PeMYB101

AtMYB55

  
 

DoMYB112

PeMYB108

AtMYB61

Testa mucilage synthesis

26, 98

 

DoMYB115

PeMYB11

AtMYB86

  

C33 (S13)

DoMYB14

PeMYB111

   
 

DoMYB29

PeMYB55

   
 

DoMYB65

PeMYB71

   
 

DoMYB81

PeMYB77

   
  

PeMYB81

   

C34 (AtMYB26/AtMYB67/AtMYB103)

DoMYB105

PeMYB16

AtMYB26

Secondary cell wall thickening

99

 

DoMYB63

PeMYB61

AtMYB67

  
 

DoMYB90

PeMYB72

AtMYB103

Lignin biosynthesis; secondary cell wall thickening

100

  

PeMYB92

   

C35 (AtMYB46/AtMYB83)

DoMYB17

PeMYB10

AtMYB46

Secondary wall biosynthesis

69, 101

   

AtMYB83

Secondary wall biosynthesis

69