Table 3 Allele frequencies of 124 microhaplotypes in the Chinese Han population (N = 256).

From: A 124-plex Microhaplotype Panel Based on Next-generation Sequencing Developed for Forensic Applications

Genot	Count	Fre	Genot	Count	Fre	Genot	Count	Fre	Genot	Count	Fre
mh01KK-002			mh01KK-070			mh01KK-072			mh01KK-106
AA	323	0.6333	AG	97	0.1895	CG	351	0.6937	CAAG	1	0.0022
AG	120	0.2353	AT	415	0.8105	TC	155	0.3063	CAGA	251	0.5553
GA	19	0.0373	mh01KK-205			mh01KK-210			CAGG	68	0.1504
GG	48	0.0941	CCAG	130	0.2632	CC	82	0.1660	CGAG	5	0.0111
mh01KK-117			TCAG	87	0.1761	TC	143	0.2895	TAGG	127	0.2810
AACC	193	0.3955	TTAA	74	0.1498	TT	269	0.5445	mh01KK-211
AACT	84	0.1721	TTAG	66	0.1336	mh02KK-073			ACT	30	0.0673
AAGC	12	0.0246	TTGG	137	0.2773	GC	358	0.7075	ATC	193	0.4327
AAGT	6	0.0123	mh02KK-005			GT	105	0.2075	ATT	127	0.2848
AGCC	54	0.1107	AG	195	0.3916	TC	2	0.0040	GCC	3	0.0067
AGCT	15	0.0307	GA	174	0.3494	TT	41	0.0810	GTC	93	0.2085
AGGC	3	0.0061	GG	129	0.2590	mh02KK-201			mh02KK-102
CACC	83	0.1701	mh02KK-136			GA	14	0.0287	GAC	11	0.0259
CACT	5	0.0102	GTA	4	0.0116	GG	22	0.0451	GGT	409	0.9646
CAGC	15	0.0307	GTC	5	0.0145	TA	452	0.9262	TGC	4	0.0094
CAGT	1	0.0020	TCA	11	0.0320	mh03KK-007			mh02KK-202
CGCC	8	0.0164	TCC	185	0.5378	CC	184	0.3622	CA	253	0.4961
CGCT	9	0.0184	TTC	139	0.4041	TC	183	0.3602	CC	1	0.0020
mh02KK-003			mh03KK-006			TT	141	0.2776	GA	256	0.5020
GCC	2	0.0039	AA	288	0.5692	mh03KK-150			mh03KK-008
GTC	18	0.0353	AG	169	0.3340	AACA	162	0.3476	CG	1	0.0020
TCC	396	0.7765	TA	49	0.0968	GACC	191	0.4099	CT	21	0.0427
TTC	48	0.0941	mh03KK-009			GGCC	113	0.2425	TG	258	0.5244
TTT	46	0.0902	CC	19	0.0373	mh04KK-010			TT	212	0.4309
mh02KK-134			TC	144	0.2824	AA	292	0.5703	mh04KK-011
ACCG	23	0.0456	TT	347	0.6804	AG	166	0.3242	AC	215	0.4674
ACTA	3	0.0060	mh04KK-013			GA	47	0.0918	AT	118	0.2565
ACTG	25	0.0496	AAGAT	48	0.0964	GG	7	0.0137	GT	127	0.2761
ATCA	19	0.0377	CAGAT	61	0.1225	mh04KK-015			mh04KK-016
ATCG	234	0.4643	CAGGT	3	0.0060	AC	339	0.6673	CC	60	0.1172
ATTA	56	0.1111	CGAAT	2	0.0040	AT	112	0.2205	TC	116	0.2266
ATTG	56	0.1111	CGGAC	27	0.0542	TT	57	0.1122	TT	336	0.6563
TCTA	1	0.0020	CGGAT	64	0.1285	mh04KK-017			mh04KK-029
TCTG	11	0.0218	CGGGT	293	0.5884	ACA	25	0.0912	TC	422	0.8242
TTCG	7	0.0139	mh04KK-021			GCA	18	0.0657	TT	90	0.1758
TTTG	69	0.1369	AG	160	0.3226	GCG	185	0.6752	mh05KK-023
mh02KK-213			GA	162	0.3266	GTA	46	0.1679	GCG	26	0.0544
CAT	29	0.0566	GG	174	0.3508	mh04KK-028			TCG	297	0.6213
CGT	156	0.3047	mh05KK-022			CA	2	0.0039	TTG	140	0.2929
TGC	17	0.0332	CA	259	0.5078	CC	156	0.3047	TTT	15	0.0314
TGT	310	0.6055	CC	152	0.2980	TC	354	0.6914	mh05KK-062
mh04KK-019			TC	99	0.1941	mh05KK-170			AA	136	0.2677
AA	226	0.4431	mh05KK-079			CAAA	49	0.0984	AC	248	0.4882
AG	262	0.5137	CC	275	0.5413	CAAG	50	0.1004	TA	124	0.2441
GA	22	0.0431	CT	233	0.4587	CAGA	12	0.0241	mh06KK-025
mh04KK-074			mh06KK-080			CAGG	14	0.0281	AGG	43	0.1503
AC	1	0.0020	AG	8	0.0158	CGAA	63	0.1265	GGG	243	0.8497
AT	446	0.8745	CG	498	0.9842	CGAG	60	0.1205	mh07KK-030
GT	63	0.1235	mh07KK-081			CGGA	35	0.0703	ACC	159	0.6023
mh05KK-078			-C	3	0.0059	CGGG	16	0.0321	GAC	52	0.1970
GA	81	0.1582	-T	509	0.9941	TAAA	74	0.1486	GCC	53	0.2008
GG	431	0.8418	mh09KK-034			TAAG	123	0.2470	mh08KK-032
mh06KK-026			AA	14	0.0276	TAGG	1	0.0020	CG	67	0.1683
ACG	1	0.0020	GA	108	0.2126	TGAA	1	0.0020	TA	39	0.0980
ATG	17	0.0335	GG	386	0.7598	mh06KK-101			TG	292	0.7337
GCA	12	0.0236	mh09KK-153			AA	413	0.8381	mh09KK-152
GCG	461	0.9075	CAA	23	0.0477	GA	1	0.0020	AGCA	97	0.1964
GTG	17	0.0335	CAC	31	0.0643	GG	79	0.1599	ATCG	1	0.0020
mh07KK-031			CGA	5	0.0104	mh07KK-082			ATTA	31	0.0628
CA	269	0.5316	TAA	191	0.3963	TC	198	0.3898	ATTG	267	0.5405
CG	98	0.1937	TAC	116	0.2407	TG	310	0.6102	GTCG	98	0.1984
TG	139	0.2747	TGA	87	0.1805				mh10KK-083
mh09KK-033			TGC	29	0.0602	mh09KK-035			GC	41	0.0807
ACG	164	0.3241	mh09KK-157			CG	157	0.3257	TC	467	0.9193
GCG	181	0.3577	ACCAT	15	0.0305	CT	195	0.4046	mh10KK-088
GCT	8	0.0158	ACTAT	45	0.0915	TG	130	0.2697	GC	355	0.9492
GTG	153	0.3024	GCCAC	239	0.4858	mh10KK-087			GT	19	0.0508
mh10KK-084			GCCCC	2	0.0041	AG	351	0.6964	mh11KK-038
TG	512	1.0000	GCCCT	139	0.2825	GA	153	0.3036	CG	236	0.5388
mh10KK-085			GTCAC	52	0.1057	mh11KK-037			TA	18	0.0411
CC	254	0.4961	mh10KK-086			ACG	202	0.4040	TG	184	0.4201
CT	258	0.5039	GA	302	0.5945	GCG	208	0.4160	mh11KK-089
mh10KK-101			GC	149	0.2933	GTG	90	0.1800	AT	264	0.5156
AG	181	0.3620	TA	57	0.1122	mh11KK-041			CG	219	0.4277
CA	80	0.1600	mh11KK-036			AG	45	0.0893	CT	29	0.0566
CG	239	0.4780	AA	150	0.2941	GA	282	0.5595	mh11KK-187
mh11KK-039			AG	155	0.3039	GG	177	0.3512	CCCA	226	0.4575
GG	36	0.0706	CG	205	0.4020	mh11KK-180			CCCG	6	0.0121
GT	221	0.4333	mh11KK-040			AACC	3	0.0066	GCCG	3	0.0061
TT	253	0.4961	AC	308	0.8324	AACG	1	0.0022	GCGA	2	0.0040
mh11KK-090			CG	62	0.1676	AATC	38	0.0830	GCGG	133	0.2692
AC	331	0.6490	mh11KK-091			AATG	1	0.0022	GTCA	1	0.0020
GT	179	0.3510	-C	78	0.1535	ACCC	200	0.4367	GTGG	123	0.2490
mh11KK-191			-T	430	0.8465	ACCG	13	0.0284	mh12KK-046
CAGT	103	0.2239	mh12KK-043			ACTC	54	0.1179	GA	144	0.2824
CGAT	65	0.1413	CCG	47	0.0925	ACTG	11	0.0240	GG	130	0.2549
TAAC	86	0.1870	CTA	251	0.4941	GCCC	5	0.0109	TA	133	0.2608
TAAT	204	0.4435	CTG	209	0.4114	GCCG	128	0.2795	TG	103	0.2020
TGAT	2	0.0043	TCG	1	0.0020	GCTC	3	0.0066	mh13KK-047
mh12KK-092			mh12KK-093			GCTG	1	0.0022	CC	103	0.2146
CT	183	0.3735	AT	402	0.7882	mh12KK-045			CT	73	0.1521
TC	307	0.6265	TA	108	0.2118	CT	35	0.0694	TC	15	0.0313
mh13KK-213			mh13KK-217			TC	394	0.7817	TT	289	0.6021
CCA	97	0.3255	AACA	6	0.0121	TT	75	0.1488	mh13KK-223
CCG	54	0.1812	AACG	26	0.0526	mh12KK-202			CCCT	79	0.1561
TAG	51	0.1711	AATA	1	0.0020	AACT	97	0.1972	CGCC	1	0.0020
TCA	83	0.2785	AATG	178	0.3603	AATC	181	0.3679	CGCT	104	0.2055
TCG	13	0.0436	AGCA	61	0.1235	AGTT	92	0.1870	CGTC	139	0.2747
mh13KK-218			AGCG	66	0.1336	CATC	2	0.0041	CGTT	100	0.1976
CCCC	8	0.0161	AGTG	80	0.1619	CATT	119	0.2419	TCCT	16	0.0316
CCCT	20	0.0403	GATG	1	0.0020	CGTT	1	0.0020	TGCT	67	0.1324
CTCC	47	0.0948	GGCA	2	0.0040	mh14KK-048			mh14KK-068
CTCT	61	0.1230	GGCG	67	0.1356	AC	7	0.0152	AC	183	0.3574
CTTC	95	0.1915	GGTG	6	0.0121	AT	273	0.5935	AT	286	0.5586
CTTT	48	0.0968	mh13KK-226			GC	37	0.0804	CC	43	0.0840
TCCC	2	0.0040	CA	10	0.0207	GT	143	0.3109	mh15KK-067
TCCT	4	0.0081	CG	138	0.2851	mh15KK-066			GC	230	0.4563
TTCC	18	0.0363	TA	336	0.6942	AG	202	0.4139	GT	88	0.1746
TTCT	73	0.1472	mh14KK-101			AT	62	0.1270	TC	176	0.3492
TTTC	22	0.0444	AT	71	0.1530	CG	115	0.2357	TT	10	0.0198
TTTT	98	0.1976	GC	13	0.0280	CT	109	0.2234	mh16KK-255
mh13KK-225			GT	380	0.8190	mh16KK-096			ACCG	38	0.0769
AAG	65	0.1280	mh15KK-095			CA	328	0.6457	ACTA	1	0.0020
ACG	200	0.3937	CA	260	0.5078	CG	179	0.3524	ACTG	155	0.3138
GAA	103	0.2028	TA	221	0.4316	TG	1	0.0020	GACA	173	0.3502
GAG	133	0.2618	TG	31	0.0605	mh16KK-302			GATA	17	0.0344
GCG	7	0.0138	mh16KK-049			ACTT	62	0.1225	GCCA	4	0.0081
mh15KK-104			AAAAG	150	0.3036	GCTC	99	0.1957	GCCG	39	0.0789
CAG	8	0.0158	ACAAA	43	0.0870	GCTT	81	0.1601	GCTG	67	0.1356
TAA	8	0.0158	ACAAG	5	0.0101	GTAT	188	0.3715	mh17KK-054
TAG	54	0.1067	ACAGA	12	0.0243	GTTT	76	0.1502	AA	183	0.4816
TCG	436	0.8617	ACGGA	211	0.4271	mh17KK-053			AG	84	0.2211
mh17KK-055			CCAAA	72	0.1457	CT	234	0.4699	GG	113	0.2974
AC	227	0.5881	CCGGA	1	0.0020	TC	205	0.4116	mh17KK-105
AT	1	0.0026	mh17KK-052			TT	59	0.1185	ATA	12	0.0235
CC	47	0.1218	AA	101	0.2186	mh17KK-077			ATG	498	0.9765
CT	111	0.2876	AG	148	0.3203	GG	440	0.8594	mh18KK-293
mh17KK-110			GA	202	0.4372	TG	72	0.1406	AGAA	121	0.2430
CA	7	0.0137	GG	11	0.0238	mh18KK-285			AGGA	1	0.0020
CG	432	0.8471	mh17KK-076			AGCG	45	0.0886	ATAA	8	0.0161
TG	71	0.1392	AG	512	1.0000	CACG	256	0.5039	ATGA	72	0.1446
mh19KK-056			mh17KK-272			CGCG	6	0.0118	GGAA	198	0.3976
CA	265	0.5430	CCCT	246	0.5125	CGCT	89	0.1752	GGAG	77	0.1546
CC	1	0.0020	TCAT	25	0.0521	CGTG	112	0.2205	GGGA	9	0.0181
TA	18	0.0369	TCCC	28	0.0583	mh19KK-299			GTAA	7	0.0141
TC	204	0.4180	TCCT	116	0.2417	ACGAA	1	0.0020	GTAG	2	0.0040
mh21KK-315			TTCC	65	0.1354	ATGAA	68	0.1382	GTGA	3	0.0060
ACC	28	0.0562	mh19KK-057			ATGAG	1	0.0020	mh19KK-301
ACT	1	0.0020	CCG	331	0.6567	GCAAA	50	0.1016	AGGT	4	0.0078
ATC	106	0.2129	CTG	139	0.2758	GCAAG	219	0.4451	GAAC	416	0.8157
ATT	13	0.0261	CTT	34	0.0675	GCATG	100	0.2033	GGAC	2	0.0039
GCC	69	0.1386	mh20KK-059			GCGTA	43	0.0874	GGAT	88	0.1725
GCT	28	0.0562	AA	136	0.2698	GCGTG	10	0.0203	mh20KK-058
GTC	84	0.1687	AG	50	0.0992	mh20KK-307			CAC	162	0.3240
GTT	169	0.3394	GG	318	0.6310	CTGA	142	0.2971	TAC	148	0.2960
mh21KK-316			mh21KK-320			TTAA	101	0.2113	TAT	136	0.2720
ACAC	198	0.3976	AACA	56	0.1181	TTGA	192	0.4017	TGC	54	0.1080
ACGC	3	0.0060	AACG	127	0.2679	TTGC	43	0.0900	mh22KK-060
ACGT	132	0.2651	AATA	1	0.0021	mh21KK-324			CA	144	0.2903
ATGC	44	0.0884	AGCG	1	0.0021	CCAA	3	0.0062	CG	170	0.3427
GCGC	120	0.2410	GACA	141	0.2975	CCAG	14	0.0288	GG	182	0.3669
GTGC	1	0.0020	GACG	18	0.0380	CCTA	19	0.0391	mh22KK-303
mh22KK-061			GATA	81	0.1709	CCTG	3	0.0062	CGGG	325	0.6423
AAA	84	0.1667	GGCA	22	0.0464	CTAA	140	0.2881	CTGG	36	0.0711
AAG	4	0.0079	GGCG	27	0.0570	CTTA	50	0.1029	TGGG	145	0.2866
GAA	256	0.5079	mh22KK-064			CTTG	1	0.0021	mh22KK-069
GAG	31	0.0615	AAT	432	0.8438	TCAG	185	0.3807	AG	46	0.0898
GGG	129	0.2560	GAT	80	0.1563	TCTG	69	0.1420	GG	166	0.3242
						TTAA	2	0.0041	GT	300	0.5859

Genot: allele genotype; Count: allele count; Fre: allele frequency.

Back to article page

Table 3 Allele frequencies of 124 microhaplotypes in the Chinese Han population (N = 256).

Search

Quick links