Table 1 Correlation between the local ancestry components AFR, AMR and EUR with baseline vitamin B12 levels per each 90 B12-related gene with pperm < 0.1.
Gene symbol | AFR | AMR | EUR | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
r | pperm | r | pperm | r | pperm | |
ACOT7 | − 0.08 | 2.9E−01 | − 0.11 | 1.7E−01 | 0.13 | 8.28E−02 |
HES2 | − 0.08 | 2.9E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.13 | 8.23E−02 |
UBIAD1 | − 0.09 | 2.7E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.13 | 8.71E−02 |
MTHFR | − 0.09 | 2.5E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.13 | 8.94E−02 |
MMACHC | − 0.10 | 2.2E−01 | − 0.08 | 3.2E−01 | 0.14 | 7.29E−02 |
SCP2 | − 0.11 | 1.6E−01 | − 0.05 | 5.1E−01 | 0.10 | 1.88E−01 |
CTH | 0.02 | 8.5E−01 | − 0.05 | 5.0E−01 | 0.05 | 5.42E−01 |
F3 | − 0.05 | 5.2E−01 | − 0.09 | 2.4E−01 | 0.06 | 4.34E−01 |
SARS | − 0.08 | 3.0E−01 | − 0.05 | 5.0E−01 | 0.17 | 2.74E−02 |
CRP | − 0.15 | 4.8E−02 | − 0.01 | 8.6E−01 | 0.07 | 3.77E−01 |
LIN9 | − 0.10 | 2.2E−01 | − 0.05 | 4.9E−01 | 0.06 | 4.78E−01 |
MTR | − 0.01 | 8.5E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.09 | 2.64E−01 |
THUMPD2 | − 0.12 | 1.3E−01 | − 0.01 | 9.3E−01 | 0.12 | 1.20E−01 |
TXNDC9 | − 0.05 | 4.8E−01 | − 0.07 | 3.9E−01 | 0.09 | 2.51E−01 |
MMADHC | 0.00 | 9.8E−01 | − 0.15 | 5.4E−02 | 0.14 | 8.03E−02 |
LRP2 | − 0.13 | 8.7E−02 | − 0.05 | 5.2E−01 | 0.09 | 2.59E−01 |
HAT1 | − 0.16 | 3.3E−02 | − 0.06 | 4.5E−01 | 0.13 | 8.63E−02 |
METAP1D | − 0.17 | 3.2E−02 | − 0.06 | 4.6E−01 | 0.13 | 8.70E−02 |
CASR | − 0.11 | 1.4E−01 | − 0.08 | 2.9E−01 | 0.14 | 6.72E−02 |
ALDH1L1 | − 0.06 | 4.7E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.10 | 2.14E−01 |
TF | 0.00 | 9.8E−01 | − 0.18 | 1.9E−02 | 0.06 | 4.67E−01 |
CP | − 0.05 | 5.0E−01 | − 0.17 | 2.6E−02 | 0.16 | 4.04E−02 |
LXN | − 0.02 | 7.7E−01 | − 0.18 | 1.9E−02 | 0.14 | 7.70E−02 |
TFRC | − 0.16 | 4.1E−02 | − 0.04 | 6.0E−01 | 0.16 | 3.83E−02 |
CSN1S1 | 0.03 | 6.9E−01 | − 0.04 | 6.3E−01 | 0.05 | 4.81E−01 |
HTN3 | 0.03 | 6.9E−01 | − 0.04 | 6.3E−01 | 0.05 | 4.95E−01 |
ALB | 0.04 | 6.3E−01 | − 0.06 | 4.1E−01 | 0.03 | 6.78E−01 |
METAP1 | − 0.07 | 3.6E−01 | 0.06 | 4.0E−01 | 0.07 | 3.80E−01 |
GYPA | − 0.10 | 2.1E−01 | 0.01 | 8.6E−01 | 0.16 | 3.34E−02 |
MMAA | − 0.04 | 5.6E−01 | 0.02 | 7.9E−01 | 0.15 | 5.92E−02 |
MTRR | − 0.04 | 6.4E−01 | − 0.13 | 1.0E−01 | 0.10 | 2.20E−01 |
PRELID2 | − 0.05 | 5.3E−01 | − 0.06 | 4.1E−01 | 0.10 | 2.03E−01 |
HRH2 | − 0.04 | 5.8E−01 | − 0.10 | 2.0E−01 | 0.10 | 1.91E−01 |
ADAMTS2 | − 0.03 | 6.6E−01 | − 0.16 | 4.2E−02 | 0.09 | 2.23E−01 |
PGC | − 0.10 | 1.9E−01 | − 0.09 | 2.5E−01 | 0.14 | 6.51E−02 |
GNMT | − 0.12 | 1.2E−01 | − 0.08 | 2.8E−01 | 0.13 | 8.48E−02 |
MUT | − 0.15 | 5.7E−02 | − 0.08 | 3.0E−01 | 0.15 | 4.51E−02 |
LMBRD1 | − 0.11 | 1.7E−01 | − 0.08 | 2.9E−01 | 0.15 | 4.99E−02 |
PON1 | − 0.04 | 6.2E−01 | − 0.08 | 2.9E−01 | 0.05 | 4.89E−01 |
GGH | 0.00 | 9.6E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.09 | 2.44E−01 |
FPGS | − 0.12 | 1.1E−01 | − 0.19 | 1.2E−02 | 0.14 | 6.41E−02 |
SLC27A4 | − 0.13 | 9.1E−02 | − 0.20 | 9.7E−03 | 0.15 | 6.02E−02 |
CUBN | − 0.08 | 3.1E−01 | − 0.15 | 5.1E−02 | 0.16 | 3.75E−02 |
TRDMT1 | − 0.08 | 3.1E−01 | − 0.15 | 4.9E−02 | 0.16 | 4.37E−02 |
PANK1 | − 0.13 | 9.2E−02 | − 0.15 | 4.6E−02 | 0.17 | 2.64E−02 |
PNLIP | − 0.14 | 6.9E−02 | − 0.16 | 4.2E−02 | 0.17 | 2.47E−02 |
IFITM2 | − 0.08 | 3.2E−01 | − 0.14 | 7.1E−02 | 0.10 | 2.17E−01 |
HBE1 | − 0.06 | 4.1E−01 | − 0.11 | 1.6E−01 | 0.08 | 3.03E−01 |
GIF | − 0.19 | 1.2E−02 | − 0.20 | 1.1E−02 | 0.24 | 1.86E−03 |
TCN1 | − 0.19 | 1.2E−02 | − 0.20 | 1.1E−02 | 0.24 | 1.91E−03 |
MS4A3 | − 0.19 | 1.3E−02 | − 0.20 | 9.9E−03 | 0.24 | 1.71E−03 |
PGA3 | − 0.14 | 6.1E−02 | − 0.21 | 6.6E−03 | 0.21 | 6.07E−03 |
PGA4 | − 0.14 | 6.4E−02 | − 0.21 | 6.6E−03 | 0.21 | 5.85E−03 |
FADS1 | − 0.13 | 8.2E−02 | − 0.21 | 6.0E−03 | 0.21 | 6.93E−−03 |
FTH1 | − 0.12 | 1.1E−01 | − 0.21 | 6.2E−03 | 0.20 | 9.70E−03 |
CBL | − 0.02 | 8.0E−01 | − 0.25 | 1.2E−03 | 0.14 | 7.59E−02 |
CD4 | − 0.02 | 7.5E−01 | − 0.04 | 6.2E−01 | 0.12 | 1.13E−01 |
CS | − 0.10 | 2.0E−01 | 0.03 | 7.2E−01 | 0.09 | 2.45E−01 |
SHMT2 | − 0.10 | 1.9E−01 | 0.03 | 7.0E−01 | 0.08 | 3.05E−01 |
METAP2 | − 0.11 | 1.4E−01 | − 0.02 | 7.9E−01 | 0.14 | 6.19E−02 |
MMAB | − 0.05 | 5.6E−01 | 0.06 | 4.7E−01 | 0.03 | 7.14E−01 |
MVK | − 0.05 | 5.6E−01 | 0.06 | 4.7E−01 | 0.03 | 7.14E−01 |
SDS | − 0.05 | 5.2E−01 | 0.08 | 3.1E−01 | 0.02 | 7.99E−01 |
ATP12A | − 0.04 | 6.2E−01 | − 0.03 | 6.5E−01 | 0.05 | 5.01E−01 |
CLYBL | − 0.13 | 8.7E−02 | − 0.04 | 6.3E−01 | 0.12 | 1.13E−01 |
ATP4B | − 0.08 | 3.2E−01 | − 0.09 | 2.5E−01 | 0.13 | 8.22E−02 |
ABCD4 | 0.00 | 1.0E+00 | − 0.12 | 1.1E−01 | 0.02 | 8.40E−01 |
AMN | 0.01 | 9.5E−01 | − 0.05 | 5.1E−01 | − 0.01 | 9.28E−01 |
TGM5 | − 0.12 | 1.3E−01 | − 0.06 | 4.3E−01 | 0.16 | 4.19E−02 |
DUT | − 0.13 | 8.4E−02 | − 0.10 | 1.9E−01 | 0.15 | 4.60E−02 |
NDUFAB1 | − 0.10 | 1.9E−01 | 0.00 | 9.5E−01 | 0.10 | 2.02E−01 |
HP | − 0.08 | 3.2E−01 | 0.00 | 9.9E−01 | 0.06 | 4.35E−01 |
HPR | − 0.08 | 3.2E−01 | 0.00 | 9.9E−01 | 0.06 | 4.35E−01 |
PEMT | 0.02 | 8.1E−01 | − 0.12 | 1.1E−01 | 0.11 | 1.72E−01 |
TNFAIP1 | 0.01 | 8.9E−01 | − 0.13 | 8.2E−02 | 0.10 | 1.95E−01 |
GAST | 0.08 | 3.1E−01 | − 0.14 | 7.6E−02 | 0.10 | 1.83E−01 |
ACLY | 0.08 | 3.0E−01 | − 0.14 | 7.8E−02 | 0.10 | 1.89E−01 |
MMD | 0.01 | 8.5E−01 | − 0.12 | 1.2E−01 | 0.12 | 1.30E−01 |
TYMS | − 0.12 | 1.4E−01 | − 0.02 | 7.7E−01 | 0.11 | 1.44E−01 |
MBP | − 0.03 | 6.6E−01 | − 0.02 | 7.9E−01 | 0.04 | 5.76E−01 |
FUT6 | − 0.03 | 6.9E−01 | − 0.15 | 4.8E−02 | 0.11 | 1.40E−01 |
CD320 | − 0.07 | 3.9E−01 | − 0.10 | 2.1E−01 | 0.07 | 3.46E−01 |
SLC27A1 | − 0.10 | 2.1E−01 | − 0.10 | 1.9E−01 | 0.11 | 1.68E−01 |
ATP4A | − 0.03 | 6.6E−01 | − 0.12 | 1.2E−01 | 0.05 | 5.54E−01 |
CD79A | 0.00 | 9.7E−01 | − 0.13 | 8.4E−02 | 0.08 | 3.29E−01 |
FUT2 | − 0.04 | 6.1E−01 | − 0.14 | 6.8E−02 | 0.15 | 4.82E−02 |
FTL | − 0.05 | 5.1E−01 | − 0.14 | 7.4E−02 | 0.16 | 3.36E−02 |
NTSR1 | 0.06 | 4.4E−01 | − 0.17 | 2.6E−02 | 0.00 | 9.95E−01 |
CBS | 0.10 | 1.9E−01 | − 0.12 | 1.3E−01 | 0.01 | 8.79E−01 |
TCN2 | − 0.02 | 7.5E−01 | − 0.04 | 6.4E−01 | 0.04 | 6.45E−01 |
