Table 1 Confusion matrices of simulated individuals’ proportional assignment with NEWHYBRIDS based on data from: (A) Top 300 Fst SNPs; (B) Top 600 Fst SNPs; (C) Random 350 SNPs from the top 600 Fst SNPs (Random 350 Fst); and (D) 342 final SNP panel.
A: Top 300 Fst | Kokanee | Sockeye | F1 | F2 | B2 Kokanee | B2 Sockeye |
---|---|---|---|---|---|---|
Kokanee | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
Sockeye | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
F1 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
F2 | 0.000 | 0.000 | 0.020 | 0.980 | 0.000 | 0.000 |
B2 Kokanee | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |
B2 Sockeye | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
B: Top 600 Fst | Kokanee | Sockeye | F1 | F2 | B2 Kokanee | B2 Sockeye |
---|---|---|---|---|---|---|
Kokanee | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
Sockeye | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
F1 | 0.000 | 0.000 | 0.960 | 0.040 | 0.000 | 0.000 |
F2 | 0.000 | 0.000 | 0.020 | 0.980 | 0.000 | 0.000 |
B2 Kokanee | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |
B2 Sockeye | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
C: Random 350 Fst | Kokanee | Sockeye | F1 | F2 | B2 Kokanee | B2 Sockeye |
---|---|---|---|---|---|---|
Kokanee | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
Sockeye | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
F1 | 0.000 | 0.000 | 0.970 | 0.030 | 0.000 | 0.000 |
F2 | 0.000 | 0.000 | 0.060 | 0.920 | 0.020 | 0.000 |
B2 Kokanee | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |
B2 Sockeye | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.010 | 0.000 | 0.990 |
D: 342 Final | Kokanee | Sockeye | F1 | F2 | B2 Kokanee | B2 Sockeye |
---|---|---|---|---|---|---|
Kokanee | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
Sockeye | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
F1 | 0.000 | 0.000 | 0.950 | 0.050 | 0.000 | 0.000 |
F2 | 0.000 | 0.000 | 0.050 | 0.940 | 0.000 | 0.010 |
B2 Kokanee | 0.000 | 0.000 | 0.010 | 0.020 | 0.970 | 0.000 |
B2 Sockeye | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.020 | 0.000 | 0.980 |