Table 2 The algorithm for designating bacterial strains based on analytical specificity of assay-sets to their targets.
6A | 6B | 6C | 6D | 10A | 10B | 11E | 12A/F/44 | 18A | 18B | 18C | 18F | 19B | 19F | 22A | 22F | 23A | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6A/B/C/D | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
6A/C | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
6C/D | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
10A/B | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
10B | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
11A/B/C/D/E/F | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
11A/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
11B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
11F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
12A/B/F/44/46 | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
12B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
16F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
16F/18F/28AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
17A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
17A/34/37 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
18A/B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − |
18BCF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − |
18CF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − |
19B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
19F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
22AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − |
22F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
23A/B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + |
23B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
23F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
25A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
25A/F/38 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
28A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
33A/F/37 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
33B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
33B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
34 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
35F/47F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
46 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
47A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
IS481 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
PtxS1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
hIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
pIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
IgA1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
BexA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
BexB | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
Hin−b | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
25A/F | 33A/F | 33B | 33C | 35F | 37 | 38 | 47A | 47F | B.pertussis | B.holmesii | B.parapertussis | B.bronchiseptica | H. influenzae | H.influenzae−b | NTHI | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6A/B/C/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
6A/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
6C/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
10A/B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
10B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
11A/B/C/D/E/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
11A/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
11B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
11F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
12A/B/F/44/46 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
12B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
16F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
16F/18F/28AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
17A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
17A/34/37 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
18A/B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
18BCF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
18CF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
19B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
19F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
22AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
22F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
23A/B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
23B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
23F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
25A/F | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
25A/F/38 | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
28A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
33A/F/37 | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
33B/C | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
33B | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
34 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
35F/47F | − | − | − | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | |
46 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
47A/F | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | |
IS481 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | |
PtxS1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | |
hIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | |
pIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | |
IgA1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | |
BexA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | |
BexB | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | |
Hin−b | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | |
