Table 1 Summary of high impact variants in the PPOs of four globe artichoke varietal types.

Varietal type	Gene	Locus	Gene position	SNP/Indel position	Reference	Alternative	Genotypic status	Effect
VT	PPO4	V2_02g003640.1.01	3831196–3844009	3831685	G	C	Het	ETM
	PPO4	V2_02g003640.1.01	3831196–3844009	3842888	G	C	Het	ETM
	PPO5	V2_02g003650.1.01	3860408–3862336	3860433	AAC	AACGTAC	Hom	FS + ETM
	PPO9	V2_17g002890.1.01	3195388–3206783	3206527	TTGTCAATGACAAAGACAATGT	TT	Het	FS + ETM
	PPO9	V2_17g002890.1.01	3195388–3206783	3206699	C	A	Het	ETM
VS	PPO5	V2_02g003650.1.01	3860408–3862336	3860433	AAC	AACGTAC	Het	FS + ETM
VS	PPO9	V2_17g002890.1.01	3195388–3206783	3206527	TTGTCAATGACAAAGACAATGT	TT	Het	FS + ETM
C3	PPO4	V2_02g003640.1.01	3831196–3844009	3843437	ACC	AC	Het	FS + ETM
C3	PPO5	V2_02g003650.1.01	3860408–3862336	3860433	AAC	AACGTAC	Het	FS + ETM
SP	PPO5	V2_02g003650.1.01	3860408–3862336	3860433	AAC	AACGTAC	Het	FS + ETM
SP	PPO9	V2_17g002890.1.01	3195388–3206783	3206527	TTGTCAATGACAAAGACAATGT	TT	Het	FS + ETM

For each variant, the position into the genome, and the reference and alternative sequences are reported.
VT, Violetto di Toscana; VS, Violetto di Sicilia; C3, Romanesco C3; SP, Spinoso di Palermo; Het, Heterozygous; Hom, Homozygous; ETM, Early-termination mutation; FSM, Frame-shifting mutation.

Quick links

Search