Table 3 The results of performance evaluation with test sets of classification models for determining the geographical origin of domestic and imported kimchi samples.

From: Rapid determination of the geographical origin of kimchi by Fourier transform near-infrared spectroscopy coupled with chemometric techniques

Model1)

Preprocessing method2)

Accuracy

Recall

Specificity

Precision

F1 score

KNN

Raw

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

CART

Raw

0.82

0.93

0.70

0.76

0.84

MSC

0.97

1.00

0.93

0.94

0.97

MSC + D1

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

MSC + D1 + ND

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

MSC + D1 + SG

0.93

0.97

0.90

0.91

0.94

MSC + D2

0.82

0.73

0.90

0.88

0.80

MSC + D2 + ND

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

MSC + D2 + SG

0.90

0.87

0.93

0.93

0.90

SNV

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

SNV + D1

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

SNV + D1 + ND

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

SNV + D1 + SG

0.97

1.00

0.93

0.94

0.97

SNV + D2

0.75

0.73

0.77

0.76

0.75

SNV + D2 + ND

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

SNV + D2 + SG

0.88

0.80

0.97

0.96

0.87

SVM

Raw

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

MSC + D2 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

SNV + D2 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

NB

Raw

0.65

0.77

0.53

0.62

0.69

MSC

0.77

0.70

0.83

0.81

0.75

MSC + D1

0.90

0.90

0.90

0.90

0.90

MSC + D1 + ND

0.92

0.93

0.90

0.90

0.92

MSC + D1 + SG

0.90

0.90

0.90

0.90

0.90

MSC + D2

0.92

0.90

0.93

0.93

0.92

MSC + D2 + ND

0.72

0.43

1.00

1.00

0.60

MSC + D2 + SG

0.50

0.00

1.00

ID3)

ID

SNV

0.73

0.67

0.80

0.77

0.71

SNV + D1

0.90

0.90

0.90

0.90

0.90

SNV + D1 + ND

0.92

0.93

0.90

0.90

0.92

SNV + D1 + SG

0.90

0.90

0.90

0.90

0.90

SNV + D2

0.93

0.93

0.93

0.93

0.93

SNV + D2 + ND

0.93

0.90

0.97

0.96

0.93

SNV + D2 + SG

0.93

0.90

0.97

0.96

0.93

RF

Raw

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

MSC

0.98

0.97

1.00

1.00

0.98

MSC + D1

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

MSC + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + SG

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

MSC + D2

0.92

0.90

0.93

0.93

0.92

MSC + D2 + ND

0.98

1.00

0.97

0.97

0.98

MSC + D2 + SG

0.88

0.90

0.87

0.87

0.89

SNV

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

SNV + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + SG

0.97

1.00

0.93

0.94

0.97

SNV + D2

0.93

0.93

0.93

0.93

0.93

SNV + D2 + ND

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

SNV + D2 + SG

0.95

0.93

0.97

0.97

0.95

PLS-DA

Raw

0.90

0.87

0.93

0.93

0.90

MSC

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D1 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

MSC + D2 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

MSC + D2 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D1 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2

0.97

0.97

0.97

0.97

0.97

SNV + D2 + ND

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

SNV + D2 + SG

1.00

1.00

1.00

1.00

1.00

  1. 1) KNN, k-nearest neighbors; CART, classification and regression tree; SVM, support vector machine; NB, naïve Bayes; RF, random forest; PLS-DA, partial least squares-discriminant analysis.
  2. 2) MSC, multiplicative signal correction; D1, the first derivative; ND, Norris derivative filtering; SG, Savitzky-Golay filtering; D2, the second derivative; SNV, standard normal variate.
  3. 3) ID, Indeterminate.