Table 3 Diversity of the variable regions measured at varying hamming distances.
From: A single donor is sufficient to produce a highly functional in vitro antibody library
Hamming | # Reads | Unique CDR1 measurea | Unique CDR2 measurea | Unique CDR3 measure | Unique CDR3 estimate | CDR1 and 3 total |
|---|---|---|---|---|---|---|
IGHV | ||||||
0 | 1.82E + 09 | 1.04E + 05 | 2.05E + 05 | 5.17E + 07 | 7.14E + 07 | 1.50E + 08 |
1 | 1.82E + 09 | 5.52E + 04 | 1.06E + 04 | 3.24E + 07 | 4.54E + 07 | 1.03E + 08 |
2 | 1.82E + 09 | 4.74E + 04 | 8.61E + 04 | 2.67E + 07 | 3.49E + 07 | 8.24E + 07 |
3 | 1.82E + 09 | 4.59E + 04 | 8.29E + 04 | 2.20E + 07 | 2.72E + 07 | 7.02E + 07 |
N ≥ 2 | 1.82E + 09 | 4.54E + 04 | 8.22E + 04 | 1.49E + 07 | 2.14E + 07 | 4.46E + 07 |
IGKV | ||||||
0 | 1.65E + 08 | 3.24E + 04 | 1.41E + 04 | 4.68E + 05 | 3.04E + 05 | 1.95E + 06 |
1 | 1.65E + 08 | 1.87E + 04 | 7.78E + 03 | 2.51E + 05 | 1.96E + 05 | 1.01E + 06 |
2 | 1.65E + 08 | 1.55E + 04 | 7.00E + 03 | 2.29E + 05 | 1.85E + 05 | 7.89E + 05 |
3 | 1.65E + 08 | 1.49E + 04 | 6.90E + 03 | 2.23E + 05 | 1.83E + 05 | 7.45E + 05 |
N ≥ 2 | 1.65E + 08 | 1.45E + 04 | 6.85E + 03 | 2.20E + 05 | 2.37E + 05 | 7.28E + 05 |
IGLV | ||||||
0 | 1.13E + 08 | 2.20E + 04 | 1.23E + 04 | 1.12E + 06 | 1.10E + 06 | 1.96E + 06 |
1 | 1.13E + 08 | 1.21E + 04 | 6.70E + 03 | 6.96E + 05 | 6.67E + 05 | 1.02E + 06 |
2 | 1.13E + 08 | 9.69E + 03 | 6.04E + 03 | 6.40E + 05 | 6.20E + 05 | 7.10E + 05 |
3 | 1.13E + 08 | 9.15E + 03 | 5.89E + 03 | 6.29E + 05 | 6.11E + 05 | 6.91E + 05 |
N ≥ 2 | 1.13E + 08 | 8.92E + 03 | 5.83E + 03 | 6.23E + 05 | 6.57E + 05 | 6.84E + 05 |
IGHV/IGKV total | ||||||
0 | − | 3.37E + 09 | 2.89E + 09 | 2.42E + 13 | 2.17E + 13 | 2.93E + 14 |
1 | − | 1.03E + 09 | 8.25E + 07 | 8.13E + 12 | 8.90E + 12 | 1.04E + 14 |
2 | − | 7.35E + 08 | 6.03E + 08 | 6.11E + 12 | 6.46E + 12 | 6.50E + 13 |
3 | − | 6.84E + 08 | 5.72E + 08 | 4.91E + 12 | 4.98E + 12 | 5.23E + 13 |
N ≥ 2 | − | 6.58E + 08 | 5.63E + 08 | 3.28E + 12 | 5.07E + 12 | 3.25E + 13 |
IGHV/IGLV total | ||||||
0 | − | 2.29E + 09 | 2.52E + 09 | 5.79E + 13 | 7.85E + 13 | 2.94E + 14 |
1 | − | 6.68E + 08 | 7.10E + 07 | 2.26E + 13 | 3.03E + 13 | 1.05E + 14 |
2 | − | 4.59E + 08 | 5.20E + 08 | 1.71E + 13 | 2.16E + 13 | 5.85E + 13 |
3 | − | 4.20E + 08 | 4.88E + 08 | 1.38E + 13 | 1.66E + 13 | 4.85E + 13 |
N ≥ 2 | − | 4.05E + 08 | 4.79E + 08 | 9.28E + 12 | 1.41E + 13 | 3.05E + 13 |
