Table 1 RAVs detected for NS3, NS5A and NS5B inhibitors in various genotypes.

From: Global prevalence of pre-existing HCV variants resistant to direct-acting antiviral agents (DAAs): mining the GenBank HCV genome data

DAA class

Drug used

RAVs

GT1a n = 687

GT1b n = 361

GT2 n = 184

GT3 n = 48

GT4 n = 76

GT6 n = 99

DAA class

Drug used

RAVs

GT1a n = 687

GT1b n = 361

GT2 n = 184

GT3 n = 48

GT4 n = 76

GT6 n = 99

NS3

BOC

V36A

1

     

NS5A

DCV

P58S

 

14

4

1

 

7

V36G

1

     

E62D

 

1

1

2

 

5

V36M

2

 

1

  

1

Y93H

4

17

1

 

5

 

V36L

     

12

Y93C

5

     

T54A

  

1

   

Y93N

1

     

T54S

12

6

1

1

2

 

Y93R

    

1

 

T54G

    

1

 

LDV

K24G

   

2

  

V55A

8

     

K24R

7

    

3

V55I

13

     

M28A

     

3

V107I

13

     

M28G

     

1

R155K

6

     

M28T

3

    

2

A156V

     

1

Q30G

2

     

V158I

  

3

1

2

3

Q30H

7

    

1

I170V

22

 

18

5

1

65

Q30L

1

  

2

  

M175L

 

2

1

   

Q30R

1

 

18

1

42

24

TVR

V36A

1

     

Q30K

   

14

  

V36G

1

     

Q30T

   

2

4

2

V36I

 

1

   

7

L31I

     

2

V36M

2

 

1

  

1

L31M

14

14

27

8

  

V36L

11

    

12

L31V

1

3

 

2

  

T54A

  

1

   

H58D

2

     

T54S

15

6

1

1

2

 

A92T

1

5

  

1

 

V55A

9

     

Y93C

5

     

I132V

5

 

4

1

2

 

Y93H

4

17

1

 

5

 

R155K

6

     

Y93N

1

     

A156V

     

1

Y93S

  

5

 

3

22

SMV

Q80K

258

2

1

  

19

OMV

T24A

  

1

   

Q80R

4

1

 

1

  

M28T

3

    

2

S122G

31

   

1

 

M28V

26

    

25

S122T

 

20

2

  

9

L28M

    

11

4

S122R

  

78

   

L28T

  

2

   

R155K

6

     

F28S

  

1

   

A156V

     

1

Q30H

8

    

1

D168T

    

1

 

Q30R

1

 

18

1

42

24

D168E

2

3

  

1

5

L31V

1

3

 

2

  

D168V

1

     

H58D

2

     

PTV

V36A

1

     

Y93C

5

     

V36G

1

     

Y93H

4

17

1

 

5

 

V36M

2

 

1

  

1

Y93N

1

     

V55I

13

     

Y93S

  

5

 

3

22

R155K

6

     

NS5B

SOF

L159F

 

19

   

2

D168E

2

3

  

1

5

T179A

  

9

   

D168T

    

1

 

S282T

 

1

    

D168V

1

     

M289I

  

7

   

NS5A

DCV

M28A

     

1

M289L

  

5

2

3

11

M28V

26

    

25

DSV

C316H

    

3

 

M28T

3

    

2

C316Y

 

1

    

M28G

     

1

C316N

1

   

5

 

L28M

    

11

4

N411S

   

1

  

L28T

  

2

   

M414I

 

1

  

4

 

F28S

  

1

   

C445F

 

4

    

Q30G

2

     

E446Q

   

3

  

Q30H

8

    

1

Y448C

 

1

    

Q30R

1

 

18

1

42

24

Y448H

2

     

Q30T

   

2

4

2

C451S

 

4

    

Q30K

   

14

  

A553V

 

1

   

4

L30S

    

6

 

G554S

  

1

2

  

L31M

14

14

27

8

  

S556G

4

35

1

  

1

L31V

1

3

 

2

  

S556N

1

  

5

  

L31I

 

2

   

2

S556R

 

1

   

14

H58D

2

     

D559G

     

1

H58R

1

   

1

 

I585V

20

5

1

3

1

4

H58P

27

 

88

 

17

        
  1. GT, genotype; BOC, Boceprevir; TVR, Telaprevir; SMV, Simeprevir; PTV, Paritaprevir; DCV, Daclatasvir; LDV, Ledipasvir; OMV, Ombitasvir; SOF, Sofosbuvir; DSV, Dasabuvir.