Table 7 1000 Genomes Project Phase 3 allele frequencies for markers identified in this study.

From: Genetic risk variants for metabolic traits in Arab populations

SNP	Minor allele frequencies (MAF) ^@ in
SNP	AFR (African)	AMR (Ad Mixed American)	EAS (East Asian)	EUR (European)	SAS (South Asian)	Arab (Study population)
rs3767494	0.02	0.11	0.13	0.05	0.07	0.053
Chr15:40531386-rs12440118	0.01	0.1	0.01	0.14	0.07	0.106
rs7144734	0.12	0.2	0.07	0.29	0.17	0.204
rs17501809	0	0.04	0	0.08	0.04	0.059
rs11143005	0.42	0.14	0	0.19	0.18	0.283
rs900543	0.44	0.12	0.26	0.04	0.06	0.087
rs10860880	0.28	0.04	0.01	0.02	0.04	0.056
rs17117722	0.34	0.06	0	0.06	0.01	0.074
rs10005556	0.197	0.023	0	0.027	0.033	0.05
rs4559034	0.431	0.157	0.009	0.286	0.253	0.31
rs9390649	0.243	0.225	0.271	0.409	0.401	0.36
rs17639988	0.002	0.048	0.001	0.078	0.034	0.08
rs1800775	0.607	0.543	0.486	0.488	0.59	0.47
rs9326246	0.011	0.133	0.238	0.093	0.193	0.11
rs925530	0.616	0.427	0.451	0.328	0.367	0.37
rs10935794	0.061	0.207	0.326	0.282	0.26	0.19
rs3959929	0.004	0.069	0	0.11	0.015	0.065
rs1184476	0.29	0.035	0	0.038	0.027	0.054
chr1:160381119	0	0	0	0	0	0.053
rs17716285	0.007	0.055	0	0.093	0.019	0.055
rs7729384	0.066	0.216	0.118	0.242	0.05	0.12
rs3799125	0.029	0.086	0.105	0.196	0.098	0.1
rs10247084	0.132	0.085	0.107	0.072	0.077	0.06
rs11785103	0.003	0.027	0.001	0.044	0.039	0.0642
rs883431	0.402	0.442	0.497	0.172	0.191	0.18
rs4764409	0.036	0.411	0.322	0.196	0.194	0.085
rs747486	0.009	0.036	0.114	0.049	0.134	0.075
rs12722856	0.005	0.029	0	0.067	0.056	0.083
rs10014125	0.365	0.097	0.067	0.132	0.109	0.175
rs17073574	0.042	0.082	0.188	0.069	0.116	0.137
rs11777524	0.062	0.049	0.325	0.08	0.224	0.052
rs11602685	0.118	0.073	0.041	0.095	0.029	0.1
chr11:45779819	0	0	0.168 ^*	0.033 ^*	0	0.06
rs17569297	0.008	0.072	0.001	0.129	0.153	0.13
rs7342999	0.588	0.222	0.202	0.088	0.08	0.13
rs10497520	0.408	0.509	0.217	0.812	0.544	0.155

^@MAF values less than 5% are shown in italics.
^*MAF is obtained from Illumina product files (http://support.illumina.com/downloads/cardio-metaboChip_product_support_files.html).

Back to article page

Table 7 1000 Genomes Project Phase 3 allele frequencies for markers identified in this study.

Search

Quick links