Table 2 Differentially methylated regions in predefined genomic regions with adjusted p-value < 0.05 and containing at least 10 CpG sites.

From: Sex differences in DNA methylation of the cord blood are related to sex-bias psychiatric diseases

ID

Chromosome

Start

End

Gene symbol

entrezID

Mean difference

Combined adjP

CpG sites

CpG islands

20510

chr17

20798958

20800112

  

−0,046

3,79E-03

11

22902

chr19

6495193

6496225

  

−0,017

1,94E-03

10

25607

chr21

27106815

27108211

  

−0,003

2,13E-03

10

4617

chr3

57993839

57994704

  

0,007

1,11E-02

12

3768

chr2

208576002

208577106

  

0,016

1,68E-03

10

4494

chr3

49394856

49395942

  

0,017

1,08E-02

10

18564

chr15

101094521

101099493

  

0,020

7,65E-03

13

18889

chr16

2569560

2571071

  

0,024

1,22E-02

13

16491

chr13

25874995

25876200

  

0,026

3,76E-02

12

7248

chr5

149546028

149546988

  

0,058

2,20E-03

10

Promoters

ENSG00000237268

chr7

56515569

56517568

NA

NA

−0,047

9,62E-03

13

ENSG00000205212

chr17

20798954

20800953

CCDC144NL

339184

−0,042

1,02E-02

12

ENSG00000155918

chr6

150346169

150348168

RAET1L

154064

−0,020

3,75E-02

11

ENSG00000136068

chr3

57992627

57994626

FLNB

2317

0,007

1,39E-02

12

ENSG00000163249

chr2

208574764

208576763

CCNYL1

151195

0,017

1,91E-03

10

ENSG00000162066

chr16

2568858

2570857

AMDHD2

51005; 752014

0,026

1,21E-02

13

ENSG00000139496

chr13

25874162

25876161

NUPL1

9818

0,027

4,45E-02

13

ENSG00000157911

chr1

2344737

2346736

PEX10

5192

0,040

8,61E-03

13

ENSG00000113722

chr5

149544858

149546857

CDX1

1044

0,046

4,24E-02

10

Genes

ENSG00000189136

chr15

85070012

85114447

UBE2Q2P1

388165

−0,022

9,38E-05

10

ENSG00000120705

chr5

137841784

137878989

ETF1

2107

−0,009

1,24E-02

10

ENSG00000164754

chr8

117858174

117887105

RAD21

5885

−0,008

3,62E-02

12

ENSG00000100902

chr14

35747839

35786699

PSMA6

5687

−0,004

2,32E-02

12

ENSG00000154727

chr21

27106881

27144771

GABPA

2551

−0,003

4,83E-02

15

ENSG00000154723

chr21

27088815

27107984

ATP5J

522

−0,001

3,91E-02

14

ENSG00000176714

chr2

27848506

27851879

CCDC121

79635

0,016

6,56E-05

12

ENSG00000241186

chr3

46616045

46668033

TDGF1

6997

0,016

7,33E-03

18

ENSG00000196781

chr9

84198598

84304220

TLE1

7088

0,030

5,00E-05

16

ENSG00000110243

chr11

116660083

116663136

APOA5

116519

0,034

1,68E-02

10

ENSG00000163749

chr4

77234154

77343021

CCDC158

339965

0,034

3,55E-02

12

ENSG00000175773

chr11

130184888

130263688

NA

NA

0,039

7,27E-05

14

ENSG00000121410

chr19

58856544

58864865

A1BG

1

0,050

1,42E-02

12

ENSG00000268895

chr19

58859117

58866549

A1BG-AS1

503538

0,054

2,79E-03

12

Genome-wide tiling regions

258039

chr7

56515001

56520000

  

−0,046

2,44E-02

15

278217

chr7

157405001

157410000

  

−0,044

4,02E-02

14

504201

chr17

20795001

20800000

  

−0,039

2,28E-02

13

478486

chr15

85110001

85115000

  

−0,020

6,65E-04

11

533197

chr19

6495001

6500000

  

−0,014

1,94E-02

12

41882

chr1

209405001

209410000

  

−0,010

1,88E-02

10

447146

chr14

35760001

35765000

  

−0,005

4,10E-02

10

55422

chr2

27850001

27855000

  

0,011

2,56E-02

20

91567

chr2

208575001

208580000

  

0,014

1,66E-02

12

481683

chr15

101095001

101100000

  

0,021

2,99E-03

11

340633

chr10

22765001

22770000

  

0,024

1,52E-02

11

96502

chr2

233250001

233255000

  

0,027

4,67E-02

11

107815

chr3

46615001

46620000

  

0,032

5,47E-03

10

137680

chr3

195940001

195945000

  

0,033

2,59E-02

13

507646

chr17

38020001

38025000

  

0,038

2,43E-03

11

213529

chr6

5085001

5090000

  

0,039

4,10E-02

14

206237

chr5

149545001

149550000

  

0,045

2,93E-02

13

549738

chr20

30070001

30075000

  

0,047

3,07E-02

12

66673

chr2

84105001

84110000

  

0,050

2,35E-08

11

543670

chr19

58860001

58865000

  

0,065

7,02E-04

10