Table 2 Alignment of VP3 proteins of different EV71 subgenogroups and escape mutants*.
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | Majority |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  |  |  |  |  |  |  | 50 |  |  |  |  |  |  |  | 60 |  |  |  |  |  |  |  | 70 |  |  |  |  |  |  |  | 80 |  |  |  |  |  |  |  |  |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | A BrCr VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | B2 7423-MS-87 VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | B4 5865-SIN-000009 VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | B5_NUH0083_VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | C2 NUH007-SIN-08-VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | S | A | Q | A | G | K | G | C4 yama lab strain VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | L | A | Q | A | G | K | G | E1 5H7 + A VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | L | A | Q | A | G | K | G | E2 5H7 + C2 VP3.pro |
R | N | L | L | E | L | C | Q | V | E | T | I | L | E | V | N | N | V | P | T | N | A | T | S | L | M | E | R | L | R | F | P | V | L | A | Q | A | G | K | G | E3 5H7 + C4 VP3.pro |
R | N | L | L | E | I | C | R | V | E | T | I | L | E | V | N | N | L | Q | S | N | E | T | T | P | M | Q | R | L | C | F | P | V | S | V | Q | S | K | T | G | CA16 U05876 VP3.pro |