Table 1 Changes in expression levels of proteins proposed to comprise the strain CPTF global iron starvation response.
From: Mixed heavy metal stress induces global iron starvation response
Protein (GenBank ID) | Log2-fold expression change during metal exposurea | Reference organism | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
COMM | U | Al | Mn | Fe | Co | Cu | Cd | Ni | ||
(i) Siderophore biosynthesis and transport | ||||||||||
Isochorismate synthase DhbC (UIJ68570.1) | +6.8b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [53] |
Isochorismatase DhbB (UIJ68572.1) | +9.6b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [53] |
2,3-dihydroxybenzoate adenylate synthase DhbE (UIJ68571.1) | +6.4b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [53] |
MFS di-tripeptide cation symporter (UIJ66957.1) | +8.8b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | +7.6b | n.s. | +6.8b | This work |
Fe-bacillibactin uptake system substrate-binding protein FeuA (UIJ66957.1) | + 10.5b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | +5.9b | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [53] |
(ii) Aromatic amino acid biosynthesis | ||||||||||
Tryptophan synthase subunit beta TrpB (UIJ67623.1) | −10.9b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | This work |
Anthranilate phosphoribosyltransferase TrpD (UIJ67620.1) | −8.6b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | This work |
Anthranilate synthase TrpE (UIJ67618.1) | −7.3 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | This work |
Prephenate dehydrogenase TyrA (UIJ69055.1) | −1.1 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | This work |
(iii) Iron scavenging | ||||||||||
Heme monooxygenase A (UIJ69081.1) | +4.6 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [56] |
Heme monooxygenase B (UIJ67406.1) | +1.6 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus anthracis str. Sterne [56] |
(iv) Iron sparing | ||||||||||
Flavodoxin Fld (UIJ64511.1) | +8.3b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [53] |
Ferredoxin-dependent assimilatory sulfite reductase Sir (CysI) (UIJ67790.1) | −2.3 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Pseudomonas aeruginosa [64] |
Glutamate synthase GltB (UIJ66883.1) | −1.0 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [63] |
Nitrate reductase subunit beta NarH, (UIJ68393.1) | −2.1 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | −1.1 | Escherichia coli [61] |
(v) Sulfur assimilation | ||||||||||
Sulfate adenylyltransferase CysN (UIJ67788.1) | −1.2 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [62] |
Adenylyl-sulfate kinase CysC (UIJ67789.1 | −1.4 | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Bacillus subtilis [62] |
Fmnh2-dependent alkanesulfonate monooxygenase SsuD (UIJ69025.1) | −6.7b | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | Pseudomonas aeruginosa [64] |
