Table 1 Differential expression of genes associated with CD4 T cell anergy and regulatory T cells.
Gene | S2D vs. C2D | S4D vs. C4D | ||
|---|---|---|---|---|
Log2FI | Adj. p-value | Log2FI | Adj. p-value | |
Anergy | ||||
Satb1 | 0,304 | 0,012 | 0,002 | 0,997 |
Cd7 | 0,750 | 0,001 | 0,166 | NA |
Rap1a | 0,030 | 0,894 | −0,223 | 0,116 |
Itch | 0,087 | 0,613 | −0,065 | 0,816 |
Rnf128 | −0,077 | 0,858 | −0,321 | 0,186 |
Dtx1 | −0,039 | 0,908 | 0,047 | 0,921 |
Izumo1r | −0,090 | 0,573 | −0,251 | 0,094 |
Cblb | −0,403 | 8,40E-06 | −0,656 | 3,74E-07 |
Dgka | 0,282 | 0,001 | −0,215 | 0,114 |
Nr4a1 | 0,148 | 0,189 | 0,426 | 1,1E-04 |
Pdcd1 | −0,568 | 3,9E-11 | −0,144 | 0,612 |
Regulatory T cells | ||||
Foxp3 | 0,815 | 7,85E-09 | −0,352 | 0,095 |
Ctla4 | 0,109 | 0,535 | −0,691 | 1,19E-07 |
Nrp1 | 0,048 | 0,859 | 0,015 | 0,975 |
Pdcd1 | −0,568 | 3,90E-11 | 0,144 | 0,612 |
Lag3 | −0,721 | 1,81E-11 | −0,540 | 5,44E-07 |
Havcr2 | −0,166 | 0,668 | −0,177 | 0,620 |
Lrrc32 | 0,527 | 0,044 | −0,268 | 0,345 |
Tgfb1 | −0,148 | 0,197 | −0,164 | 0,473 |
Ikzf2 | 0,438 | 0,117 | −0,558 | 0,00027 |
Il7r | 1,504 | 6,21E-15 | −0,040 | 0,914 |
Entpd1 | 0,402 | 0,163 | −0,004 | 0,995 |
Type 1 Regulatory T cells | ||||
Il10 | −0,236 | 0,492 | −1,069 | 4,01E-10 |
Eomes | 0,136 | 0,477 | −0,193 | 0,351 |
Il2rb | 0,171 | 0,367 | −0,069 | 0,808 |
Itga4 | 0,536 | 0,027 | −0,260 | 0,178 |
Itgb7 | −0,578 | 1,78E-06 | 0,047 | 0,878 |
Ly6c1 | 0,200 | 0,233 | −0,190 | 0,511 |
Tigit | −0,387 | 0,001 | −0,500 | 0,001 |