Table 1 One possible combination of parameters with which the tLIR model of¹¹ fits empirical data well. We are restricting r to be in the range [10⁻¹⁰, 10⁻⁶] as was done by¹¹.

Cancer	k	r	R ²	Stem cell	Division rate	Generation¹	Risk
AML	4.8	1.000e − 06	1.00	1.35e + 08	12.000	1047.01	4.651e − 03
BCC	4.5	1.000e − 06	0.98	5.82e + 09	7.600	678.44	2.181e − 04
CLL	4.9	1.000e − 06	0.99	1.35e + 08	12.000	1047.01	6.925e − 03
COAD	5.5	5.012e − 07	1.00	2.00e + 08	73.000	6232.58	5.677e − 02
DUAD	5.3	1.000e − 06	1.00	4.00e + 06	24.000	2061.93	3.714e − 04
ESCA	4.5	5.012e − 07	0.99	8.64e + 05	17.400	1498.72	3.106e − 03
GBNPAD	3.5	1.000e − 06	0.85	1.60e + 06	0.584	70.25	1.896e − 03
GBM*				1.35e + 08	0.000	27.01	3.825e − 03
HNSC	3.8	1.995e − 07	0.99	1.85e + 07	21.500	1851.64	1.730e − 02
LHCA	3.6	1.000e − 06	0.94	3.01e + 09	0.912	109.05	7.079e − 03
LUAD	2.8	7.943e − 08	0.83	1.22e + 09	0.070	36.13	2.304e − 02
MBM*				1.36e + 08	0.000	27.02	1.414e − 04
SKCM	3.8	1.000e − 06	1.00	3.80e + 09	2.480	242.62	3.038e − 02
OSARC	1.0	1.585e − 08	0.96	4.18e + 06	0.067	27.69	2.696e − 04
OSARCA	1.0	6.310e − 07	0.96	6.50e + 05	0.067	25.01	2.527e − 05
OSARCH	3.0	1.000e − 06	0.99	8.60e + 05	0.067	25.41	1.660e − 05
OSARCL	1.0	3.981e − 07	0.96	1.59e + 06	0.067	26.30	1.312e − 04
OSARCP	3.1	1.000e − 06	0.91	4.50e + 05	0.067	24.47	3.229e − 05
OVGC*				1.10e + 07	0.000	23.39	7.638e − 05
PDAD	3.8	1.000e − 06	0.92	4.18e + 09	1.000	116.96	1.016e − 02
PECA	3.6	1.000e − 06	0.99	7.40e + 07	1.000	111.14	1.498e − 04
SIAD	5.0	5.012e − 07	1.00	1.00e + 08	36.000	3086.58	8.013e − 04
TGCC	1.9	7.943e − 07	0.96	7.20e + 06	5.800	515.78	2.244e − 03
TPFC	3.1	1.000e − 06	0.98	6.50e + 07	0.087	33.35	6.922e − 03
TMCA	3.1	7.943e − 07	0.93	6.50e + 06	0.087	30.03	8.707e − 05

¹Assuming lifetime is 85 years old, stem cells go through \({\mathrm{log}}_{2}S+d\cdot 85\) generations.
*Cancers of which parameter estimates are impossible because division rate is 0.

Quick links

Search