Table 1 Identification of significantly DE miRNAs.
From: Transcriptomic Analysis of mRNA-lncRNA-miRNA Interactions in Hepatocellular Carcinoma
miRNA | Chr. Location | log2FC | Pval | Padj | Family | Cluster |
|---|---|---|---|---|---|---|
miR-199a-3p | 19p13.2/1q24.3 | −2.94 | 0e + 00 | 0e + 00 | mir − 199 | mir-199a-2/mir-3120/mir-214 |
miR-10a-5p | 17q21.32 | −2.36 | 8e − 07 | 8e − 05 | mir − 10 | NA |
miR-125b-5p | 11q24.1/21q21.1 | −1.84 | 5e − 05 | 3e − 03 | mir − 10 | NA |
miR-223-5p | Xq12 | −1.95 | 6e − 05 | 3e − 03 | mir − 223 | NA |
miR-378a-3p | 5q32 | −1.62 | 8e − 05 | 3e − 03 | mir − 378 | NA |
miR-101-3p | 1p31.3/9p24.1 | −1.59 | 1e − 04 | 5e − 03 | mir − 101 | mir-101-1/mir-3671 |
miR-423-5p | 17q11.2 | 2.17 | 3e − 04 | 9e − 03 | mir − 423 | mir-423/mir-3184 |
miR-1-3p | 18q11.2/20q13.33 | −1.96 | 4e − 04 | 1e − 02 | mir − 1 | mir-1-2/mir-133a-1 |
miR-30a-5p | 6q13 | −1.53 | 4e − 04 | 1e − 02 | mir − 30 | NA |
miR-15b-3p | 3q25.33 | 2.03 | 5e − 04 | 1e − 02 | mir − 15 | mir-15b/mir-16-2 |
miR-195-5p | 17p13.1 | −2.02 | 7e − 04 | 1e − 02 | mir − 15 | mir-497/mir-195 |
miR-130b-3p | 22q11.21 | 2.74 | 7e − 04 | 1e − 02 | mir − 130 | mir-301b/mir-130b |
miR-100-5p | 11q24.1 | −1.83 | 1e − 03 | 1e − 02 | mir − 10 | mir-100/let-7a-2 |
miR-1306-5p | 22q11.21 | 1.57 | 2e − 03 | 3e − 02 | mir − 1306 | mir-3618/mir-1306 |
miR-222-3p | Xp11.3 | 1.52 | 3e − 03 | 4e − 02 | mir − 221 | mir-222/mir-221 |
miR-199a-5p | 19p13.2/1q24.3 | −3.55 | 3e − 03 | 4e − 02 | mir − 199 | mir-199a-2/mir-3120/mir-214 |
