Table 4 Genotypes at three positions of MC1R gene in the domestic pig (DP) and wild boar (WB) reference dataset. Wild-type alleles are in bold.

DP

83

38

A

E^D2/E^D2 E^P1/2/3/E^P1/2/3 E^D2/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/E^D1 E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 E^D1/E^D1 E^D1/E^D2 E^D1/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/e E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 e/e e^/E^D2 e/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3 E^P1/2/3/E^P1/2/3

E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3

45

G/A

E^+/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 E^D1/E^D2 E^D1/E^P1/2/3 e/E^D2 e/E^P1/2/3

G/A

e/E⁺ e/E^D2 e/E^D1 e/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/e E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 e/e e/E^D2 e/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3 E^P1/2/3/E^P1/2/3

e/E^D2 e/E^P1/2/3

WB

164*

138

G

E^+/E⁺ E⁺/E^D1 E⁺/e E^D1/E^D1 e/e e/E^D1

G

E^+/E⁺ E⁺/E^D1 E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 E^D1/E^D1 E^D1/E^D2 E^D1/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/e E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 e/e e^/E^D2 e/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3 E^P1/2/3/E^P1/2/3

E^+/E⁺

25

G/A

E^+/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 E^D1/E^D2 E^D1/E^P1/2/3 e/E^D2 e/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/E^D1 E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 E^D1/E^D1 E^D1/E^D2 E^D1/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/e E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 e/e e/E^D2 e/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3 E^P1/2/3/E^P1/2/3

E^+/E^D2 E⁺/E^P1/2/3

1

A

E^D2/E^D2 E^P1/2/3/E^P1/2/3 E^D2/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/E^D1 E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 E^D1/E^D1 E^D1/E^D2 E^D1/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3

G

E^+/E⁺ E⁺/e E⁺/E^D2 E⁺/E^P1/2/3 e/e e/E^D2 e/E^P1/2/3 E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3 E^P1/2/3/E^P1/2/3

E^D2/E^D2 E^D2/E^P1/2/3