Table 3 Conformational epitopes of the designed protein as predicted by ElliPro.

From: In silico analysis and in vivo assessment of a novel epitope-based vaccine candidate against uropathogenic Escherichia coli

No.

Residues

Number of residues

Score

1

A:Y7, A:D9, A:E10, A:S11, A:L12, A:R13, A:F14, A:P16, A:F17, A:P18, A:T19, A:V20, A:N21, A:A22, A:N23, A:Q25, A:N57, A:H58, A:K59, A:I60, A:Y61, A:T62, A:T63, A:G64, A:R65, A:Y66, A:Y67, A:P68, A:D105, A:D106, A:F107, A:I108, A:D109, A:Y110, A:T111, A:Q112, A:Q113, A:Q114, A:K115, A:I116, A:A117, A:A118, A:G119, A:K120, A:A121, A:I122, A:S123, A:A124, A:D125, A:A126, A:I127, A:P128

52

0.752

2

A:T258, A:L259, A:K260, A:A261, A:A262, A:V295, A:V296, A:D297, A:L298, A:S299, A:T300, A:Q301, A:I302, A:F303, A:R320, A:G321, A:S322, A:A323, A:Y324, A:G325, A:G326, A:V327, A:L328, A:S329, A:S330, A:F331, A:S332, A:K361, A:P362, A:W363, A:P364, A:V365, A:A366, A:L367, A:Y368, A:L369, A:T370, A:P371, A:V372, A:S373, A:S374, A:A375, A:G376, A:G377, A:V378, A:A379, A:I380, A:K381, A:A382, A:G383, A:S384, A:L385, A:I386, A:A387, A:V388, A:V405, A:W406, A:N407

58

0.745

3

A:L1, A:V2, A:G3, A:Q4, A:V5, A:F29, A:S31, A:S32, A:Q33, A:Q34, A:D35, A:T36, A:D37, A:Q38, A:Y39, A:G40, A:M41, A:K42, A:A43, A:K44, A:F45, A:V46, A:A47, A:A48, A:W49, A:L79, A:S81, A:S82, A:Y83, A:D84, A:I85, A:N86, A:D87, A:I88, A:F89, A:T90, A:V91, A:G93, A:V95, A:Y97, A:L143, A:L144, A:M145, A:H146, A:I147, A:T148, A:E149, A:R150, A:Q151, A:A153, A:W208, A:G212, A:D213, A:N214, A:L215

55

0.735