Table 2 Size of stems and loops of 22 tRNA genes in the mitogenomes of 37 species of Carangidae.

From: Comparative mitogenomics and phylogenetics of the family Carangidae with special emphasis on the mitogenome of the Indian Scad Decapterus russelli

tRNA

AA stem (bp)

DHU stem (bp)

DHU loop (nucleotide)

AC stem (bp)

V loop (nucleotide)

TΨU stem (bp)

TΨU loop (nucleotide)

6

7

8

0

3

4

5

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

5

6

3

4

5

4

5

6

6

7

8

9

H strand coded

Phe

 

35

2

 

12

25

   

24

 

13

      

37

  

37

 

37

    

37

 

Val

 

35

2

 

33

4

      

4

 

33

   

37

  

37

  

37

  

37

  

Leu(TAA)

 

37

   

37

        

21

16

  

37

  

37

  

37

  

37

  

Ile

 

18

19

 

37

     

1

36

      

37

   

37

 

37

  

26

11

 

Met

 

2

35

 

8

29

   

7

18

12

      

37

  

34

3

1

36

  

36

1

 

Trp

 

37

   

37

     

36

1

     

37

  

37

  

37

  

37

  

Asp

 

36

1

  

37

    

3

34

      

37

  

37

  

37

  

37

  

Lys

 

33

4

 

36

1

        

1

6

29

1

37

   

37

37

     

37

Gly

 

37

   

37

    

28

6

3

     

37

  

37

  

37

  

37

  

Arg

 

31

6

  

37

   

37

        

37

  

37

  

37

  

37

  

His

 

37

   

37

   

3

2

32

      

37

  

11

26

 

37

  

37

  

Ser(GCT)

 

3

34

34

           

6

30

1

7

30

31

6

   

37

 

37

  

Leu(TAG)

 

37

   

37

      

37

     

37

   

37

 

37

  

37

  

Thr

 

37

   

37

    

3

32

2

     

37

   

37

 

37

  

37

  

L strand coded

Gln

 

32

5

  

37

     

37

      

37

  

37

  

37

  

37

  

Ala

 

20

17

  

37

   

37

        

37

  

37

  

37

  

37

  

Asn

 

37

   

27

10

   

14

 

23

     

37

   

37

 

37

  

37

  

Cys

  

37

 

5

32

 

23

14

         

37

  

37

  

37

 

2

35

  

Tyr

 

37

   

37

    

34

3

      

37

  

37

  

37

  

37

  

Ser(TGA)

37

   

37

        

37

    

37

  

37

  

37

  

37

  

Glu

 

32

5

  

37

   

37

        

37

  

37

  

37

  

37

  

Pro

 

32

5

  

37

     

36

1

     

37

  

34

  

37

  

37