Table 2 Size of stems and loops of 22 tRNA genes in the mitogenomes of 37 species of Carangidae.
tRNA | AA stem (bp) | DHU stem (bp) | DHU loop (nucleotide) | AC stem (bp) | V loop (nucleotide) | TΨU stem (bp) | TΨU loop (nucleotide) | |||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6 | 7 | 8 | 0 | 3 | 4 | 5 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 5 | 6 | 3 | 4 | 5 | 4 | 5 | 6 | 6 | 7 | 8 | 9 | |
H strand coded | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phe | 35 | 2 | 12 | 25 | 24 | 13 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||
Val | 35 | 2 | 33 | 4 | 4 | 33 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||
Leu(TAA) | 37 | 37 | 21 | 16 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
Ile | 18 | 19 | 37 | 1 | 36 | 37 | 37 | 37 | 26 | 11 | ||||||||||||||||||||
Met | 2 | 35 | 8 | 29 | 7 | 18 | 12 | 37 | 34 | 3 | 1 | 36 | 36 | 1 | ||||||||||||||||
Trp | 37 | 37 | 36 | 1 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
Asp | 36 | 1 | 37 | 3 | 34 | 37 | 37 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||
Lys | 33 | 4 | 36 | 1 | 1 | 6 | 29 | 1 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||
Gly | 37 | 37 | 28 | 6 | 3 | 37 | 37 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||
Arg | 31 | 6 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
His | 37 | 37 | 3 | 2 | 32 | 37 | 11 | 26 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||
Ser(GCT) | 3 | 34 | 34 | 6 | 30 | 1 | 7 | 30 | 31 | 6 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||
Leu(TAG) | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||||
Thr | 37 | 37 | 3 | 32 | 2 | 37 | 37 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||
L strand coded | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gln | 32 | 5 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
Ala | 20 | 17 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
Asn | 37 | 27 | 10 | 14 | 23 | 37 | 37 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||
Cys | 37 | 5 | 32 | 23 | 14 | 37 | 37 | 37 | 2 | 35 | ||||||||||||||||||||
Tyr | 37 | 37 | 34 | 3 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
Ser(TGA) | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||||
Glu | 32 | 5 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | 37 | ||||||||||||||||||||||
Pro | 32 | 5 | 37 | 36 | 1 | 37 | 34 | 37 | 37 | |||||||||||||||||||||