Table 3 Molecular docking binding energy of ligand with receptor (kJ/mol).
Ligand—Receptor | CASP3 | EGFR | IL-1β | JUN | MAPK1 | mTOR | STAT3 | TNF-α | VEGFA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
20(R)-Ginsenoside Rg3 | − 7.7 | − 9.8 | − 7.3 | − 6.3 | − 8.7 | − 7.2 | − 7.7 | − 7.6 | − 8.9 |
20(S)-Ginsenoside Rg3 | − 7.3 | − 9.5 | − 7.7 | − 6.3 | − 8.4 | − 6.3 | − 8.6 | − 7.3 | − 9.4 |
20(R)-Panaxadiol | − 8.3 | − 8.4 | − 7.2 | − 7 | − 8 | − 7.3 | − 7.6 | − 7.2 | − 7.7 |
20(R)-Protopanaxatriol | − 8.3 | − 8.1 | − 7 | − 6.4 | − 8 | − 7.2 | − 8.1 | − 7.4 | − 7.5 |
20(R)-Ginsenoside Rg2 | − 8.2 | − 8.8 | − 7.3 | − 6.5 | − 7.5 | − 8.1 | − 7.6 | − 7.3 | − 8.3 |
Ginsenoside C-K | − 7.8 | − 8.6 | − 7.2 | − 6.5 | − 8 | − 7 | − 7.5 | − 6.8 | − 9 |
Ginsenoside F2 | − 8 | − 9.4 | − 7 | − 6.3 | − 7.7 | − 7.9 | − 7.5 | − 6.8 | − 8.2 |
Ginsenoside F4 | − 8.8 | − 8.6 | − 7.7 | − 6.7 | − 7.9 | − 8.1 | − 7.5 | − 8 | − 9.5 |
Ginsenoside Rb2 | − 8.2 | − 9 | − 7.3 | − 6.1 | − 7.9 | − 6.3 | − 7.9 | − 7.6 | − 9.7 |
Ginsenoside Rc | − 8 | − 9.1 | − 7 | − 6.3 | − 7.1 | − 7 | − 8 | − 7.2 | − 9.7 |
Ginsenoside Re | − 8 | − 8.2 | − 7 | − 6.7 | − 7.6 | − 7.3 | − 7.5 | − 6.9 | − 9.5 |
Ginsenoside Rf | − 7.8 | − 8.2 | − 6.6 | − 6.6 | − 8.2 | − 7.5 | − 7.7 | − 7.5 | − 9 |
Ginsenoside Rg1 | − 7.1 | − 9 | − 6.6 | − 6 | − 7.2 | − 7.2 | − 6.9 | − 7.3 | − 8.2 |
20(S)-Ginsenoside Rg5 | − 8.2 | − 9.7 | − 7.8 | − 6.6 | − 8.9 | − 7.6 | − 8.5 | − 7.8 | − 9.1 |
20(S)-Ginsenoside Rh1 | − 8.3 | − 8.5 | − 7.1 | − 6.1 | − 7.8 | − 7.1 | − 7.1 | − 7.1 | − 7.8 |
20(S)-Ginsenoside Rh2 | − 9.2 | − 9.2 | − 7.3 | − 6.1 | − 8.1 | − 7.2 | − 8 | − 7.7 | − 8.2 |
Ginsenoside Rh4 | − 8.3 | − 8.9 | − 7.4 | − 6.4 | − 7.8 | − 7.4 | − 7 | − 7.2 | − 8 |
Ginsenoside Rk1 | − 8 | − 8.7 | − 7.9 | − 6.5 | − 8.7 | − 7 | − 8.5 | − 7.6 | − 8.1 |
Ginsenoside Ro | − 8 | − 9.9 | − 7.5 | − 7.3 | − 8.1 | − 7.9 | − 8.2 | − 8 | − 9.4 |
Ginsenoside Rs1 | − 7.9 | − 9.2 | − 7.9 | − 6.6 | − 7.9 | − 7.1 | − 7.5 | − 8 | − 9.3 |
Ginsenoside Rs3 | − 8 | − 9.4 | − 7.4 | − 6.5 | − 8.2 | − 6.8 | − 8.5 | − 7.4 | − 8.8 |
Ginsenoside Rb1 | − 7.3 | − 9.2 | − 6.8 | − 7 | − 7.4 | − 7.5 | − 7.1 | − 6.8 | − 9.2 |
Ginsenoside Rb3 | − 7.7 | − 9 | − 7.1 | − 6.8 | − 8.2 | − 6.2 | − 8.3 | − 6.7 | − 9.5 |
Ginsenoside Rd | − 7.6 | − 8.7 | − 6.9 | − 6.8 | − 7.2 | − 6.6 | − 8.6 | − 6.6 | − 10 |
Malonyl Ginsenoside Rd | − 7.5 | − 8.8 | − 7.3 | − 6.9 | − 7.5 | − 7.2 | − 7.8 | − 7.4 | − 8.6 |
Malonyl-Ginsenoside Rb1 | − 8.6 | − 8.9 | − 6.9 | − 5.9 | − 7.7 | − 7.2 | − 8.3 | − 8.4 | − 9 |
20(R)-Protopanaxadiol | − 8.1 | − 8.4 | − 6.6 | − 6.5 | − 7.7 | − 7.1 | − 7.7 | − 7.3 | − 8.4 |
Vina-Ginsenoside R4 | − 7.7 | − 9.6 | − 7.1 | − 6.5 | − 7.5 | − 7.4 | − 7.9 | − 7.8 | − 9.8 |
