Table 1 Distribution of 99 virulence-associated genes in Streptococcus suis serotype 1.

From: Genomic comparison of two Streptococcus suis serotype 1 strains recovered from porcine and human disease cases

No.

Virulence-associated genes

ID38828

ID35541

Potential zoonotic virulent factor

1

cbp40omp40

 + 

 + 

Yes

2

Fhb-1

 + 

 + 

Yes

3

Fhb-2 (Streptococcal adhesin P or sadP)

 + 

Yes

4

hylA

 + 

 + 

Yes

5

Hhly3

Yes

6

IdeS

 + 

 + 

Yes

7

IgA protease (zmp)

 + 

 + 

Yes

8

IgdE

 + 

 + 

Yes

9

mrp

 + 

 + $

Yes

10

neuB

 + 

 + 

Yes

11

NisK

Yes

12

NisR

Yes

13

pnuC

 + 

 + 

Yes

14

rfeA (RTX toxin)

 + 

 + 

Yes

15

rgg

 + 

 + 

Yes

16

sly

 + 

 + 

Yes

17

SP1

 + 

 + 

Yes

18

sbp1 (srtBCD cluster)

 + 

 + 

Yes

19

sbp2 (srtBCD cluster)

 + 

 + 

Yes

20

tran

 + 

 + 

Yes

21

1910HK

 + 

 + 

No

22

1910HR

 + 

 + 

No

23

6-phosphogluconate dehydrogenase

 + 

 + 

No

24

103-adhesion protein

 + 

 + 

No

25

Abpb

 + 

 + 

No

26

AdcR

 + 

 + 

No

27

Amylopullulanase

 + 

 + 

No

28

Arginine deiminase

 + 

 + 

No

29

Autolysin

 + 

 + 

No

30

CcpA

 + 

 + 

No

31

cdd

 + 

 + 

No

32

ciaHR

 + 

 + 

No

33

Collagenase

 + 

 + 

No

34

CovR

 + 

 + 

No

35

Dipeptidylpeptidase IV

 + 

 + 

No

36

dltA

 + 

 + 

No

37

Dpr

 + 

 + 

No

38

Endo-b-N-acetylglucosaminase D

 + 

 + 

No

39

Enolase

 + 

 + 

No

40

epf

 + 

 + #

No

41

FbpS

 + 

 + 

No

42

FeoB

 + 

 + 

No

43

Fur

 + 

 + 

No

44

GAPDH

 + 

 + 

No

45

gh92

 + 

 + 

No

46

Glutamate dehydrogenase

 + 

 + 

No

47

Glutamine synthetase

 + 

 + 

No

48

gpmA-38 KDa protein

 + 

 + 

No

49

gtfA

 + 

 + 

No

50

guaAB

 + 

 + 

No

51

HP0245

 + 

 + 

No

52

HtpS

 + 

 + 

No

53

ihk

 + 

 + 

No

54

irr

 + 

 + 

No

55

Lgt

 + 

 + 

No

56

lmb

 + 

 + 

No

57

lspA lipoprotein

 + 

 + 

No

58

LuxS

 + 

 + 

No

59

manN

 + 

 + 

No

60

Mannose specific EIIAB

 + 

 + 

No

61

nadR

 + 

 + 

No

62

oppA

 + 

 + 

No

63

OFS-serum opacity factor

 + 

 + 

No

64

Peptidase-SSU0458

 + 

 + 

No

65

Permease-SSU0501

 + 

 + 

No

66

Permease-SSU0835

 + 

 + 

No

67

pgdA

 + 

 + 

No

68

prsA

 + 

 + 

No

69

purA

 + 

 + 

No

70

purD

 + 

 + 

No

71

revS

 + 

 + 

No

72

salK/salR

No

73

Surface antigen one (sao)

 + 

 + 

No

74

scrB

 + 

 + 

No

75

scrR

 + 

 + 

No

76

serS

 + 

 + 

No

77

sntA

 + 

 + 

No

78

sodA

 + 

 + 

No

79

Spy-M3-0908

 + 

 + 

No

80

srtA

 + 

 + 

No

81

srtF

 + 

 + 

No

82

srtG

No

83

ssa

 + 

 + 

No

84

ssadS

 + 

 + 

No

85

ssnA-nuclease

 + 

 + 

No

86

sspA

 + 

 + 

No

87

SSU05-0473

 + 

 + 

No

88

SSU05-1311

 + 

 + 

No

89

SMU61-like (SSU05-0053)

 + 

 + 

No

90

ssPep

 + 

 + 

No

91

Stp

 + 

 + 

No

92

treR

 + 

 + 

No

93

Trigger factor

 + 

 + 

No

94

TroA

 + 

 + 

No

95

virA

 + 

 + 

No

96

virB4

No

97

virD4-TraG

No

98

yzpA

 + 

 + 

No

99

zur

 + 

 + 

No

  1. #Was a large variant epf (epf*).
  2. $Was a small variant mrps.