Table 1 The detail of primers used for qPCR.

From: Antiviral effect of melatonin on Japanese encephalitis virus infection involves inhibition of neuronal apoptosis and neuroinflammation in SH-SY5Y cells

Gene name

PrimePCR assay ID (Bio-Rad Laboratories)

Ta (°C)

TNFα

qHsaCED0037461

60

NFκB

qHsaCED00025636

60

 

Primer sequence (5′-3′)

 

BAX

Forward primer

CCCGAGAGGTCTTTTTCCGAG

60

Reverse primer

CCAGCCCATGATGGTTCTGAT

BCL2

Forward primer

TCGCCCTGTGGATGACTGA

60

Reverse primer

CAGAGACAGCCAGGAGGAATCA

CAS3

Forward primer

ACATGGCGTGTCATAAAATACC

60

Reverse primer

CACAAAGCGACTGGATGAAC

CAS9

Forward primer

CTCAGACCAGAGATTCGCAA

65

Reverse primer

CTCAAGAGCACCGACATCAC

COX2

Forward primer

CCCTTGGGTGTCAAAGGTAA

60

Reverse primer

GCCCTCGCTTATGATCTGTC

TRL3

Forward primer

TTGCCTTGTATCTACTTTTGGGG

60

Reverse primer

TCAACACTGTTATGTTTGTGGGT

TRL7

Forward primer

GATAACAATGTCACAGCCGTCC

56

Reverse primer

GTTCCTGGAGTTTGTTGATGTTC

GAPDH

Forward primer

CAGCCTCAAGATCATCAGCA

60

Reverse primer

TGTGGTCATGACTCCTTCCA