Table 4 Molecular docking study of the target compounds with DHFR.
From: Geo-environmental factors and the effectiveness of mulberry leaf extract in managing malaria
Compound codes | Binding Affinity (Kcal/mol) | Hydrogen bond | Hydrophobic bond Amino acid | Neutral amino acid | |
|---|---|---|---|---|---|
Amino acid | Bond length (A˚) | ||||
1 | − 8.029 | – | – | TYR A: 167, LEU | |
A:162, ILEA:10, | |||||
PHE A:171, ALA | NDP A: | ||||
A:12, TYR A:179, | 1239, | ||||
ILE A:13, ILE A: | CP A:61,240 | ||||
172, LEU A:45, | |||||
ALA A:15, TRP | |||||
A:47, ALA A:12 | |||||
2 | − 7.997 | – | – | ALA A:15, CYS A: | |
14, TYR A: 179, | |||||
ALA A:12, ILE A: | NDP A: | ||||
172, VAL A: 112, | 1239, CP A: | ||||
LEU A: 158, ILE | 61,240 | ||||
A:10, LEU A: 162, | |||||
CYS A: 170, VAL | |||||
A:110 | |||||
3 | − 6.031 | CP A: 6124 | 2.30 | ILE A:172, ALA A:12, ILE A:13 | – |
TYR A: 11 TYR A:179 | 3.10 2.75 | ||||
TYR A: 11 | 2.85 | ||||
Std | − 7.813 | ILE A:13 | 2.93 | ILE172, ILE188, | – |
ILE A:10, CYS | |||||
A:182, ALA A: 12, | |||||
VAL A: 178, TYR A | |||||
:179, TYR A: 56 | |||||
