Table 3 Correlation analysis between PKM2 and marker genes of immune cells in GEPIA.
From: PKM2 is a potential prognostic biomarker and related to immune infiltration in lung cancer
Description | Gene markers | LUAD | LUSC | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Normal | Tumor | Normal | Tumor | ||||||
R | p | R | p | R | p | R | p | ||
CD8+ T cell | CD8A | 0.023 | 0.86 | − 0.061 | 0.18 | − 0.11 | 0.46 | − 0.18 | *** |
T cell (general) | CD3D | − 0.12 | 0.37 | − 0.14 | ** | − 0.094 | 0.52 | − 0.24 | *** |
CD3E | − 0.045 | 0.74 | − 0.16 | *** | − 0.052 | 0.72 | − 0.21 | *** | |
CD2 | − 0.11 | 0.41 | − 0.13 | ** | − 0.073 | 0.61 | − 0.22 | *** | |
B cell | CD19 | 0.021 | 0.88 | − 0.27 | *** | 0.054 | 0.71 | − 0.16 | *** |
CD79A | 0.035 | 0.79 | − 0.28 | *** | − 0.1 | 0.48 | − 0.19 | *** | |
Neutrophils | CD66b | 0.029 | 0.83 | − 0.11 | * | 0.13 | 0.37 | − 0.1 | * |
CCR7 | 0.081 | 0.54 | − 0.18 | *** | 0.0036 | 0.98 | − 0.18 | *** | |
Dendritic cell | HLA-DPB1 | 0.17 | 0.2 | − 0.12 | ** | 0.35 | * | − 0.13 | ** |
HLA-DQB1 | − 0.044 | 0.74 | − 0.11 | * | − 0.076 | 0.6 | − 0.083 | 0.067 | |
HLA-DRA | 0.12 | 0.38 | − 0.091 | * | 0.22 | 0.13 | − 0.13 | ** | |
HLA-DPA1 | 0.15 | 0.26 | − 0.071 | 0.12 | 0.056 | 0.27 | − 0.13 | ** | |
CD1C | − 0.12 | 0.38 | − 0.12 | * | 0.12 | 0.39 | − 0.072 | 0.11 | |
ITGAX | 0.35 | ** | − 0.037 | 0.42 | 0.3 | * | − 0.089 | * | |
Th1 | T-bet | − 0.099 | 0.46 | 0.094 | * | 0.069 | 0.63 | − 0.21 | *** |
STAT4 | − 0.11 | 0.41 | − 0.002 | 0.97 | − 0.12 | 0.4 | − 0.083 | ** | |
STAT1 | 0.0099 | 0.94 | 0.26 | *** | 0.36 | ** | 0.029 | 0.53 | |
IFN-γ | − 0.17 | 0.2 | 0.057 | 0.21 | − 0.26 | 0.07 | − 0.12 | ** | |
Tfh | IL21 | − 0.008 | 0.95 | 0.026 | 0.56 | 0.043 | 0.77 | − 0.17 | *** |
Th17 | STAT3 | 0.14 | 0.29 | 0.11 | * | 0.3 | * | 0.16 | *** |
Treg | FOXP3 | 0.15 | 0.25 | − 0.021 | 0.64 | 0.077 | 0.6 | − 0.12 | ** |
STAT5B | − 0.054 | 0.69 | − 0.055 | 0.23 | 0.2 | 0.17 | − 0.092 | * | |
TGFβ | 0.46 | *** | 0.17 | *** | 0.53 | *** | 0.33 | *** | |
T cell exhaustion | PD-1 | 0.082 | 0.54 | 0.011 | 0.82 | 0.069 | 0.63 | − 0.22 | *** |
CTLA4 | 0.032 | 0.81 | − 0.017 | 0.72 | − 0.092 | 0.53 | − 0.19 | *** | |
LAG3 | 0.057 | 0.67 | 0.017 | 0.71 | 0.21 | 0.14 | − 0.14 | ** | |
GZMB | − 0.17 | 0.21 | 0.084 | 0.063 | 0.66 | 0.063 | − 0.17 | *** | |