Table 1 Patient details. Characteristics of patients whose samples were used for NMR (n = 71), RNA-Seq (n = 46), and IHC (n = 46). Samples in the table are according to age, sex, node status, perineural invasion (PNI), and tumor grade. Y = yes; N = no.

From: Uracil as a biomarker for spatial pyrimidine metabolism in the development of gingivobuccal oral squamous cell carcinoma

Serial no

Age

Sex

Grade

Size (Maximum dimension) cm

PNI

No. of nodes

Tobacco use

Experiments

1

34

M

3

2.6

Y

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

2

39

M

2

6

N

0

Y

NMR

3

42

M

2

2.5

Y

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

4

42

M

1

5.3

N

0

Y

NMR

5

43

M

1

1

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

6

43

M

2

2.8

Y

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

7

44

M

2

3

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

8

44

M

2

1.9

Y

0

Y

NMR

9

44

M

1

1.6

N

0

Y

NMR

10

44

M

2

3

N

0

Y

NMR

11

45

M

2

5

Y

0

Y

NMR

12

45

M

2

2.8

N

0

Y

NMR

13

46

M

2

3

N

0

Y

NMR

14

47

M

3

2.6

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

15

47

M

3

3

N

0

Y

NMR

16

50

F

2

3.1

N

0

Y

NMR

17

52

F

2

0.7

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

18

52

F

2

3.4

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

19

52

F

3

2.2

Y

0

Y

NMR

20

52

M

2

2

N

0

Y

NMR

21

55

M

2

2.5

Y

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

22

56

M

1

8

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

23

57

M

2

2.2

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

24

58

M

2

6

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

25

58

M

2

3

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

26

58

M

2

10

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

27

58

F

2

5

N

0

Y

NMR

28

58

M

2

10

N

0

Y

NMR

29

59

M

1

3.5

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

30

59

M

2

3.5

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

31

60

F

1

2.3

N

0

Y

NMR

32

60

F

3

2.8

N

0

Y

NMR

33

61

M

2

6.2

N

0

Y

NMR

34

61

M

1

˂0.1

N

0

Y

NMR

35

61

F

2

3.5

N

0

Y

NMR

36

62

M

3

2.2

Y

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

37

63

M

2

1

N

0

Y

NMR

38

66

M

1

3.7

N

0

Y

NMR

39

66

M

2

1

N

0

Y

NMR

40

67

M

2

2.6

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

41

68

M

2

11

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

42

68

F

3

2.6

N

0

Y

NMR

43

68

M

2

11

N

0

Y

NMR

44

68

F

3

2.6

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

45

71

M

1

2.5

N

0

Y

NMR

46

72

M

3

1.8

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

47

75

M

2

2.5

Y

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

48

75

M

2

3

N

0

Y

NMR + IHC + RNAseq

49

50

M

2

5.3

Y

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

50

53

M

2

3.3

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

51

57

M

3

3.5

Y

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

52

60

M

2

2.5

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

53

62

M

2

3.9

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

54

64

M

2

3.6

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

55

64

M

3

1.6

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

56

71

F

2

3.2

Y

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

57

72

F

3

3.2

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

58

75

F

1

2.2

N

1

Y

NMR + IHC + RNAseq

59

61

M

2

4.8

Y

2

Y

NMR + IHC + RNAseq

60

65

M

2

5.2

Y

2

Y

NMR + IHC + RNAseq

61

65

M

1

5.1

N

2

Y

NMR + IHC + RNAseq

62

69

M

2

2.7

N

2

Y

NMR + IHC + RNAseq

63

45

M

2

3.5

Y

3

Y

NMR + IHC + RNAseq

64

49

M

3

5.2

Y

3

Y

NMR + IHC + RNAseq

65

71

M

3

3.2

Y

3

Y

NMR + IHC + RNAseq

66

35

M

2

5.5

Y

4

Y

NMR + IHC + RNAseq

67

59

F

3

4.3

N

4

Y

NMR + IHC + RNAseq

68

57

M

3

3.6

Y

5

Y

NMR + IHC + RNAseq

69

61

F

1

3.5

N

5

Y

NMR + IHC + RNAseq

70

64

F

2

3.5

N

6

Y

NMR + IHC + RNAseq

71

54

M

3

2.5

Y

21

Y

NMR + IHC + RNAseq