Table 1 Polymorphism analysis of 18 STR markers in four populations of Kazakh Tobet dogs.

From: Genetic diversity and origin of Kazakh Tobet Dogs

Pop

Locus

Na

Ne

Ho

uHe

uF

Pop1

AHTk211

6.00

3.63

0.62

0.73

0.15

 

CXX0279

10.00

5.61

0.79

0.83

0.04

 

REN169O18

11.00

5.72

0.81

0.83

0.02

 

INU055

9.00

4.99

0.85

0.81

-0.06

 

REN54P11

10.00

5.71

0.88

0.83

-0.06

 

INRA21

8.00

5.56

0.92

0.83

-0.12

 

AHT137

14.00

6.34

0.90

0.85

-0.07

 

REN169D01

11.00

6.31

0.93

0.85

-0.11

 

AHTh260

12.00

4.33

0.71

0.77

0.07

 

AHTk253

9.00

2.79

0.47

0.65

0.28

 

INU005

10.00

3.34

0.60

0.70

0.14

 

INU030

7.00

4.32

0.78

0.77

-0.02

 

FH2848

9.00

5.79

0.88

0.83

-0.06

 

AHT121

12.00

7.86

0.80

0.88

0.09

 

FH2054

12.00

6.56

0.77

0.85

0.10

 

REN162C04

13.00

6.15

0.83

0.84

0.00

 

AHTh171

12.00

8.17

0.88

0.88

0.00

 

REN247M23

9.00

4.37

0.69

0.78

0.11

 

Mean

10.22

5.42

0.78

0.81

0.03

(95% CI: -0.19–0.25)

 

SE

0.50

0.34

0.03

0.01

0.01

Pop2

AHTk211

5.00

4.30

0.81

0.79

-0.06

 

CXX0279

6.00

3.66

0.81

0.75

-0.12

 

REN169O18

6.00

4.70

0.88

0.81

-0.12

 

INU055

7.00

5.39

0.88

0.84

-0.08

 

REN54P11

7.00

4.03

0.94

0.78

-0.25

 

INRA21

6.00

3.97

0.63

0.77

0.17

 

AHT137

9.00

7.31

0.94

0.89

-0.09

 

REN169D01

8.00

5.07

0.88

0.83

-0.09

 

AHTh260

7.00

4.30

0.69

0.79

0.11

 

AHTk253

7.00

3.74

0.75

0.76

-0.02

 

INU005

7.00

4.10

0.63

0.78

0.18

 

INU030

5.00

4.20

0.63

0.79

0.19

 

FH2848

6.00

4.45

0.81

0.80

-0.05

 

AHT121

10.00

7.01

0.94

0.89

-0.10

 

FH2054

9.00

5.33

0.81

0.84

0.00

 

REN162C04

8.00

4.53

0.75

0.80

0.04

 

AHTh171

8.00

3.58

0.75

0.74

-0.04

 

REN247M23

5.00

2.93

0.63

0.68

0.05

 

Mean

7.00

4.59

0.79

0.80

-0.02

(95% CI: -0.07–0.04)

 

SE

0.34

0.26

0.03

0.01

0.03

Pop3

AHTk211

4.00

3.05

0.38

0.72

0.47

 

CXX0279

6.00

5.12

0.88

0.86

-0.09

 

REN169O18

5.00

3.56

0.88

0.77

-0.23

 

INU055

5.00

3.88

0.75

0.79

-0.01

 

REN54P11

6.00

4.41

0.75

0.83

0.03

 

INRA21

6.00

4.74

1.00

0.84

-0.29

 

AHT137

6.00

4.92

1.00

0.85

-0.27

 

REN169D01

8.00

5.82

0.88

0.88

-0.06

 

AHTh260

8.00

6.40

0.75

0.90

0.12

 

AHTk253

8.00

6.40

0.88

0.90

-0.04

 

INU005

6.00

3.20

0.63

0.73

0.10

 

INU030

6.00

4.41

0.88

0.83

-0.14

 

FH2848

5.00

4.74

0.75

0.84

0.05

 

AHT121

7.00

5.33

0.75

0.87

0.08

 

FH2054

6.00

5.12

0.88

0.86

-0.09

 

REN162C04

6.00

4.27

0.63

0.82

0.20

 

AHTh171

6.00

4.13

0.63

0.81

0.19

 

REN247M23

6.00

3.77

0.50

0.78

0.34

 

Mean

6.11

4.63

0.76

0.83

0.02

(95% CI: -0.12–0.16)

 

SE

0.25

0.23

0.04

0.01

0.07

Pop4

AHTk211

5.00

3.70

0.90

0.77

-0.25

 

CXX0279

7.00

2.94

0.90

0.69

-0.38

 

REN169O18

5.00

4.08

0.90

0.79

-0.20

 

INU055

6.00

4.00

0.60

0.79

0.21

 

REN54P11

5.00

3.45

0.50

0.75

0.31

 

INRA21

6.00

5.00

0.80

0.84

0.00

 

AHT137

9.00

6.45

0.90

0.89

-0.07

 

REN169D01

8.00

5.71

0.90

0.87

-0.10

 

AHTh260

6.00

3.70

0.90

0.77

-0.25

 

AHTk253

3.00

1.50

0.20

0.35

0.42

 

INU005

4.00

2.67

0.70

0.66

-0.13

 

INU030

5.00

4.17

0.90

0.80

-0.19

 

FH2848

7.00

4.76

0.90

0.83

-0.15

 

AHT121

7.00

5.41

0.80

0.86

0.02

 

FH2054

7.00

4.00

0.30

0.79

0.63

 

REN162C04

6.00

4.35

0.90

0.81

-0.18

 

AHTh171

6.00

3.57

1.00

0.76

-0.41

 

REN247M23

6.00

5.13

0.90

0.85

-0.12

 

Mean

6.00

4.14

0.77

0.77

-0.05

(95% CI: -0.22–0.13)

 

SE

0.33

0.28

0.05

0.03

0.09

All

AHTk211

6.00

3.81

0.65

0.74

0.11

 

CXX0279

11.00

5.34

0.81

0.82

0.00

 

REN169O18

11.00

5.63

0.83

0.83

-0.01

 

INU055

10.00

5.11

0.82

0.81

-0.02

 

REN54P11

10.00

5.52

0.84

0.82

-0.03

 

INRA21

8.00

5.41

0.87

0.82

-0.07

 

AHT137

14.00

7.20

0.92

0.87

-0.06

 

REN169D01

11.00

6.44

0.92

0.85

-0.08

 

AHTh260

13.00

4.73

0.73

0.79

0.08

 

AHTk253

11.00

3.09

0.51

0.68

0.24

 

INU005

10.00

3.43

0.62

0.71

0.13

 

INU030

7.00

4.50

0.78

0.78

0.00

 

FH2848

9.00

5.94

0.86

0.84

-0.03

 

AHT121

12.00

8.26

0.81

0.88

0.08

 

FH2054

13.00

6.58

0.74

0.85

0.13

 

REN162C04

15.00

6.29

0.81

0.85

0.04

 

AHTh171

12.00

6.90

0.85

0.86

0.01

 

REN247M23

10.00

4.23

0.68

0.77

0.11

 

Mean

10.72

5.47

0.78

0.81

0.03

(95% CI: 0.02–0.05)

 

SE

0.55

0.32

0.03

0.01

0.01

  1. Na Average alleles/locus, Ne Average effective alleles/locus, Ho Observed heterozygosity, uHe Unbiased expected heterozygosity, F Unbiased fixation index.