Table 2 PCR conditions for the amplification of target fragments of genes.
Pathogen | Target gene | Thermal Profile |
|---|---|---|
Borrelia theileri | Flagellin (flaB) gene | (95 °C)/(5 min) → [(94 °C)/(30 s)-(55 °C)/(30 s)-(72 °C)/30 s] 40 × → (72 °C)/(5 min) → 10 °C → ∞ (95 °C)/(5 min) → [(94 °C)/(30 s)-(55 °C)/(30 s)-(72 °C)/30 s] 40 × → (72 °C)/(5 min) → 10 °C → ∞ |
Rickettsia aeschlimannii | Citrate synthase (gltA) gene | (95 °C)/(10 min) → [(94 °C)/(30 s)-(52 °C)/(30 s)-(72 °C)/90 s] 30 × → (72 °C)/(5 min) → 10 °C → ∞ (95 °C)/(5 min) → [(94 °C)/(30 s)-(52 °C)/(30 s)-(72 °C)/30 s] 30 × → (72 °C)/(5 min) → 10 °C → ∞ |
Mycoplasma species | 16S rRNA | (95 °C)/(5 min) → [(95 °C)/(30 s)-(60 °C)/(30 s)-(72 °C)/30 s] 40 × → (72 °C)/(10 min) → 10 °C → ∞ |
