Table 1 Metabolic universe: Using VirtualMicrobes, we generated an artificial biochemistry comprised of 9 metabolites, 8 importers, 8 exporters and 43 conversion reactions, with two non-substitutable building blocks and a single energy molecule.

R

Resource

0.011

0.0003

0.077

9

0.002

B1

Building block

0.011

0.0100

0.058

8

0

B2

Building block

0.012

0.0100

0.103

8

0

E

Energy carrier

0.050

0.1000

0.065

1

0

M1

–

0.014

0.0006

0.105

6

0

M2

–

0.019

0.0003

0.080

4

0

M3

–

0.013

0.0006

0.079

7

0

M4

–

0.014

0.0014

0.158

6

0

M5

–

0.016

0.0008

0.047

5

0

R  →  B2 + E

B1  →  M4 + 2 E

M1  →  M2 + 2 E

M2 + M5  →  B1

M3 + M5  →  R

R  →  B1 + E

B1  →  M5 + 3 E

M2 + M3  →  B1

M2 + M5  →  M1

M3  →  M5 + 2 E

R  →  M1 + 3 E

B2  →  M1 + 2 E

M2 + M3  →  B2

2 M1  →  R

M3  →  M4 + E

R  →  M2 + 5 E

B2  →  M2 + 4 E

M2 + M5  →  M4

2 M2  →  M1

M4  →  M2 + 2 E

R  →  M4 + 3 E

B2  →  M3 + E

M2 + M4  →  M3

2 M2  →  B1

M4 + M5  →  B2

R  →  M5 + 4 E

B2  →  M4 + 2 E

M2 + M5  →  M3

2 M2  →  B2

M4 + M5  →  R

R  →  M3 + 2 E

B2  →  M5 + 3 E

M2 + M4  →  B2

2 M2  →  M4

M4 + M5  →  B1

B1  →  M1 + 2 E

M1 + M4  →  R

M2 + M5  →  B2

2 M2  →  M5

M5  →  M2 + E

B1  →  M2 + 4 E

M1 + M2  →  M3

M2 + M5  →  R