Table 2 Summary of the morphological features computed for each species and cell type

From: Decoding gray matter, large-scale analysis of brain cell morphometry to inform microstructural modeling of diffusion MR signals

  

N

Rdomain

Nproj

BO

S/Vdomain(μm−1)

S/Vsoma(μm−1)

Rsoma(μm)

RMRsoma(μm)

ηsoma(%)

S/Vbranch(μm−1)

Lbranch(μm)

Rbranch(μm)

CVbranch

RMRbranch(μm)

μODbranch

Rc(μm)

Ï„branch

Celltype

Animal

 

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

 

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

  

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

Q1

median

Q3

 

MouseRat

4100 (4072)

33

41

49

3

5

6

3.7

7.3

9.5

2.6

3.3

3.6

0.10

1.3

2.0

1.6

2.5

3.1

3.5

4

48

99

2.3

3.4

6.2

6.4

7.4

9.8

0.67

1.0

1.6

0.58

1.0

0.19

0.2

0.25

3.4

3.9

7.5

0.77

0.81

0.82

Microglia

Monkey

60 (60)

37

42

47

7

8

9

3.3

3.8

4.1

2.9

3.9

4.9

1

1.2

1.3

2.3

2.6

3.0

3

0.7

1.1

1.6

15

17

18

8.9

9.4

9.9

0.18

0.2

0.36

0.63

0.2

0.25

0.27

0.29

13

16

18

0.73

0.74

0.75

 

Human

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

MouseRat

310 (307)

32

39

45

5

7

12

3.1

4

10

0.37

4.1

5.5

0.8

0.9

1.2

2.5

3.5

4.0

4.3

3

27

70

4.2

6.7

8.8

6.5

7.8

9.3

0.46

0.78

1.6

0.93

0.54

0.21

0.27

0.3

5.1

9.6

14

0.66

0.69

0.72

Astrocyte

Monkey

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

Human

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

MouseRat

58 (58)

85

100

130

5

7

9

6.7

7.5

8.4

2.8

3

3.1

0.61

0.74

0.90

3.4

4.1

5.0

5

4

7

13

3.9

4.8

5.5

22

28

32

0.57

0.82

1.3

1.20

0.64

0.15

0.16

0.21

21

27

34

0.77

0.81

0.83

Oligodendrocyte

Monkey

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

Human

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

MouseRat

3005 (3000)

170

290

490

4

6

7

4.7

6.9

9

0.34

0.34

0.86

0.35

0.45

0.7

4.4

6.7

8.8

11

1

3

10

3.2

4.6

7.4

37

52

72

0.48

0.84

1.3

0.63

0.99

0.17

0.23

0.29

14

26

41

0.76

0.8

0.84

Pyramidal

Monkey

510 (508)

250

370

630

6

7

9

3.8

4.4

5.1

2.5

2.9

3.3

0.37

0.43

0.5

6.1

7.2

8.3

8.5

0.2

3.2

8.1

4.5

6.3

9.9

53

62

72

0.44

0.69

1.2

0.74

0.79

0.18

0.22

0.29

22

39

54

0.75

0.8

0.83

 

Human

2403 (2400)

230

270

310

5

6

7

2.9

3.1

3.6

3

3.3

3.5

0.32

0.37

0.42

7.2

8.3

9.4

9.7

4.6

6.9

9.6

4.1

5.2

6.6

64

74

86

0.61

0.69

1.2

0.58

0.88

0.24

0.27

0.3

49

63

79

0.72

0.75

0.78

 

MouseRat

930 (928)

100

160

230

1

1

1

2.5

3.1

3.6

1.6

2

2.7

0.64

0.73

0.85

3.6

4.2

4.8

5.1

1.0

1.8

3.8

3.2

4.1

5.7

27

45

78

0.63

0.93

1.3

0.45

0.78

0.12

0.16

0.21

23

35

56

0.8

0.84

0.87

Granule

Monkey

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

Human

82 (82)

460

530

580

2

3

4

2.7

3.1

3.6

2.1

2.6

3.3

0.41

0.77

1.0

3.1

4.0

7.4

7.9

4

8

15

3.6

4.2

4.5

110

130

150

0.53

0.64

0.75

0.49

0.76

0.18

0.20

0.24

15

18

23

0.83

0.85

0.87

 

MouseRat

140 (140)

130

160

190

1

2

2

9.3

10

12

2.2

2.5

2.7

0.36

0.41

0.46

6.6

7.4

8.3

8.3

2

26

33

3.4

4.3

5.3

8.9

9.9

11

0.76

0.99

1.4

0.22

0.7

0.25

0.28

0.31

17

25

32

0.73

0.78

0.81

Purkinje

Monkey

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

Human

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

MouseRat

441 (440)

190

240

300

4

5

7

2.4

3.2

4.5

1.5

2.0

2.7

0.39

0.51

0.66

4.6

5.9

7.8

9.1

1

3

38

2.7

4.0

5.6

50

64

81

0.49

0.61

0.94

0.77

0.93

0.22

0.27

0.33

11

23

45

0.73

0.77

0.81

Basket

Monkey

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

Human

11 (11)

220

270

380

4

5

6

2.3

3.3

4.5

3

3

3.2

0.56

0.58

0.67

4.6

5.2

5.4

5.6

7

8

45

3.4

4

4.6

51

62

110

0.92

0.95

1.5

0.49

0.67

0.21

0.23

0.27

14

16

22

0.77

0.79

0.82

 

MouseRat

180 (179)

180

250

440

4

6

8

2.9

3.7

4.6

1.8

2.4

3

0.38

0.47

0.53

5.7

6.5

8.1

8.3

1

1.5

4.8

4.3

6.1

13

35

46

65

0.34

0.67

1.2

0.80

0.67

0.22

0.29

0.33

9.8

15

50

0.73

0.78

0.81

Gabaergic

Monkey

4 (4)

120

250

370

6

7.5

10

2.2

2.7

3.1

2.6

3.2

3.6

0.55

0.62

0.68

4.7

5.1

5.8

5.5

0.27

0.27

0.27

4.9

5.5

6.7

35

67

120

0.72

0.76

0.93

0.51

0.44

0.3

0.34

0.37

2.1

2.3

2.5

0.7

0.72

0.76

 

Human

6 (6)

140

190

220

2

3

5

2.2

2.8

3.5

4

4.1

4.5

0.67

0.69

0.72

4.2

4.5

4.6

4.5

0.38

0.75

0.9

7.5

7.8

8

63

65

83

0.48

0.5

0.67

0.57

0.38

0.28

0.30

0.33

13

17

27

0.73

0.74

0.74

 

MouseRat

106 (106)

150

250

360

3

5

7

2.2

2.8

3.5

1.2

2.7

2.3

0.34

0.42

0.50

6.1

7.3

9.0

9.7

1

1.8

7.2

3.9

5.1

20

42

54

72

0.21

0.63

0.80

0.73

0.98

0.21

0.27

0.34

20

27

56

0.71

0.81

0.84

Glutamatergic

Monkey

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

 

Human

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

n.a

  1. N is the number of cellular structures investigated with complete information about the neurite structure; same information for soma in brackets. The reported values are mean  ± s.d. over the corresponding sample. The ‘≥’ and ‘≤’ are used when the estimated value of the corresponding feature may be slightly (on average < 20%) under- or over-estimated, respectively, given the known limitations of the approach used. n.a. not available.
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