Table 1 LASSO analysis of MreB’s role in modulating cylindrical uniformity

Symbol^a	Strain 1	Strain 2	Predicted shape change^b	Observed shape change^c
Training
□	ΔrodZ	WT	0.109	0.101
□	ΔrodZ + rodZ	WT	−0.022	0.000
∇	ΔrodZ + rodZ_59-337	ΔrodZ + rodZ	0.036	0.051
∇	ΔrodZ + rodZ_70-337	ΔrodZ + rodZ	0.082	0.076
∇	ΔrodZ + rodZ_83-337	ΔrodZ + rodZ	0.059	0.073
∆	ΔrodZ + rodZ_1-155	ΔrodZ + rodZ	0.012	0.005
∆	ΔrodZ + rodZ_1-142	ΔrodZ + rodZ	0.040	0.045
∆	ΔrodZ + rodZ_1-111	ΔrodZ + rodZ	0.077	0.070
□	ΔrodZ + pTrc99A	WT	0.071	0.098
∇	ΔrodZ + rodZ_59-337	ΔrodZ + pTrc99A	−0.062	−0.047
∇	ΔrodZ + rodZ_70-337	ΔrodZ + pTrc99A	−0.016	−0.022
∇	ΔrodZ + rodZ_83-337	ΔrodZ + pTrc99A	−0.039	−0.025
∆	ΔrodZ + rodZ_1-155	ΔrodZ + pTrc99A	−0.086	−0.093
∆	ΔrodZ + rodZ_1-142	ΔrodZ + pTrc99A	−0.057	−0.053
∆	ΔrodZ + rodZ_1-111	ΔrodZ + pTrc99A	−0.020	−0.028
□	MreB_S14A	WT	0.020	0.013
□	MreB_E143A	WT	0.017	0.007
□	MreB_Y183N	WT	0.075	0.120
□	MreB_S14A ΔrodZ	MreB_S14A	0.028	0.012
□	MreB_E143A ΔrodZ	MreB_E143A	0.072	0.053
Testing
•	MreB_E143A ΔrodZ + pTrc99A	MreB_E143A ΔrodZ + MreB_E143A	0.027	0.045

^aSymbols used in Fig. 4 to show the different types of genetic perturbations included in the regression
^bPredicted change in cell shape (ΔIDD = IDD_strain1 − IDD_strain2) is predicted from the regression model
^cObserved change in cell shape is from 3D measurements of cells

Quick links

Search