Table 4 The information on the relative abundance differences of the top 30 species/genus in the cecal contents between the two groups

From: Microbiota-host crosstalk: the role of short-term dietary restriction in neurological and metabolic dysregulation

Categories	Name	Re1	Re2	Re3	Re4	Re5	Re6	Co1	Co2	Co3	Co4	Co5	Co6	p-value	Significance
Species	Alistipes_indistinctus	0.0003	0.0008	0.0005	0.0005	0.0007	0.0012	0.0018	0.0012	0.0011	0.0012	0.0010	0.0016	0.0070	**
	Bacteroidales_bacterium	0.0147	0.0255	0.0148	0.0264	0.0309	0.0208	0.0371	0.0518	0.0334	0.0407	0.0190	0.0676	0.0346	*
	Bacillus_sp._CAG:988	0.0004	0.0004	0.0006	0.0004	0.0005	0.0005	0.0003	0.0002	0.0003	0.0003	0.0001	0.0004	0.0056	**
	Bacteroides_acidifaciens	0.0002	0.0002	0.0003	0.0004	0.0003	0.0003	0.0005	0.0006	0.0004	0.0004	0.0003	0.0007	0.0398	*
	Bacteroides_ovatus	0.0004	0.0007	0.0005	0.0011	0.0007	0.0008	0.0011	0.0011	0.0009	0.0010	0.0007	0.0014	0.0324	*
	Clostridiaceae_bacterium	0.0068	0.0061	0.0068	0.0064	0.0061	0.0066	0.0053	0.0063	0.0064	0.0058	0.0059	0.0052	0.0225	*
	Clostridium_perfringens	0.0005	0.0004	0.0005	0.0004	0.0004	0.0004	0.0004	0.0003	0.0004	0.0004	0.0002	0.0003	0.0387	*
	Clostridium_sp._CAG:417	0.0007	0.0007	0.0010	0.0005	0.0007	0.0008	0.0006	0.0004	0.0005	0.0006	0.0002	0.0006	0.0487	*
	Clostridium_sp._CAG:451	0.0005	0.0005	0.0007	0.0003	0.0004	0.0005	0.0004	0.0003	0.0004	0.0004	0.0001	0.0005	0.0377	*
	Clostridium_sp._CAG:452	0.0014	0.0014	0.0025	0.0008	0.0031	0.0011	0.0009	0.0010	0.0008	0.0006	0.0003	0.0007	0.0379	*
	Clostridium_sp._CAG:571	0.0008	0.0005	0.0012	0.0006	0.0005	0.0006	0.0006	0.0003	0.0004	0.0005	0.0002	0.0006	0.0290	*
	Clostridium_sp._CAG:710	0.0020	0.0017	0.0034	0.0015	0.0017	0.0028	0.0010	0.0011	0.0014	0.0015	0.0004	0.0018	0.0250	*
	Clostridium_sp._CAG:780	0.0007	0.0008	0.0010	0.0006	0.0006	0.0005	0.0006	0.0003	0.0005	0.0005	0.0002	0.0005	0.0224	*
	Duncaniella_freteri	0.0008	0.0006	0.0008	0.0006	0.0005	0.0005	0.0015	0.0012	0.0010	0.0011	0.0009	0.0019	0.0081	**
	Firmicutes_bacterium_CAG:103	0.0005	0.0006	0.0005	0.0006	0.0007	0.0006	0.0004	0.0005	0.0005	0.0004	0.0005	0.0003	0.0238	*
	Firmicutes_bacterium_CAG:555	0.0004	0.0005	0.0004	0.0005	0.0006	0.0005	0.0003	0.0005	0.0003	0.0004	0.0004	0.0003	0.0353	*
	Flavobacteriales_bacterium	0.0001	0.0004	0.0002	0.0001	0.0001	0.0002	0.0012	0.0016	0.0021	0.0016	0.0000	0.0016	0.0088	**
	Methanobacteriaceae_archaeon	0.0005	0.0003	0.0010	0.0003	0.0005	0.0013	0.0000	0.0002	0.0002	0.0000	0.0000	0.0000	0.0216	*
	Parasutterella_excrementihominis	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0005	0.0005	0.0007	0.0014	0.0005	0.0003	0.0008	0.0404	*
	Parasutterella_sp._NM82_D38	0.0002	0.0003	0.0002	0.0003	0.0003	0.0007	0.0007	0.0009	0.0018	0.0006	0.0004	0.0010	0.0397	*
	Prevotella_copri	0.0002	0.0003	0.0002	0.0005	0.0003	0.0004	0.0005	0.0008	0.0006	0.0005	0.0003	0.0009	0.0382	*
	Roseburia_inulinivorans	0.0005	0.0004	0.0004	0.0004	0.0005	0.0004	0.0004	0.0005	0.0005	0.0004	0.0005	0.0005	0.0312	*
	Ruminococcaceae_bacterium_FB2012	0.0008	0.0007	0.0010	0.0009	0.0006	0.0008	0.0007	0.0006	0.0005	0.0007	0.0007	0.0005	0.0123	*
	Ruminococcus_sp._CAG:579	0.0005	0.0005	0.0007	0.0005	0.0005	0.0005	0.0004	0.0003	0.0004	0.0004	0.0004	0.0003	0.0027	**
	Ruminococcus_sp._NK3A76	0.0007	0.0007	0.0009	0.0008	0.0006	0.0007	0.0007	0.0005	0.0005	0.0006	0.0007	0.0004	0.0184	*
	Ruminococcus_sp._YE71	0.0005	0.0004	0.0006	0.0006	0.0004	0.0004	0.0005	0.0004	0.0004	0.0004	0.0004	0.0003	0.0275	*
	Parabacteroides_sp._ZJ-118	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0002	0.0003	0.0003	0.0007	0.0004	0.0004	0.0003	0.0006	0.0181	*
	Muribaculaceae_bacterium_Isolate-036_(Harlan)	0.0001	0.0002	0.0001	0.0003	0.0003	0.0002	0.0004	0.0006	0.0003	0.0004	0.0002	0.0008	0.0451	*
	Firmicutes_bacterium_HGW-Firmicutes-16	0.0004	0.0004	0.0003	0.0004	0.0005	0.0004	0.0002	0.0004	0.0003	0.0003	0.0003	0.0002	0.0203	*
	Ruminococcus_sp._Marseille-P6503	0.0018	0.0013	0.0017	0.0017	0.0011	0.0014	0.0013	0.0009	0.0008	0.0011	0.0012	0.0008	0.0073	**
Genus	Acetobacterium	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0015	**
	Erysipelothrix	0.0001	0.0001	0.0002	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0026	**
	Streptomyces	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0002	0.0001	0.0002	0.0001	0.0002	0.0035	**
	Faecalicatena	0.0005	0.0004	0.0004	0.0005	0.0005	0.0006	0.0007	0.0007	0.0006	0.0006	0.0005	0.0007	0.0038	**
	Listeria	0.0003	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0003	0.0003	0.0003	0.0050	**
	Anaerofustis	0.0003	0.0002	0.0003	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0087	**
	Pseudomonas	0.0001	0.0001	0.0002	0.0001	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0104	*
	Bacillus	0.0016	0.0014	0.0018	0.0013	0.0014	0.0015	0.0013	0.0011	0.0014	0.0014	0.0011	0.0012	0.0117	*
	Amedibacillus	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0126	*
	Dysgonomonas	0.0002	0.0002	0.0001	0.0002	0.0002	0.0002	0.0004	0.0003	0.0003	0.0002	0.0005	0.0003	0.0131	*
	Desulfotomaculum	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0153	*
	Thermoclostridium	0.0001	0.0002	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0174	*
	Coprobacillus	0.0010	0.0010	0.0011	0.0007	0.0011	0.0009	0.0007	0.0006	0.0007	0.0010	0.0005	0.0008	0.0210	*
	Methanobrevibacter	0.0008	0.0006	0.0017	0.0005	0.0008	0.0022	0.0001	0.0003	0.0005	0.0001	0.0001	0.0001	0.0220	*
	Sarcina	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0001	0.0227	*
	Monoglobus	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0001	0.0230	*
	Sharpea	0.0003	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0001	0.0002	0.0265	*
	Massilimicrobiota	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0001	0.0002	0.0269	*
	Roseburia	0.0052	0.0044	0.0041	0.0038	0.0053	0.0040	0.0062	0.0056	0.0078	0.0038	0.0065	0.0068	0.0313	*
	Prevotella	0.0027	0.0039	0.0029	0.0049	0.0037	0.0040	0.0066	0.0076	0.0063	0.0050	0.0031	0.0097	0.0317	*
	Clostridium	0.0452	0.0390	0.0587	0.0374	0.0473	0.0374	0.0368	0.0316	0.0344	0.0365	0.0291	0.0376	0.0320	*
	Kineothrix	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0399	*
	Parasutterella	0.0004	0.0005	0.0005	0.0006	0.0006	0.0013	0.0013	0.0017	0.0034	0.0011	0.0008	0.0019	0.0408	*
	Eggerthella	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0003	0.0003	0.0003	0.0004	0.0003	0.0003	0.0002	0.0412	*
	Streptococcus	0.0012	0.0010	0.0011	0.0010	0.0010	0.0011	0.0010	0.0010	0.0011	0.0010	0.0009	0.0009	0.0446	*
	Turicimonas	0.0001	0.0001	0.0001	0.0001	0.0002	0.0003	0.0003	0.0004	0.0009	0.0003	0.0002	0.0005	0.0462	*
	Coprobacter	0.0005	0.0007	0.0003	0.0007	0.0006	0.0006	0.0012	0.0008	0.0008	0.0006	0.0007	0.0007	0.0462	*
	Ruminococcus	0.0271	0.0292	0.0288	0.0255	0.0207	0.0214	0.0238	0.0231	0.0196	0.0210	0.0211	0.0202	0.0463	*
	Fibrobacter	0.0006	0.0005	0.0006	0.0005	0.0005	0.0005	0.0007	0.0006	0.0006	0.0005	0.0005	0.0007	0.0475	*
	Sutterella	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0002	0.0004	0.0004	0.0004	0.0007	0.0003	0.0002	0.0004	0.0402	*

In the table, “p-value” shows the statistical significance of the correlation, and “Significance” indicates the level of statistical significance, where “*” denotes p < 0.05, and “**” denotes p < 0.01. All the data were recorded with an accuracy of 0.0001.

Back to article page

Table 4 The information on the relative abundance differences of the top 30 species/genus in the cecal contents between the two groups

Search

Quick links