Table 3 Salient features of predicted genomic islands of NASM strains.

From: Genome sequencing and comparative genomic analysis of bovine mastitis-associated non-aureus staphylococci and mammaliicocci (NASM) strains from India

S.No.

NASM strains

Number of Islands

Number of genes in GIs

No. of genes coding for hypothetical Proteins

Virulence & and antimicrobial resistance genes in genomic islands

1

M. lentus K169

3

90

69

fosB 2

2

M. sciuri K117.2

6

148

79

fosB, cadC, yyc (walR/K)

3

M. sciuri K14

5

100

58

 

4

M. sciuri K91

5

120

68

fosB, cadC, yyc (walR/K)

5

S. chromogenes K17

4

115

88

yyc (walR/K)

6

S. chromogenes K23

3

85

73

 

7

S. chromogenes K26

5

132

86

yyc (walR/K)

8

S. chromogenes K29

3

97

81

lip

9

S. epidermidis K16.1

5

88

68

cadC, yyc (walR/K)

10

S. epidermidis K3.2

4

109

56

ebh, blaZ, msr, qacA, qacR, yyc (walR/K)

11

S. epidermidis K4.3

7

150

87

blaZ, msr, ssaA, yyc (walR/K)

12

S. epidermidis K60

8

139

95

cadC, yyc (walR/K)

13

S. gallinarium B13

9

163

103

 

14

S. haemolyticus A11

5

131

73

blaZ, cadC, farB, yyc (walR/K)

15

S. haemolyticus A3.2

5

132

74

blaZ, cadC, farB, arsR, yyc (walR/K)

16

S. haemolyticus K16.2

7

114

48

blaZ, msr, qacC, cadC, farB, yyc (walR/K)

17

S. haemolyticus K47

7

118

53

blaZ, msr, cadC, yyc (walR/K)

18

S. hominis K24

6

186

115

ebh, yyc (walR/K)

19

S. pseudintermedius B32

7

250

163

spa, lip, msr, ssaA, yyc (walR/K)

20

S. xylosus K19

5

164

83

lip, yyc (walR/K)

21

S. xylosus K46

4

137

70

yyc (walR/K)

22

S. xylosus SMG24

7

193

116

cadC