Table 4 Genetic analysis of ORF2 gene of Thai FeAstV compared to reference FeAstV lineages.

From: Monitoring and characterization of canine and feline astroviruses in domestic dogs and cats in Thailand

Virus strain

Accession No.

Country

Year

Group

ORF 2 gene of FeAstV

     

450

471

472

525

549

594

595

596

597

649

Reference Strain

             

163 F

KF499111

Hong Kong

2012

2

H

G

N

Del

Del

Del

Del

Del

Del

G

Viseu

KF374704

Portugal

2012

2

F

G

N

Del

Del

Del

Del

Del

Del

V

FAstV-D2

KM017742

USA

2012

2

F

G

N

Del

Del

Del

Del

Del

Del

V

FAstV-D3

KM017743

USA

2013

2

F

G

N

Del

Del

Del

Del

Del

Del

V

Bristol

AF056197

UK

1987

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

TigAstV-CS-2018

MN148428

China

2018

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

A

Del

MAV2/17JL0318/2017

MK671308

China

2017

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

MAV2/17HRB0511/2017

MK671307

China

2017

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

MAV2/18CC0502/2018

MK671310

China

2018

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

FPV-1

ON595824

Japan

2017

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

G

Del

FPV-10

ON595831

Japan

2017

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

G

Del

This study

            

Del

THA-FeAstV/CU28799/2022

 

Thailand

2022

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU30863/2022

 

Thailand

2022

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU31863/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU32583/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU32639/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

T

Del

THA-FeAstV/CU33010/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU33012/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU33183/2323

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU33812/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU34594/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

A

Del

THA-FeAstV/CU34901/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del

THA-FeAstV/CU34912/2023

 

Thailand

2023

1

Del

Del

Del

H

Y

Y

T

I

S

Del