Table 2 List of forward and reverse primers used to perform qRT-PCR for the listed genes
From: Micro Immune Response On-chip (MIRO) models the tumour-stroma interface for immunotherapy testing
Gene | Forward primer | Reverse primer |
|---|---|---|
ITGAM | 5′-ACTTGCAGTGAGAACACGTATG-3′ | 5′-TCATCCGCCGAAAGTCATGTG-3′ |
ITGAL | 5′-TGCTTATCATCATCACGGATGG-3′ | R 5′-CTCTCCTTGGTCTGAAAATGCT-3′ |
ACTA2 | 5′-GTGTTGCCCCTGAAGAGCAT-3′ | 5′-GCTGGGACATTGAAAGTCTCA-3′ |
PDGFRB | 5′-AGACACGGGAGAATACTTTTGC-3′ | 5′-AGTTCCTCGGCATCATTAGGG-3′ |
PDGFRA | 5′-TTGAAGGCAGGCACATTTACA-3′ | 5′-GCGACAAGGTATAATGGCAGAA-3′ |
FSP1 | 5′-GGGCAAAGAGGGTGACAAGTT-3′ | 5′-ACCTCGTTGTCCCTGTTGCT-3′ |
FAP | 5′-CAGTGTATCGAAAGCTGGGTGTT-3′ | 5′-CAGATGCAAGGGCCAGTGAT-3′ |
PDPN | 5′-CCGCTATAAGTCTGGCTTGACA-3′ | 5′-TGTGGCGCTTGGACTTTGT-3′ |
LRRC15 | 5′-CGTTGCTGTTCCAAGCGTCCAT-3′ | 5′-GCTCAGTGGTAGAAGAGACGGA-3′ |
COL4A2 | 5′-TCCCTAGCAAAAGGTGCCAG-3′ | 5′-GTCTCCGATGAAGCCCTTG-3′ |
COL4A1 | 5′-GGGATGCTGTTGAAAGGTGAA-3′ | 5′-GGTGGTCCGGTAAATCCTGG-3′ |
COL1A1 | 5′-TGCGATGACGTGATCTGTGA-3′ | 5′-CGGTGGTTTCTTGGTCGGT-3′ |
TNC | 5′-GCCCCTGATGTTAAGGAGCTG-3′ | 5′-GGCCTCGAAGGTGACAGTT-3′ |
LAMB2 | 5′-GCGGACTTGTTCTGAGTGCCAA-3′ | 5′-ACCTGTGAAGCGGTGACACTGA-3′ |
LAMC1 | 5′-CTGTGAGGTCAACCACTTTGGG-3′ | 5′-AGCCTTCTCTGCATTCACAGCG-3′ |
ASPN | 5′-CCACCAACTTTATTGGAGCTTCAC-3′ | 5′-CGTGGTATGTTAGCAAGACTCCC-3′ |
COL1A2 | 5′-GGCCCTCAAGGTTTCCAAG-3′ | 5′-CACCCTGTGGTCCAACAACT-3′ |
FN1 | 5′-CGGTGGCTGTCAGTCAAAG-3′ | 5′-AAACCTCGGCTTCCTCCATAA-3′ |
LAMB1 | 5′-GAGGTGTCTCAAGTGCCTGTAC-3′ | 5′-ACTGGCAGTCAGAGCCGTTACA-3′ |
COMP | 5′-GACGTCAACGAGTGCAACG-3′ | 5′-TATGTTGCCCGGTCTCACAC-3′ |
LAMA2 | 5′-GGCAATCTGAATACACTCGTGAC-3′ | 5′-TGTGTTGGTCCTCTCAGCATCC-3′ |
COL10A1 | 5′-CATAAAAGGCCCACTACCCAAC-3′ | 5′-ACCTTGCTCTCCTCTTACTGCT-3′ |
COL11A1 | 5′-TAGCACAGACGGAGGCAAAC-3′ | 5′-AGAAGATCAGAATCCCTGCCG-3′ |
LAMA3 | 5′-TAGAGGAAGCCTCTGACACAGG-3′ | 5′-CCGATAGTATCCAGGGCTACAAC-3′ |
LAMC2 | 5′-TACAGAGCTGGAAGGCAGGATG-3′ | 5′-GTTCTCTTGGCTCCTCACCTTG-3′ |
